More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3356 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4058  argininosuccinate synthase  96.02 
 
 		 407 aa  804    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3356  argininosuccinate synthase  100 
 
 		 402 aa  831    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4140  argininosuccinate synthase  73.75 
 
 		 403 aa  630  1e-179  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0795  argininosuccinate synthase  65.83 
 
 		 401 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0179  argininosuccinate synthase  63.59 
 
 		 405 aa  534  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1345  argininosuccinate synthase  61.52 
 
 		 404 aa  523  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000339578  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0571  argininosuccinate synthase  61.36 
 
 		 401 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0277  argininosuccinate synthase  63.64 
 
 		 401 aa  514  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0663  argininosuccinate synthase  58.23 
 
 		 410 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4158  argininosuccinate synthase  60.15 
 
 		 405 aa  504  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0852735  normal  0.163205 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2285  argininosuccinate synthase  59.7 
 
 		 408 aa  495  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0683  argininosuccinate synthase  58.73 
 
 		 403 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  56.63 
 
 		 1496 aa  489  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0061  argininosuccinate synthase  56.78 
 
 		 401 aa  489  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1729  argininosuccinate synthase  59.85 
 
 		 407 aa  485  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.57009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1828  argininosuccinate synthase  58.38 
 
 		 399 aa  483  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2491  argininosuccinate synthase  55.7 
 
 		 399 aa  478  1e-134  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1049  argininosuccinate synthase  56.96 
 
 		 407 aa  472  1e-132  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0228  argininosuccinate synthase  56.28 
 
 		 406 aa  472  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00529  argininosuccinate synthase  56.71 
 
 		 401 aa  472  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0230  argininosuccinate synthase  55.16 
 
 		 412 aa  473  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.633621  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3745  argininosuccinate synthase  55.56 
 
 		 406 aa  472  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2417  argininosuccinate synthase  56.89 
 
 		 406 aa  472  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.20961  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4779  argininosuccinate synthase  54.66 
 
 		 406 aa  472  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3638  argininosuccinate synthase  55.3 
 
 		 406 aa  472  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4273  argininosuccinate synthase  55.95 
 
 		 407 aa  473  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.898095  normal  0.346198 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0332  argininosuccinate synthase  55.7 
 
 		 408 aa  474  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1249  argininosuccinate synthase  56.17 
 
 		 403 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000123934  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0247  argininosuccinate synthase  56.35 
 
 		 403 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0344  argininosuccinate synthase  59.85 
 
 		 399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0205  argininosuccinate synthase  54.91 
 
 		 407 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0718658 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2361  argininosuccinate synthase  58.31 
 
 		 397 aa  469  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0152126  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0153  argininosuccinate synthase  55.39 
 
 		 406 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0463  argininosuccinate synthase  54.25 
 
 		 418 aa  466  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0390  argininosuccinate synthase  56.71 
 
 		 397 aa  467  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0923  argininosuccinate synthase  55.28 
 
 		 404 aa  465  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.909799  hitchhiker  0.00000000000000121809 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0206  argininosuccinate synthase  55.39 
 
 		 406 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000461564 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2531  argininosuccinate synthase  55.95 
 
 		 400 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00599814  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  55.84 
 
 		 403 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0725  argininosuccinate synthase  56.58 
 
 		 403 aa  462  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.304208  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3148  argininosuccinate synthase  54.89 
 
 		 405 aa  463  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4210  argininosuccinate synthase  54.68 
 
 		 412 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2698  argininosuccinate synthase  58.06 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.823792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0979  argininosuccinate synthase  55.5 
 
 		 412 aa  463  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3714  argininosuccinate synthase  54.68 
 
 		 407 aa  464  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3171  argininosuccinate synthase  55.16 
 
 		 408 aa  461  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0259  argininosuccinate synthase  54.82 
 
 		 407 aa  464  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.803281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1900  argininosuccinate synthase  56.38 
 
 		 396 aa  463  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2270  argininosuccinate synthase  55.98 
 
 		 399 aa  460  9.999999999999999e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0278  argininosuccinate synthase  54.18 
 
 		 407 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4121  argininosuccinate synthase  54.43 
 
 		 412 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4092  argininosuccinate synthase  54.43 
 
 		 412 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4011  argininosuccinate synthase  54.43 
 
 		 412 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0231  argininosuccinate synthase  53.15 
 
 		 402 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000109496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0047  argininosuccinate synthase  55.33 
 
 		 401 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2067  argininosuccinate synthase  55.3 
 
 		 414 aa  455  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3706  argininosuccinate synthase  53.92 
 
 		 407 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0239  argininosuccinate synthase  53.92 
 
 		 407 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02900  Argininosuccinate synthase  52.5 
 
 		 413 aa  455  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3902  argininosuccinate synthase  53.92 
 
 		 407 aa  456  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.940793  normal  0.44318 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0194  argininosuccinate synthase  53.85 
 
 		 407 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0253  argininosuccinate synthase  53.08 
 
 		 407 aa  450  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0601  argininosuccinate synthase  55.16 
 
 		 402 aa  451  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000197496 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2218  argininosuccinate synthase  53.94 
 
 		 404 aa  451  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0688  argininosuccinate synthase  54.21 
 
 		 408 aa  445  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3751  argininosuccinate synthase  54.96 
 
 		 419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0355  argininosuccinate synthase  54.36 
 
 		 407 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.752574  normal  0.580202 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2127  argininosuccinate synthase  54.14 
 
 		 406 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.263511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1931  argininosuccinate synthase  53.79 
 
 		 407 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00337254  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1373  argininosuccinate synthase  54.06 
 
 		 404 aa  442  1e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0310982  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2758  argininosuccinate synthase  52.7 
 
 		 403 aa  443  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00041  argininosuccinate synthase  53.21 
 
 		 404 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2803  argininosuccinate synthase  53.75 
 
 		 409 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.953161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002314  argininosuccinate synthase  52.44 
 
 		 404 aa  438  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.957831  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2423  argininosuccinate synthase  52.75 
 
 		 409 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.106011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1533  argininosuccinate synthase  52.88 
 
 		 410 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.535542  normal  0.279557 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2916  argininosuccinate synthase  54.61 
 
 		 410 aa  439  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2452  Argininosuccinate synthase  54.11 
 
 		 404 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341026  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1659  argininosuccinate synthase  52.39 
 
 		 411 aa  437  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2108  argininosuccinate synthase  54 
 
 		 405 aa  434  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0914  argininosuccinate synthase  52.26 
 
 		 402 aa  436  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000289862  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1043  argininosuccinate synthase  53.22 
 
 		 407 aa  438  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3344  argininosuccinate synthase  54.04 
 
 		 419 aa  435  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3742  argininosuccinate synthase  52.49 
 
 		 407 aa  437  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000983467 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0556  argininosuccinate synthase  51.65 
 
 		 405 aa  434  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0532  argininosuccinate synthase  51.14 
 
 		 405 aa  432  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1044  argininosuccinate synthase  51.93 
 
 		 400 aa  434  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_004310  BR0074  argininosuccinate synthase  53.03 
 
 		 406 aa  429  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1071  argininosuccinate synthase  51.03 
 
 		 401 aa  430  1e-119  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1378  argininosuccinate synthase  51.67 
 
 		 400 aa  429  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1334  argininosuccinate synthase  52.91 
 
 		 406 aa  430  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3623  argininosuccinate synthase  52 
 
 		 409 aa  429  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.724533  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_19853  predicted protein  53.2 
 
 		 402 aa  430  1e-119  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0073  argininosuccinate synthase  53.28 
 
 		 406 aa  431  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1325  argininosuccinate synthase  51.28 
 
 		 400 aa  428  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0692  argininosuccinate synthase  52.91 
 
 		 406 aa  431  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4040  argininosuccinate synthase  53.79 
 
 		 407 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2588  argininosuccinate synthase  53.65 
 
 		 403 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3472  argininosuccinate synthase  54.29 
 
 		 406 aa  427  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1864  argininosuccinate synthase  51.39 
 
 		 412 aa  425  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0468314  normal  0.0853528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>