More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0979 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0463  argininosuccinate synthase  77.94 
 
 		 418 aa  673    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0278  argininosuccinate synthase  76.77 
 
 		 407 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4273  argininosuccinate synthase  76.88 
 
 		 407 aa  649    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.898095  normal  0.346198 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3714  argininosuccinate synthase  76.77 
 
 		 407 aa  644    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4011  argininosuccinate synthase  76.18 
 
 		 412 aa  651    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4210  argininosuccinate synthase  76.18 
 
 		 412 aa  652    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0253  argininosuccinate synthase  75.96 
 
 		 407 aa  637    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00529  argininosuccinate synthase  88.25 
 
 		 401 aa  746    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0205  argininosuccinate synthase  76.25 
 
 		 407 aa  652    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0718658 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0979  argininosuccinate synthase  100 
 
 		 412 aa  853    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0332  argininosuccinate synthase  76.18 
 
 		 408 aa  654    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3706  argininosuccinate synthase  76.77 
 
 		 407 aa  645    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0239  argininosuccinate synthase  76.77 
 
 		 407 aa  645    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0194  argininosuccinate synthase  78.01 
 
 		 407 aa  649    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4092  argininosuccinate synthase  76.18 
 
 		 412 aa  651    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3902  argininosuccinate synthase  76.77 
 
 		 407 aa  645    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.940793  normal  0.44318 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4121  argininosuccinate synthase  76.18 
 
 		 412 aa  651    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0259  argininosuccinate synthase  77.25 
 
 		 407 aa  654    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.803281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0230  argininosuccinate synthase  77.64 
 
 		 412 aa  657    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.633621  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0231  argininosuccinate synthase  73.45 
 
 		 402 aa  621  1e-177  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000109496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002314  argininosuccinate synthase  72.89 
 
 		 404 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.957831  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00041  argininosuccinate synthase  72.64 
 
 		 404 aa  605  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2758  argininosuccinate synthase  72.63 
 
 		 403 aa  604  9.999999999999999e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2218  argininosuccinate synthase  70.57 
 
 		 404 aa  590  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4779  argininosuccinate synthase  67.41 
 
 		 406 aa  583  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0795  argininosuccinate synthase  59.9 
 
 		 401 aa  484  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4058  argininosuccinate synthase  56 
 
 		 407 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0571  argininosuccinate synthase  56.42 
 
 		 401 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3356  argininosuccinate synthase  55.5 
 
 		 402 aa  463  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4140  argininosuccinate synthase  53.75 
 
 		 403 aa  462  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0179  argininosuccinate synthase  57.18 
 
 		 405 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0663  argininosuccinate synthase  55.98 
 
 		 410 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1345  argininosuccinate synthase  57.14 
 
 		 404 aa  448  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000339578  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1828  argininosuccinate synthase  54.18 
 
 		 399 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  54.34 
 
 		 1496 aa  447  1.0000000000000001e-124  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0683  argininosuccinate synthase  55.56 
 
 		 403 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  54 
 
 		 403 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0277  argininosuccinate synthase  56.35 
 
 		 401 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4158  argininosuccinate synthase  55.22 
 
 		 405 aa  444  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0852735  normal  0.163205 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1729  argininosuccinate synthase  52.68 
 
 		 407 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.57009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2285  argininosuccinate synthase  55.05 
 
 		 408 aa  439  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2127  argininosuccinate synthase  54.52 
 
 		 406 aa  439  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.263511  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0061  argininosuccinate synthase  53.92 
 
 		 401 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0247  argininosuccinate synthase  54.34 
 
 		 403 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1659  argininosuccinate synthase  53.87 
 
 		 411 aa  436  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2491  argininosuccinate synthase  53.77 
 
 		 399 aa  434  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1249  argininosuccinate synthase  52.91 
 
 		 403 aa  434  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000123934  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2698  argininosuccinate synthase  52.94 
 
 		 397 aa  428  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.823792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2417  argininosuccinate synthase  53.09 
 
 		 406 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.20961  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2531  argininosuccinate synthase  54.36 
 
 		 400 aa  428  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00599814  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2423  argininosuccinate synthase  52.87 
 
 		 409 aa  431  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.106011  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1099  argininosuccinate synthase  51.71 
 
 		 408 aa  425  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3751  argininosuccinate synthase  51.24 
 
 		 419 aa  425  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2361  argininosuccinate synthase  53.71 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0152126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1027  argininosuccinate synthase  52.72 
 
 		 409 aa  426  1e-118  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00571105  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1049  argininosuccinate synthase  53.9 
 
 		 407 aa  426  1e-118  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1533  argininosuccinate synthase  51.73 
 
 		 410 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.535542  normal  0.279557 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0914  argininosuccinate synthase  52.14 
 
 		 402 aa  423  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000289862  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2588  argininosuccinate synthase  52.78 
 
 		 403 aa  422  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0344  argininosuccinate synthase  53.44 
 
 		 399 aa  419  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0390  argininosuccinate synthase  52.79 
 
 		 397 aa  421  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1631  argininosuccinate synthase  51.74 
 
 		 412 aa  421  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0894235  hitchhiker  0.00967015 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_19853  predicted protein  51.39 
 
 		 402 aa  421  1e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1377  argininosuccinate synthase  54.26 
 
 		 410 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2293  argininosuccinate synthase  52.33 
 
 		 413 aa  419  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3148  argininosuccinate synthase  51.26 
 
 		 405 aa  420  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1219  argininosuccinate synthase  52.49 
 
 		 407 aa  421  1e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.099929  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1373  argininosuccinate synthase  52.42 
 
 		 404 aa  419  1e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0310982  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0228  argininosuccinate synthase  50.75 
 
 		 406 aa  420  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3638  argininosuccinate synthase  50.25 
 
 		 406 aa  421  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1864  argininosuccinate synthase  51.74 
 
 		 412 aa  420  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0468314  normal  0.0853528 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0601  argininosuccinate synthase  53.15 
 
 		 402 aa  419  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000197496 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2916  argininosuccinate synthase  52.99 
 
 		 410 aa  419  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3745  argininosuccinate synthase  50.25 
 
 		 406 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0153  argininosuccinate synthase  50.63 
 
 		 406 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0767  argininosuccinate synthase  51.74 
 
 		 406 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1931  argininosuccinate synthase  52.64 
 
 		 407 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00337254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0206  argininosuccinate synthase  50.63 
 
 		 406 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000461564 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2568  argininosuccinate synthase  52.09 
 
 		 413 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0384503 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0047  argininosuccinate synthase  52.3 
 
 		 401 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2270  argininosuccinate synthase  52.27 
 
 		 399 aa  416  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1334  argininosuccinate synthase  51.49 
 
 		 406 aa  415  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0725  argininosuccinate synthase  52.99 
 
 		 403 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.304208  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0692  argininosuccinate synthase  51.74 
 
 		 406 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1064  argininosuccinate synthase  50.25 
 
 		 406 aa  414  1e-114  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.269529  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0609  argininosuccinate synthase  51.97 
 
 		 412 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0680  argininosuccinate synthase  52.12 
 
 		 408 aa  414  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2250  argininosuccinate synthase  51.98 
 
 		 413 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137068  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0754  argininosuccinate synthase  52.24 
 
 		 406 aa  412  1e-114  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0355  argininosuccinate synthase  52.74 
 
 		 407 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.752574  normal  0.580202 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3171  argininosuccinate synthase  49.87 
 
 		 408 aa  412  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1394  argininosuccinate synthase  50.38 
 
 		 405 aa  408  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.664295 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2452  Argininosuccinate synthase  51.39 
 
 		 404 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341026  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1043  argininosuccinate synthase  50.5 
 
 		 407 aa  410  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2067  argininosuccinate synthase  52.17 
 
 		 414 aa  409  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1900  argininosuccinate synthase  52.82 
 
 		 396 aa  411  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3206  argininosuccinate synthase  50.38 
 
 		 408 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1095  argininosuccinate synthase  52.66 
 
 		 401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.142038  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2013  argininosuccinate synthase  51.64 
 
 		 409 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0978065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0756  argininosuccinate synthase  50.88 
 
 		 408 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.589205  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>