More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4158 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4158  argininosuccinate synthase  100 
 
 
405 aa  831    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0852735  normal  0.163205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4058  argininosuccinate synthase  60.15 
 
 
407 aa  504  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31634  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3356  argininosuccinate synthase  60.15 
 
 
402 aa  504  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0179  argininosuccinate synthase  59.2 
 
 
405 aa  491  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0795  argininosuccinate synthase  59.14 
 
 
401 aa  489  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0277  argininosuccinate synthase  58.88 
 
 
401 aa  488  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1345  argininosuccinate synthase  58.29 
 
 
404 aa  486  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000339578  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0571  argininosuccinate synthase  58.12 
 
 
401 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2285  argininosuccinate synthase  57.97 
 
 
408 aa  480  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4140  argininosuccinate synthase  56.2 
 
 
403 aa  479  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  56.27 
 
 
1496 aa  475  1e-133  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0663  argininosuccinate synthase  57.64 
 
 
410 aa  476  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1249  argininosuccinate synthase  57.25 
 
 
403 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000123934  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1828  argininosuccinate synthase  58.63 
 
 
399 aa  467  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0344  argininosuccinate synthase  58.69 
 
 
399 aa  464  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0923  argininosuccinate synthase  55.22 
 
 
404 aa  458  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.909799  hitchhiker  0.00000000000000121809 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1049  argininosuccinate synthase  56.72 
 
 
407 aa  460  9.999999999999999e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0683  argininosuccinate synthase  56.27 
 
 
403 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1931  argininosuccinate synthase  55.28 
 
 
407 aa  448  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00337254  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0247  argininosuccinate synthase  54.43 
 
 
403 aa  450  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0725  argininosuccinate synthase  54.85 
 
 
403 aa  445  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.304208  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1729  argininosuccinate synthase  53.13 
 
 
407 aa  442  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.57009  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2270  argininosuccinate synthase  55.84 
 
 
399 aa  442  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0979  argininosuccinate synthase  55.22 
 
 
412 aa  444  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4779  argininosuccinate synthase  55.25 
 
 
406 aa  438  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2491  argininosuccinate synthase  53.66 
 
 
399 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2361  argininosuccinate synthase  54.87 
 
 
397 aa  440  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0152126  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1900  argininosuccinate synthase  53.87 
 
 
396 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00529  argininosuccinate synthase  53.94 
 
 
401 aa  437  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1373  argininosuccinate synthase  52.58 
 
 
404 aa  437  1e-121  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0310982  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0601  argininosuccinate synthase  54.08 
 
 
402 aa  437  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000197496 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0390  argininosuccinate synthase  54.01 
 
 
397 aa  436  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0047  argininosuccinate synthase  53.2 
 
 
401 aa  433  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2218  argininosuccinate synthase  53.45 
 
 
404 aa  429  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4011  argininosuccinate synthase  53.98 
 
 
412 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3714  argininosuccinate synthase  54.31 
 
 
407 aa  428  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4210  argininosuccinate synthase  53.98 
 
 
412 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4121  argininosuccinate synthase  53.98 
 
 
412 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4092  argininosuccinate synthase  53.98 
 
 
412 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2698  argininosuccinate synthase  54.1 
 
 
397 aa  427  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.823792  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0278  argininosuccinate synthase  54.06 
 
 
407 aa  427  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0332  argininosuccinate synthase  54.31 
 
 
408 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2531  argininosuccinate synthase  52.33 
 
 
400 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00599814  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0914  argininosuccinate synthase  51.02 
 
 
402 aa  426  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000289862  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  51.15 
 
 
403 aa  426  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0230  argininosuccinate synthase  53.94 
 
 
412 aa  427  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.633621  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0463  argininosuccinate synthase  54.39 
 
 
418 aa  424  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002314  argininosuccinate synthase  53.09 
 
 
404 aa  423  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.957831  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00041  argininosuccinate synthase  53.35 
 
 
404 aa  424  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2758  argininosuccinate synthase  53.09 
 
 
403 aa  424  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3706  argininosuccinate synthase  53.81 
 
 
407 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0239  argininosuccinate synthase  53.81 
 
 
407 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3902  argininosuccinate synthase  53.81 
 
 
407 aa  423  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.940793  normal  0.44318 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4273  argininosuccinate synthase  53.55 
 
 
407 aa  423  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.898095  normal  0.346198 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0205  argininosuccinate synthase  53.55 
 
 
407 aa  422  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0718658 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0767  argininosuccinate synthase  51.93 
 
 
406 aa  418  1e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0692  argininosuccinate synthase  51.93 
 
 
406 aa  419  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0259  argininosuccinate synthase  53.94 
 
 
407 aa  420  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.803281  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1334  argininosuccinate synthase  51.93 
 
 
406 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1067  argininosuccinate synthase  49.88 
 
 
409 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000337048  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1659  argininosuccinate synthase  51.8 
 
 
411 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409616  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1533  argininosuccinate synthase  50.26 
 
 
410 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.535542  normal  0.279557 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02900  Argininosuccinate synthase  50.62 
 
 
413 aa  415  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1219  argininosuccinate synthase  51.67 
 
 
407 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.099929  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1045  argininosuccinate synthase  49.88 
 
 
409 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000136428  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2067  argininosuccinate synthase  51.9 
 
 
414 aa  415  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1064  argininosuccinate synthase  50.64 
 
 
406 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.269529  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7386  argininosuccinate synthase  52.03 
 
 
413 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0061  argininosuccinate synthase  50.5 
 
 
401 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0747  argininosuccinate synthase  50.9 
 
 
409 aa  412  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0556  argininosuccinate synthase  50.25 
 
 
405 aa  412  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0532  argininosuccinate synthase  50.5 
 
 
405 aa  412  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2452  Argininosuccinate synthase  51.02 
 
 
404 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341026  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0253  argininosuccinate synthase  52.67 
 
 
407 aa  413  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2127  argininosuccinate synthase  51.02 
 
 
406 aa  411  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.263511  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0355  argininosuccinate synthase  51.66 
 
 
407 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.752574  normal  0.580202 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2250  argininosuccinate synthase  52.02 
 
 
413 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137068  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0231  argininosuccinate synthase  52.03 
 
 
402 aa  413  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000109496  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2108  argininosuccinate synthase  50.51 
 
 
405 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2417  argininosuccinate synthase  52.15 
 
 
406 aa  411  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.20961  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1043  argininosuccinate synthase  48.62 
 
 
407 aa  411  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3751  argininosuccinate synthase  50.51 
 
 
419 aa  409  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2293  argininosuccinate synthase  52.27 
 
 
413 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_19853  predicted protein  49.49 
 
 
402 aa  409  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0680  argininosuccinate synthase  50.51 
 
 
408 aa  409  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1377  argininosuccinate synthase  51.96 
 
 
410 aa  408  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0194  argininosuccinate synthase  52.82 
 
 
407 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1027  argininosuccinate synthase  49.36 
 
 
409 aa  410  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00571105  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2568  argininosuccinate synthase  52.02 
 
 
413 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0384503 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1976  argininosuccinate synthase  50.65 
 
 
419 aa  410  1e-113  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0842  argininosuccinate synthase  49.87 
 
 
407 aa  409  1e-113  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00643097  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0609  argininosuccinate synthase  51.52 
 
 
412 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1099  argininosuccinate synthase  49.49 
 
 
408 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1095  argininosuccinate synthase  50.63 
 
 
401 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.142038  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2674  argininosuccinate synthase  50 
 
 
409 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1708  argininosuccinate synthase  49.87 
 
 
406 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0472214  hitchhiker  0.00281031 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3344  argininosuccinate synthase  51.52 
 
 
419 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4161  argininosuccinate synthase  50.37 
 
 
409 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3742  argininosuccinate synthase  48.88 
 
 
407 aa  405  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000983467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6641  argininosuccinate synthase  51.78 
 
 
413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.453364  normal  0.0120904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>