More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4273 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0278  argininosuccinate synthase  85.26 
 
 		 407 aa  721    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4092  argininosuccinate synthase  85.22 
 
 		 412 aa  720    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0205  argininosuccinate synthase  90.66 
 
 		 407 aa  772    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0718658 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4273  argininosuccinate synthase  100 
 
 		 407 aa  837    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.898095  normal  0.346198 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4011  argininosuccinate synthase  85.22 
 
 		 412 aa  720    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0253  argininosuccinate synthase  84.03 
 
 		 407 aa  696    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00529  argininosuccinate synthase  75.25 
 
 		 401 aa  638    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0332  argininosuccinate synthase  93.37 
 
 		 408 aa  791    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0979  argininosuccinate synthase  76.88 
 
 		 412 aa  649    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3706  argininosuccinate synthase  85.5 
 
 		 407 aa  723    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0239  argininosuccinate synthase  85.5 
 
 		 407 aa  723    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0194  argininosuccinate synthase  86.24 
 
 		 407 aa  711    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3714  argininosuccinate synthase  85.75 
 
 		 407 aa  727    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3902  argininosuccinate synthase  85.5 
 
 		 407 aa  723    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.940793  normal  0.44318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0230  argininosuccinate synthase  91.56 
 
 		 412 aa  774    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.633621  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0259  argininosuccinate synthase  83.78 
 
 		 407 aa  714    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.803281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0231  argininosuccinate synthase  78.89 
 
 		 402 aa  669    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000109496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4121  argininosuccinate synthase  85.22 
 
 		 412 aa  720    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4210  argininosuccinate synthase  85.47 
 
 		 412 aa  723    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002314  argininosuccinate synthase  74.74 
 
 		 404 aa  615  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.957831  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0463  argininosuccinate synthase  70.69 
 
 		 418 aa  612  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00041  argininosuccinate synthase  73.98 
 
 		 404 aa  608  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2758  argininosuccinate synthase  72.7 
 
 		 403 aa  600  1e-170  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2218  argininosuccinate synthase  71.21 
 
 		 404 aa  582  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4779  argininosuccinate synthase  67 
 
 		 406 aa  578  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4058  argininosuccinate synthase  56.46 
 
 		 407 aa  477  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0795  argininosuccinate synthase  58.79 
 
 		 401 aa  474  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3356  argininosuccinate synthase  55.95 
 
 		 402 aa  473  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4140  argininosuccinate synthase  53.45 
 
 		 403 aa  458  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0571  argininosuccinate synthase  57 
 
 		 401 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0663  argininosuccinate synthase  56.49 
 
 		 410 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1345  argininosuccinate synthase  57.36 
 
 		 404 aa  449  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000339578  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  56.11 
 
 		 1496 aa  451  1e-125  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0179  argininosuccinate synthase  56.96 
 
 		 405 aa  451  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1828  argininosuccinate synthase  53.27 
 
 		 399 aa  432  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0683  argininosuccinate synthase  54.66 
 
 		 403 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0277  argininosuccinate synthase  55.78 
 
 		 401 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  53.28 
 
 		 403 aa  431  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2491  argininosuccinate synthase  52.45 
 
 		 399 aa  429  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2285  argininosuccinate synthase  54.16 
 
 		 408 aa  426  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2423  argininosuccinate synthase  51.96 
 
 		 409 aa  422  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.106011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4158  argininosuccinate synthase  53.55 
 
 		 405 aa  423  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0852735  normal  0.163205 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0061  argininosuccinate synthase  52.53 
 
 		 401 aa  422  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0247  argininosuccinate synthase  52.16 
 
 		 403 aa  419  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1249  argininosuccinate synthase  52.27 
 
 		 403 aa  419  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000123934  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2127  argininosuccinate synthase  53.09 
 
 		 406 aa  418  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.263511  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0390  argininosuccinate synthase  52.78 
 
 		 397 aa  418  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2531  argininosuccinate synthase  53.21 
 
 		 400 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00599814  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2361  argininosuccinate synthase  52.55 
 
 		 397 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0152126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1049  argininosuccinate synthase  52.91 
 
 		 407 aa  415  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2698  argininosuccinate synthase  52.3 
 
 		 397 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.823792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2588  argininosuccinate synthase  52.24 
 
 		 403 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2417  argininosuccinate synthase  51.49 
 
 		 406 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.20961  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0914  argininosuccinate synthase  51.49 
 
 		 402 aa  414  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000289862  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2916  argininosuccinate synthase  52.84 
 
 		 410 aa  414  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1533  argininosuccinate synthase  51.11 
 
 		 410 aa  410  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.535542  normal  0.279557 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_19853  predicted protein  51.26 
 
 		 402 aa  410  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3638  argininosuccinate synthase  50.38 
 
 		 406 aa  411  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0601  argininosuccinate synthase  54 
 
 		 402 aa  410  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000197496 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0692  argininosuccinate synthase  51.51 
 
 		 406 aa  408  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1099  argininosuccinate synthase  51.97 
 
 		 408 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0767  argininosuccinate synthase  51.51 
 
 		 406 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0344  argininosuccinate synthase  53.32 
 
 		 399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3148  argininosuccinate synthase  51.5 
 
 		 405 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3745  argininosuccinate synthase  50.13 
 
 		 406 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1334  argininosuccinate synthase  51.26 
 
 		 406 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0153  argininosuccinate synthase  50.76 
 
 		 406 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1027  argininosuccinate synthase  52.66 
 
 		 409 aa  403  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00571105  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1931  argininosuccinate synthase  51.88 
 
 		 407 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00337254  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1659  argininosuccinate synthase  50.73 
 
 		 411 aa  404  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0206  argininosuccinate synthase  50.51 
 
 		 406 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000461564 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1373  argininosuccinate synthase  52.79 
 
 		 404 aa  404  1e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0310982  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3751  argininosuccinate synthase  50.25 
 
 		 419 aa  404  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1864  argininosuccinate synthase  51.12 
 
 		 412 aa  404  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0468314  normal  0.0853528 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0228  argininosuccinate synthase  50.13 
 
 		 406 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2270  argininosuccinate synthase  50.76 
 
 		 399 aa  403  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1729  argininosuccinate synthase  49.5 
 
 		 407 aa  403  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.57009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0725  argininosuccinate synthase  51.87 
 
 		 403 aa  402  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.304208  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1394  argininosuccinate synthase  51.11 
 
 		 405 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.664295 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1377  argininosuccinate synthase  51.65 
 
 		 410 aa  399  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1622  argininosuccinate synthase  50.99 
 
 		 405 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00134855  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1631  argininosuccinate synthase  50.87 
 
 		 412 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0894235  hitchhiker  0.00967015 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1043  argininosuccinate synthase  50.62 
 
 		 407 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18740  argininosuccinate synthase  50.99 
 
 		 405 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00166387  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3171  argininosuccinate synthase  49.25 
 
 		 408 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1900  argininosuccinate synthase  51.26 
 
 		 396 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1088  argininosuccinate synthase  50.99 
 
 		 405 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4324  argininosuccinate synthase  51.24 
 
 		 405 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1129  argininosuccinate synthase  50.99 
 
 		 405 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.504857  normal  0.904376 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2452  Argininosuccinate synthase  50.49 
 
 		 404 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341026  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1117  argininosuccinate synthase  50.99 
 
 		 405 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2108  argininosuccinate synthase  51.73 
 
 		 405 aa  396  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4517  argininosuccinate synthase  50.74 
 
 		 405 aa  398  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0047  argininosuccinate synthase  49.5 
 
 		 401 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4155  argininosuccinate synthase  49.88 
 
 		 405 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3892  argininosuccinate synthase  50.12 
 
 		 405 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.141657 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3472  argininosuccinate synthase  51.12 
 
 		 406 aa  393  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2970  argininosuccinate synthase  50.38 
 
 		 405 aa  393  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0355  argininosuccinate synthase  49.88 
 
 		 407 aa  395  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.752574  normal  0.580202 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2250  argininosuccinate synthase  48.54 
 
 		 413 aa  391  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137068  normal  0.557536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>