More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_34492 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_01883  arginosuccinate synthetase (Eurofung)  72.6 
 
 
416 aa  647    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34492  argininosuccinate synthetase  100 
 
 
416 aa  855    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.491384  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00700  argininosuccinate synthase, putative  64.15 
 
 
429 aa  557  1e-157  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1067  argininosuccinate synthase  50.87 
 
 
409 aa  412  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000337048  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1045  argininosuccinate synthase  50.87 
 
 
409 aa  414  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000136428  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21116  predicted protein  50.6 
 
 
418 aa  409  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  50 
 
 
403 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0559  Argininosuccinate synthase  45.27 
 
 
430 aa  376  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.487039 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2491  argininosuccinate synthase  49.49 
 
 
399 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0061  argininosuccinate synthase  47.51 
 
 
401 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2067  argininosuccinate synthase  48.88 
 
 
414 aa  374  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1099  argininosuccinate synthase  46.53 
 
 
408 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3638  argininosuccinate synthase  46.23 
 
 
406 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2698  argininosuccinate synthase  47.49 
 
 
397 aa  369  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.823792  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3745  argininosuccinate synthase  46.48 
 
 
406 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2361  argininosuccinate synthase  47.74 
 
 
397 aa  366  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0152126  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1976  argininosuccinate synthase  47.22 
 
 
419 aa  365  1e-99  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1043  argininosuccinate synthase  46.52 
 
 
407 aa  363  2e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3206  argininosuccinate synthase  46.02 
 
 
408 aa  363  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3171  argininosuccinate synthase  45.52 
 
 
408 aa  362  6e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2452  Argininosuccinate synthase  46.57 
 
 
404 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341026  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2417  argininosuccinate synthase  45.98 
 
 
406 aa  362  1e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.20961  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2423  argininosuccinate synthase  47.72 
 
 
409 aa  361  1e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.106011  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3148  argininosuccinate synthase  45.98 
 
 
405 aa  361  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0228  argininosuccinate synthase  45.48 
 
 
406 aa  360  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0756  argininosuccinate synthase  46.02 
 
 
408 aa  360  4e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.589205  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0390  argininosuccinate synthase  46.48 
 
 
397 aa  359  5e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1219  argininosuccinate synthase  47.12 
 
 
407 aa  358  8e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.099929  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7386  argininosuccinate synthase  46.49 
 
 
413 aa  358  9e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3751  argininosuccinate synthase  47.23 
 
 
419 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1027  argininosuccinate synthase  44.9 
 
 
409 aa  358  9.999999999999999e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00571105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0153  argininosuccinate synthase  45.73 
 
 
406 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18740  argininosuccinate synthase  46.15 
 
 
405 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00166387  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0355  argininosuccinate synthase  46.77 
 
 
407 aa  355  6.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.752574  normal  0.580202 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0767  argininosuccinate synthase  44.99 
 
 
406 aa  355  7.999999999999999e-97  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0692  argininosuccinate synthase  44.99 
 
 
406 aa  355  8.999999999999999e-97  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2674  argininosuccinate synthase  45.54 
 
 
409 aa  354  1e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1334  argininosuccinate synthase  44.99 
 
 
406 aa  355  1e-96  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0206  argininosuccinate synthase  45.23 
 
 
406 aa  355  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000461564 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3344  argininosuccinate synthase  45.12 
 
 
419 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0842  argininosuccinate synthase  44.01 
 
 
407 aa  353  4e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00643097  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3623  argininosuccinate synthase  45.82 
 
 
409 aa  352  5e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.724533  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0601  argininosuccinate synthase  46.63 
 
 
402 aa  352  5e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000197496 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1382  argininosuccinate synthase  46.72 
 
 
416 aa  352  7e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.924271 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1064  argininosuccinate synthase  43.9 
 
 
406 aa  352  7e-96  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.269529  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1394  argininosuccinate synthase  46.27 
 
 
405 aa  352  8e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.664295 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0914  argininosuccinate synthase  44.85 
 
 
402 aa  351  1e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000289862  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1533  argininosuccinate synthase  45.1 
 
 
410 aa  351  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.535542  normal  0.279557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1622  argininosuccinate synthase  45.43 
 
 
405 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00134855  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_19853  predicted protein  47.43 
 
 
402 aa  350  2e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4161  argininosuccinate synthase  45.75 
 
 
409 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1659  argininosuccinate synthase  45.77 
 
 
411 aa  350  2e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409616  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0747  argininosuccinate synthase  45.5 
 
 
409 aa  350  2e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1753  argininosuccinate synthase  45.06 
 
 
410 aa  350  3e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.233709  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1729  argininosuccinate synthase  45.26 
 
 
407 aa  350  3e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.57009  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2803  argininosuccinate synthase  45.35 
 
 
409 aa  349  5e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.953161  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2250  argininosuccinate synthase  45.28 
 
 
413 aa  349  6e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137068  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1071  argininosuccinate synthase  45.57 
 
 
401 aa  349  6e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4517  argininosuccinate synthase  45.3 
 
 
405 aa  348  7e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1088  argininosuccinate synthase  44.82 
 
 
405 aa  348  8e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1129  argininosuccinate synthase  44.82 
 
 
405 aa  348  8e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.504857  normal  0.904376 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1708  argininosuccinate synthase  45.16 
 
 
406 aa  348  9e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0472214  hitchhiker  0.00281031 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2588  argininosuccinate synthase  46.78 
 
 
403 aa  348  1e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0609  argininosuccinate synthase  45.28 
 
 
412 aa  347  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1631  argininosuccinate synthase  45.27 
 
 
412 aa  347  2e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0894235  hitchhiker  0.00967015 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6641  argininosuccinate synthase  46.25 
 
 
413 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.453364  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1864  argininosuccinate synthase  45.27 
 
 
412 aa  347  2e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0468314  normal  0.0853528 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4763  argininosuccinate synthase  47.15 
 
 
407 aa  347  2e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1117  argininosuccinate synthase  44.82 
 
 
405 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3742  argininosuccinate synthase  45.95 
 
 
407 aa  347  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000983467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2293  argininosuccinate synthase  45.04 
 
 
413 aa  347  3e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4155  argininosuccinate synthase  45.06 
 
 
405 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2568  argininosuccinate synthase  45.04 
 
 
413 aa  346  3e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0384503 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3063  argininosuccinate synthase  45.75 
 
 
405 aa  346  4e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711058  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2537  argininosuccinate synthase  46.15 
 
 
403 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.994167  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4040  argininosuccinate synthase  45.5 
 
 
407 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3892  argininosuccinate synthase  44.82 
 
 
405 aa  346  5e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.141657 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2127  argininosuccinate synthase  45.66 
 
 
406 aa  346  5e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.263511  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0680  argininosuccinate synthase  44.15 
 
 
408 aa  344  1e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0688  argininosuccinate synthase  45.41 
 
 
408 aa  344  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1373  argininosuccinate synthase  45.23 
 
 
404 aa  344  2e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0310982  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2013  argininosuccinate synthase  45.39 
 
 
409 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0978065  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0086  argininosuccinate synthase  44.5 
 
 
412 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.509496  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0074  argininosuccinate synthase  44.5 
 
 
406 aa  343  4e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14080  argininosuccinate synthase  45.02 
 
 
406 aa  343  4e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00581538  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1849  argininosuccinate synthase  44.69 
 
 
409 aa  343  4e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4324  argininosuccinate synthase  43.86 
 
 
405 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4058  argininosuccinate synthase  45.25 
 
 
407 aa  343  4e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31634  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0073  argininosuccinate synthase  44.5 
 
 
406 aa  343  5e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0571  argininosuccinate synthase  46.48 
 
 
401 aa  343  5e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0725  argininosuccinate synthase  45.27 
 
 
403 aa  342  5e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.304208  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3718  argininosuccinate synthase  44.8 
 
 
407 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1377  argininosuccinate synthase  47.07 
 
 
410 aa  342  8e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0084  argininosuccinate synthase  44.77 
 
 
409 aa  341  1e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0882429  normal  0.0155281 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2231  argininosuccinate synthase  45.83 
 
 
404 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1361  argininosuccinate synthase  44.5 
 
 
407 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.515773  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1468  argininosuccinate synthase  44.79 
 
 
410 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0853487  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0247  argininosuccinate synthase  45.36 
 
 
403 aa  338  7e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3472  argininosuccinate synthase  44.88 
 
 
406 aa  338  8e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2883  argininosuccinate synthase  45.41 
 
 
407 aa  338  9.999999999999999e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>