More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0179 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1345  argininosuccinate synthase  85.86 
 
 		 404 aa  728    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000339578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0179  argininosuccinate synthase  100 
 
 		 405 aa  824    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0571  argininosuccinate synthase  76.83 
 
 		 401 aa  630  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0795  argininosuccinate synthase  76.63 
 
 		 401 aa  624  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0277  argininosuccinate synthase  74.75 
 
 		 401 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0663  argininosuccinate synthase  69.98 
 
 		 410 aa  593  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2285  argininosuccinate synthase  72.61 
 
 		 408 aa  593  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1049  argininosuccinate synthase  70 
 
 		 407 aa  591  1e-168  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1249  argininosuccinate synthase  71.72 
 
 		 403 aa  590  1e-167  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000123934  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  67.93 
 
 		 1496 aa  576  1.0000000000000001e-163  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0683  argininosuccinate synthase  68.58 
 
 		 403 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0344  argininosuccinate synthase  67.84 
 
 		 399 aa  551  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4058  argininosuccinate synthase  64.62 
 
 		 407 aa  541  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3356  argininosuccinate synthase  63.59 
 
 		 402 aa  534  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1828  argininosuccinate synthase  63.87 
 
 		 399 aa  531  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1931  argininosuccinate synthase  62.81 
 
 		 407 aa  522  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00337254  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2270  argininosuccinate synthase  62.81 
 
 		 399 aa  521  1e-147  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4140  argininosuccinate synthase  61.48 
 
 		 403 aa  509  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0247  argininosuccinate synthase  60.4 
 
 		 403 aa  499  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1729  argininosuccinate synthase  60.55 
 
 		 407 aa  496  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.57009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4158  argininosuccinate synthase  59.2 
 
 		 405 aa  491  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0852735  normal  0.163205 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0923  argininosuccinate synthase  59.75 
 
 		 404 aa  491  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.909799  hitchhiker  0.00000000000000121809 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2531  argininosuccinate synthase  58.97 
 
 		 400 aa  481  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00599814  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2361  argininosuccinate synthase  59.7 
 
 		 397 aa  474  1e-132  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0152126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3745  argininosuccinate synthase  56.76 
 
 		 406 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2588  argininosuccinate synthase  57.54 
 
 		 403 aa  469  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1900  argininosuccinate synthase  57.51 
 
 		 396 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0047  argininosuccinate synthase  56.53 
 
 		 401 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0556  argininosuccinate synthase  57.29 
 
 		 405 aa  466  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  57.83 
 
 		 403 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2491  argininosuccinate synthase  57.11 
 
 		 399 aa  462  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3638  argininosuccinate synthase  56.02 
 
 		 406 aa  463  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3751  argininosuccinate synthase  57.29 
 
 		 419 aa  463  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_19853  predicted protein  56.78 
 
 		 402 aa  462  1e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1533  argininosuccinate synthase  56 
 
 		 410 aa  461  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.535542  normal  0.279557 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2698  argininosuccinate synthase  57.93 
 
 		 397 aa  458  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.823792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0979  argininosuccinate synthase  57.18 
 
 		 412 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0061  argininosuccinate synthase  55.89 
 
 		 401 aa  458  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0532  argininosuccinate synthase  56.52 
 
 		 405 aa  457  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2417  argininosuccinate synthase  57.64 
 
 		 406 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.20961  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0914  argininosuccinate synthase  56.39 
 
 		 402 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000289862  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0332  argininosuccinate synthase  57.72 
 
 		 408 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0228  argininosuccinate synthase  55.42 
 
 		 406 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2067  argininosuccinate synthase  55.14 
 
 		 414 aa  453  1.0000000000000001e-126  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02900  Argininosuccinate synthase  54.46 
 
 		 413 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4273  argininosuccinate synthase  56.96 
 
 		 407 aa  451  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.898095  normal  0.346198 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0205  argininosuccinate synthase  56.96 
 
 		 407 aa  449  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0718658 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2127  argininosuccinate synthase  54.75 
 
 		 406 aa  448  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.263511  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2452  Argininosuccinate synthase  56.14 
 
 		 404 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341026  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3171  argininosuccinate synthase  54.25 
 
 		 408 aa  449  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1659  argininosuccinate synthase  55.95 
 
 		 411 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0688  argininosuccinate synthase  56.53 
 
 		 408 aa  446  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0230  argininosuccinate synthase  56.03 
 
 		 412 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.633621  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3472  argininosuccinate synthase  56.86 
 
 		 406 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3344  argininosuccinate synthase  56.78 
 
 		 419 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3742  argininosuccinate synthase  55.22 
 
 		 407 aa  447  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000983467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0390  argininosuccinate synthase  55.3 
 
 		 397 aa  445  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1377  argininosuccinate synthase  58.96 
 
 		 410 aa  442  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4517  argininosuccinate synthase  54.41 
 
 		 405 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00529  argininosuccinate synthase  54.81 
 
 		 401 aa  442  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3148  argininosuccinate synthase  54.02 
 
 		 405 aa  443  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1117  argininosuccinate synthase  54.17 
 
 		 405 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2916  argininosuccinate synthase  56.9 
 
 		 410 aa  444  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0725  argininosuccinate synthase  56 
 
 		 403 aa  441  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.304208  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0153  argininosuccinate synthase  54.02 
 
 		 406 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1088  argininosuccinate synthase  53.92 
 
 		 405 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2650  argininosuccinate synthase  56.23 
 
 		 408 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1212  argininosuccinate synthase  55.99 
 
 		 408 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4324  argininosuccinate synthase  53.92 
 
 		 405 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1622  argininosuccinate synthase  53.68 
 
 		 405 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00134855  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2873  argininosuccinate synthase  55.99 
 
 		 408 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0067  argininosuccinate synthase  55.53 
 
 		 407 aa  440  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2423  argininosuccinate synthase  53.38 
 
 		 409 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.106011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14080  argininosuccinate synthase  54.64 
 
 		 406 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00581538  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1129  argininosuccinate synthase  53.92 
 
 		 405 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.504857  normal  0.904376 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18740  argininosuccinate synthase  53.68 
 
 		 405 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00166387  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4121  argininosuccinate synthase  54.84 
 
 		 412 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1099  argininosuccinate synthase  54.16 
 
 		 408 aa  436  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0463  argininosuccinate synthase  55.06 
 
 		 418 aa  435  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4155  argininosuccinate synthase  53.43 
 
 		 405 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4779  argininosuccinate synthase  53.87 
 
 		 406 aa  437  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3892  argininosuccinate synthase  53.68 
 
 		 405 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.141657 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3714  argininosuccinate synthase  55.7 
 
 		 407 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1394  argininosuccinate synthase  53.88 
 
 		 405 aa  437  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.664295 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4040  argininosuccinate synthase  56.06 
 
 		 407 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0206  argininosuccinate synthase  53.52 
 
 		 406 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000461564 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0355  argininosuccinate synthase  54.19 
 
 		 407 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.752574  normal  0.580202 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4210  argininosuccinate synthase  54.84 
 
 		 412 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3718  argininosuccinate synthase  56.09 
 
 		 407 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1095  argininosuccinate synthase  54.34 
 
 		 401 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.142038  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0601  argininosuccinate synthase  54.77 
 
 		 402 aa  436  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000197496 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4092  argininosuccinate synthase  54.84 
 
 		 412 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4011  argininosuccinate synthase  54.84 
 
 		 412 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0259  argininosuccinate synthase  55.08 
 
 		 407 aa  436  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.803281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0231  argininosuccinate synthase  54.34 
 
 		 402 aa  437  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000109496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4161  argininosuccinate synthase  55.56 
 
 		 409 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0278  argininosuccinate synthase  55.44 
 
 		 407 aa  433  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1631  argininosuccinate synthase  55.19 
 
 		 412 aa  432  1e-120  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0894235  hitchhiker  0.00967015 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1708  argininosuccinate synthase  53.45 
 
 		 406 aa  432  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0472214  hitchhiker  0.00281031 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1864  argininosuccinate synthase  55.19 
 
 		 412 aa  431  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0468314  normal  0.0853528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>