More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00529 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0332  argininosuccinate synthase  75.88 
 
 		 408 aa  645    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3714  argininosuccinate synthase  75.25 
 
 		 407 aa  638    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0463  argininosuccinate synthase  78.52 
 
 		 418 aa  670    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0278  argininosuccinate synthase  75.25 
 
 		 407 aa  638    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0205  argininosuccinate synthase  74.06 
 
 		 407 aa  635    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0718658 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0230  argininosuccinate synthase  76.63 
 
 		 412 aa  650    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.633621  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00529  argininosuccinate synthase  100 
 
 		 401 aa  829    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0979  argininosuccinate synthase  88.25 
 
 		 412 aa  746    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3706  argininosuccinate synthase  75 
 
 		 407 aa  635    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0239  argininosuccinate synthase  75 
 
 		 407 aa  635    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0194  argininosuccinate synthase  75.32 
 
 		 407 aa  634    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4121  argininosuccinate synthase  75.51 
 
 		 412 aa  641    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4092  argininosuccinate synthase  75.51 
 
 		 412 aa  641    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3902  argininosuccinate synthase  75 
 
 		 407 aa  635    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.940793  normal  0.44318 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4011  argininosuccinate synthase  75.51 
 
 		 412 aa  641    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4210  argininosuccinate synthase  75.25 
 
 		 412 aa  639    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0259  argininosuccinate synthase  77.39 
 
 		 407 aa  656    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.803281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4273  argininosuccinate synthase  75.25 
 
 		 407 aa  638    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.898095  normal  0.346198 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0253  argininosuccinate synthase  74.81 
 
 		 407 aa  630  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0231  argininosuccinate synthase  72.82 
 
 		 402 aa  624  1e-178  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000109496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00041  argininosuccinate synthase  72.89 
 
 		 404 aa  606  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2758  argininosuccinate synthase  71.36 
 
 		 403 aa  602  1.0000000000000001e-171  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002314  argininosuccinate synthase  72.12 
 
 		 404 aa  603  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.957831  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2218  argininosuccinate synthase  71.36 
 
 		 404 aa  590  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4779  argininosuccinate synthase  67.33 
 
 		 406 aa  580  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0795  argininosuccinate synthase  59.14 
 
 		 401 aa  479  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4058  argininosuccinate synthase  56.46 
 
 		 407 aa  474  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3356  argininosuccinate synthase  56.71 
 
 		 402 aa  472  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4140  argininosuccinate synthase  54.94 
 
 		 403 aa  462  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0571  argininosuccinate synthase  55.44 
 
 		 401 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0663  argininosuccinate synthase  54.91 
 
 		 410 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  53.28 
 
 		 1496 aa  448  1e-125  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1828  argininosuccinate synthase  53.15 
 
 		 399 aa  443  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2285  argininosuccinate synthase  55.56 
 
 		 408 aa  442  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0179  argininosuccinate synthase  54.81 
 
 		 405 aa  442  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  52.87 
 
 		 403 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0683  argininosuccinate synthase  54.16 
 
 		 403 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1345  argininosuccinate synthase  54.14 
 
 		 404 aa  436  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000339578  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4158  argininosuccinate synthase  53.94 
 
 		 405 aa  437  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0852735  normal  0.163205 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0277  argininosuccinate synthase  54.41 
 
 		 401 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0061  argininosuccinate synthase  53.03 
 
 		 401 aa  429  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2127  argininosuccinate synthase  52.48 
 
 		 406 aa  426  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.263511  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0247  argininosuccinate synthase  52.27 
 
 		 403 aa  426  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1659  argininosuccinate synthase  52.24 
 
 		 411 aa  425  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0344  argininosuccinate synthase  53.71 
 
 		 399 aa  422  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1729  argininosuccinate synthase  51.61 
 
 		 407 aa  424  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.57009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2491  argininosuccinate synthase  51.68 
 
 		 399 aa  423  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2423  argininosuccinate synthase  52.49 
 
 		 409 aa  423  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.106011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1249  argininosuccinate synthase  51.26 
 
 		 403 aa  423  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000123934  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0390  argininosuccinate synthase  52.53 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1533  argininosuccinate synthase  51.36 
 
 		 410 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.535542  normal  0.279557 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1631  argininosuccinate synthase  51.36 
 
 		 412 aa  419  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0894235  hitchhiker  0.00967015 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0914  argininosuccinate synthase  51.12 
 
 		 402 aa  418  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000289862  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0601  argininosuccinate synthase  53.52 
 
 		 402 aa  420  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000197496 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0725  argininosuccinate synthase  53.1 
 
 		 403 aa  420  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.304208  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1099  argininosuccinate synthase  52 
 
 		 408 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1864  argininosuccinate synthase  51.36 
 
 		 412 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0468314  normal  0.0853528 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2698  argininosuccinate synthase  51.66 
 
 		 397 aa  415  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.823792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2588  argininosuccinate synthase  51.74 
 
 		 403 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2293  argininosuccinate synthase  52.48 
 
 		 413 aa  412  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2568  argininosuccinate synthase  52.48 
 
 		 413 aa  412  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0384503 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2417  argininosuccinate synthase  51.39 
 
 		 406 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.20961  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1219  argininosuccinate synthase  52.67 
 
 		 407 aa  414  1e-114  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.099929  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2531  argininosuccinate synthase  52.31 
 
 		 400 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00599814  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1027  argininosuccinate synthase  51.48 
 
 		 409 aa  413  1e-114  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00571105  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2361  argininosuccinate synthase  52.17 
 
 		 397 aa  413  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0152126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1931  argininosuccinate synthase  51.51 
 
 		 407 aa  409  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00337254  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1373  argininosuccinate synthase  52.04 
 
 		 404 aa  409  1e-113  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0310982  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0355  argininosuccinate synthase  51.62 
 
 		 407 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.752574  normal  0.580202 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0609  argininosuccinate synthase  51.99 
 
 		 412 aa  408  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2916  argininosuccinate synthase  52.63 
 
 		 410 aa  409  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_19853  predicted protein  51.39 
 
 		 402 aa  410  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2250  argininosuccinate synthase  51.73 
 
 		 413 aa  409  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137068  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0153  argininosuccinate synthase  50.38 
 
 		 406 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1377  argininosuccinate synthase  53.35 
 
 		 410 aa  407  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0206  argininosuccinate synthase  50.13 
 
 		 406 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000461564 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0228  argininosuccinate synthase  49.87 
 
 		 406 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2452  Argininosuccinate synthase  51.12 
 
 		 404 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341026  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0047  argininosuccinate synthase  52.05 
 
 		 401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3148  argininosuccinate synthase  50.13 
 
 		 405 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0754  argininosuccinate synthase  52.16 
 
 		 406 aa  402  1e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0767  argininosuccinate synthase  51.65 
 
 		 406 aa  403  1e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0680  argininosuccinate synthase  51.52 
 
 		 408 aa  402  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3638  argininosuccinate synthase  48.87 
 
 		 406 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3745  argininosuccinate synthase  49.37 
 
 		 406 aa  405  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1043  argininosuccinate synthase  49.88 
 
 		 407 aa  402  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3751  argininosuccinate synthase  50.25 
 
 		 419 aa  402  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0692  argininosuccinate synthase  51.65 
 
 		 406 aa  403  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0495  argininosuccinate synthase  50.5 
 
 		 405 aa  402  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.337809  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2013  argininosuccinate synthase  50.88 
 
 		 409 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0978065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1334  argininosuccinate synthase  51.65 
 
 		 406 aa  402  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1900  argininosuccinate synthase  51.4 
 
 		 396 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1394  argininosuccinate synthase  49.38 
 
 		 405 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.664295 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2108  argininosuccinate synthase  50 
 
 		 405 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7386  argininosuccinate synthase  51.89 
 
 		 413 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1064  argininosuccinate synthase  50.38 
 
 		 406 aa  401  9.999999999999999e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.269529  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1382  argininosuccinate synthase  51.26 
 
 		 416 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.924271 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1095  argininosuccinate synthase  51.52 
 
 		 401 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.142038  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2270  argininosuccinate synthase  50.38 
 
 		 399 aa  398  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3171  argininosuccinate synthase  48.74 
 
 		 408 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>