More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2883 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2970  argininosuccinate synthase  77.1 
 
 		 405 aa  636    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0086  argininosuccinate synthase  78.3 
 
 		 412 aa  653    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.509496  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0074  argininosuccinate synthase  77.81 
 
 		 406 aa  651    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7386  argininosuccinate synthase  76.87 
 
 		 413 aa  647    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1377  argininosuccinate synthase  80 
 
 		 410 aa  644    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2250  argininosuccinate synthase  77.81 
 
 		 413 aa  652    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137068  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0609  argininosuccinate synthase  76.59 
 
 		 412 aa  652    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1273  argininosuccinate synthase  80.35 
 
 		 426 aa  667    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0227151 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2803  argininosuccinate synthase  76.62 
 
 		 409 aa  644    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.953161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1212  argininosuccinate synthase  89.93 
 
 		 408 aa  760    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2568  argininosuccinate synthase  77.31 
 
 		 413 aa  650    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0384503 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2013  argininosuccinate synthase  78.86 
 
 		 409 aa  662    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0978065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3472  argininosuccinate synthase  87.68 
 
 		 406 aa  739    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1195  argininosuccinate synthase  79.23 
 
 		 404 aa  643    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0067  argininosuccinate synthase  85.19 
 
 		 407 aa  721    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2293  argininosuccinate synthase  77.56 
 
 		 413 aa  651    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3623  argininosuccinate synthase  76.87 
 
 		 409 aa  645    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.724533  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2883  argininosuccinate synthase  100 
 
 		 407 aa  835    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0495  argininosuccinate synthase  80.75 
 
 		 405 aa  675    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.337809  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0073  argininosuccinate synthase  77.81 
 
 		 406 aa  652    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1382  argininosuccinate synthase  78.36 
 
 		 416 aa  659    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.924271 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4161  argininosuccinate synthase  77.94 
 
 		 409 aa  647    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3718  argininosuccinate synthase  77.44 
 
 		 407 aa  642    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4040  argininosuccinate synthase  77.44 
 
 		 407 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2916  argininosuccinate synthase  78.36 
 
 		 410 aa  646    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3063  argininosuccinate synthase  77.5 
 
 		 405 aa  645    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6641  argininosuccinate synthase  76.62 
 
 		 413 aa  644    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.453364  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2650  argininosuccinate synthase  88.7 
 
 		 408 aa  754    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0499  argininosuccinate synthase  89.38 
 
 		 408 aa  755    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2873  argininosuccinate synthase  89.93 
 
 		 408 aa  760    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3344  argininosuccinate synthase  77 
 
 		 419 aa  632  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4763  argininosuccinate synthase  75.06 
 
 		 407 aa  625  1e-178  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0747  argininosuccinate synthase  76.14 
 
 		 409 aa  624  1e-177  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1361  argininosuccinate synthase  74.94 
 
 		 407 aa  620  1e-176  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.515773  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0084  argininosuccinate synthase  75.12 
 
 		 409 aa  616  1e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0882429  normal  0.0155281 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2231  argininosuccinate synthase  71.75 
 
 		 404 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3331  argininosuccinate synthase  70.15 
 
 		 409 aa  594  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2537  argininosuccinate synthase  69.63 
 
 		 403 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.994167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3751  argininosuccinate synthase  70.56 
 
 		 419 aa  585  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1533  argininosuccinate synthase  69.14 
 
 		 410 aa  580  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.535542  normal  0.279557 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0842  argininosuccinate synthase  70.4 
 
 		 407 aa  580  1e-164  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00643097  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1219  argininosuccinate synthase  70.65 
 
 		 407 aa  576  1.0000000000000001e-163  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.099929  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1849  argininosuccinate synthase  68.7 
 
 		 409 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0914  argininosuccinate synthase  68.64 
 
 		 402 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000289862  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1976  argininosuccinate synthase  70.6 
 
 		 419 aa  573  1.0000000000000001e-162  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0767  argininosuccinate synthase  69.15 
 
 		 406 aa  565  1e-160  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1334  argininosuccinate synthase  68.91 
 
 		 406 aa  564  1e-160  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0692  argininosuccinate synthase  69.15 
 
 		 406 aa  565  1e-160  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1027  argininosuccinate synthase  69.4 
 
 		 409 aa  567  1e-160  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00571105  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2588  argininosuccinate synthase  66.01 
 
 		 403 aa  565  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2423  argininosuccinate synthase  65.76 
 
 		 409 aa  561  1.0000000000000001e-159  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.106011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0756  argininosuccinate synthase  68.8 
 
 		 408 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.589205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2127  argininosuccinate synthase  65.76 
 
 		 406 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.263511  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0355  argininosuccinate synthase  66.91 
 
 		 407 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.752574  normal  0.580202 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2452  Argininosuccinate synthase  66.83 
 
 		 404 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341026  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1659  argininosuccinate synthase  67.08 
 
 		 411 aa  559  1e-158  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3031  argininosuccinate synthase  67.66 
 
 		 468 aa  559  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.526147  normal  0.562744 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1043  argininosuccinate synthase  66.5 
 
 		 407 aa  558  1e-158  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0725  argininosuccinate synthase  68.24 
 
 		 403 aa  559  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.304208  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_19853  predicted protein  67.25 
 
 		 402 aa  555  1e-157  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0754  argininosuccinate synthase  68.66 
 
 		 406 aa  555  1e-157  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1753  argininosuccinate synthase  66.75 
 
 		 410 aa  557  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.233709  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2674  argininosuccinate synthase  67.91 
 
 		 409 aa  555  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1468  argininosuccinate synthase  65.77 
 
 		 410 aa  551  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0853487  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1099  argininosuccinate synthase  66.58 
 
 		 408 aa  553  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3206  argininosuccinate synthase  67.81 
 
 		 408 aa  554  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1394  argininosuccinate synthase  64.78 
 
 		 405 aa  553  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.664295 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1064  argininosuccinate synthase  66.92 
 
 		 406 aa  551  1e-156  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.269529  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1864  argininosuccinate synthase  66.58 
 
 		 412 aa  552  1e-156  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0468314  normal  0.0853528 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1631  argininosuccinate synthase  66.33 
 
 		 412 aa  550  1e-155  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0894235  hitchhiker  0.00967015 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4517  argininosuccinate synthase  64.29 
 
 		 405 aa  548  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1373  argininosuccinate synthase  67.08 
 
 		 404 aa  549  1e-155  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0310982  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4324  argininosuccinate synthase  65.02 
 
 		 405 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0601  argininosuccinate synthase  66.75 
 
 		 402 aa  550  1e-155  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000197496 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18740  argininosuccinate synthase  65.1 
 
 		 405 aa  548  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00166387  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3742  argininosuccinate synthase  66.58 
 
 		 407 aa  549  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000983467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1088  argininosuccinate synthase  64.53 
 
 		 405 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4155  argininosuccinate synthase  64.29 
 
 		 405 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3892  argininosuccinate synthase  64.29 
 
 		 405 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.141657 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1129  argininosuccinate synthase  64.53 
 
 		 405 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.504857  normal  0.904376 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2108  argininosuccinate synthase  65.19 
 
 		 405 aa  544  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1117  argininosuccinate synthase  64.85 
 
 		 405 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14080  argininosuccinate synthase  65.35 
 
 		 406 aa  546  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00581538  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1622  argininosuccinate synthase  64.53 
 
 		 405 aa  547  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00134855  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1708  argininosuccinate synthase  65.44 
 
 		 406 aa  542  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0472214  hitchhiker  0.00281031 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0680  argininosuccinate synthase  65.84 
 
 		 408 aa  544  1e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0404  argininosuccinate synthase  67.01 
 
 		 399 aa  535  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0568  Argininosuccinate synthase  67.01 
 
 		 399 aa  535  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0228  argininosuccinate synthase  64.3 
 
 		 406 aa  523  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3745  argininosuccinate synthase  62.72 
 
 		 406 aa  518  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3638  argininosuccinate synthase  62.72 
 
 		 406 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0367  argininosuccinate synthase  64.14 
 
 		 393 aa  501  1e-141  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3171  argininosuccinate synthase  61.01 
 
 		 408 aa  503  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0153  argininosuccinate synthase  61.01 
 
 		 406 aa  494  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3148  argininosuccinate synthase  61.01 
 
 		 405 aa  496  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0206  argininosuccinate synthase  60.71 
 
 		 406 aa  495  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000461564 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0680  argininosuccinate synthase  62.94 
 
 		 393 aa  498  1e-139  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.90622  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2417  argininosuccinate synthase  60.95 
 
 		 406 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.20961  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2531  argininosuccinate synthase  63.1 
 
 		 400 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00599814  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0247  argininosuccinate synthase  61.15 
 
 		 403 aa  489  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>