More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1931 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1931  argininosuccinate synthase  100 
 
 		 407 aa  837    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00337254  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1049  argininosuccinate synthase  66.83 
 
 		 407 aa  557  1e-157  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0277  argininosuccinate synthase  64.05 
 
 		 401 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0179  argininosuccinate synthase  62.81 
 
 		 405 aa  522  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0795  argininosuccinate synthase  63.38 
 
 		 401 aa  511  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1345  argininosuccinate synthase  60.9 
 
 		 404 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000339578  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0571  argininosuccinate synthase  62.53 
 
 		 401 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0663  argininosuccinate synthase  60.86 
 
 		 410 aa  500  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1249  argininosuccinate synthase  60 
 
 		 403 aa  496  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000123934  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2285  argininosuccinate synthase  59.8 
 
 		 408 aa  493  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0683  argininosuccinate synthase  60.65 
 
 		 403 aa  491  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1828  argininosuccinate synthase  56.89 
 
 		 399 aa  476  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2270  argininosuccinate synthase  58.15 
 
 		 399 aa  476  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  57.28 
 
 		 1496 aa  477  1e-133  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0344  argininosuccinate synthase  56.35 
 
 		 399 aa  450  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4158  argininosuccinate synthase  55.28 
 
 		 405 aa  448  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0852735  normal  0.163205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4058  argininosuccinate synthase  55.05 
 
 		 407 aa  450  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3356  argininosuccinate synthase  53.79 
 
 		 402 aa  445  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0247  argininosuccinate synthase  55.08 
 
 		 403 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0556  argininosuccinate synthase  52.03 
 
 		 405 aa  427  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0532  argininosuccinate synthase  52.15 
 
 		 405 aa  426  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0923  argininosuccinate synthase  53.16 
 
 		 404 aa  417  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.909799  hitchhiker  0.00000000000000121809 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0979  argininosuccinate synthase  52.64 
 
 		 412 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1729  argininosuccinate synthase  52.04 
 
 		 407 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.57009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4140  argininosuccinate synthase  50.13 
 
 		 403 aa  411  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2491  argininosuccinate synthase  50.52 
 
 		 399 aa  409  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00529  argininosuccinate synthase  51.51 
 
 		 401 aa  409  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0278  argininosuccinate synthase  52.26 
 
 		 407 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2531  argininosuccinate synthase  50.89 
 
 		 400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00599814  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3714  argininosuccinate synthase  52.01 
 
 		 407 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0230  argininosuccinate synthase  52.39 
 
 		 412 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.633621  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1659  argininosuccinate synthase  51.75 
 
 		 411 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4779  argininosuccinate synthase  51.76 
 
 		 406 aa  407  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1900  argininosuccinate synthase  49.74 
 
 		 396 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4121  argininosuccinate synthase  51.24 
 
 		 412 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0205  argininosuccinate synthase  51.5 
 
 		 407 aa  403  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0718658 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4210  argininosuccinate synthase  51.24 
 
 		 412 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4273  argininosuccinate synthase  51.88 
 
 		 407 aa  404  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.898095  normal  0.346198 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4092  argininosuccinate synthase  51.24 
 
 		 412 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3706  argininosuccinate synthase  52.01 
 
 		 407 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0239  argininosuccinate synthase  52.01 
 
 		 407 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4011  argininosuccinate synthase  51.24 
 
 		 412 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0047  argininosuccinate synthase  49.5 
 
 		 401 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3902  argininosuccinate synthase  52.01 
 
 		 407 aa  404  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.940793  normal  0.44318 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0332  argininosuccinate synthase  51.01 
 
 		 408 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00041  argininosuccinate synthase  53.32 
 
 		 404 aa  398  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0688  argininosuccinate synthase  50.75 
 
 		 408 aa  399  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002314  argininosuccinate synthase  53.57 
 
 		 404 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.957831  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0259  argininosuccinate synthase  50.88 
 
 		 407 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.803281  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0463  argininosuccinate synthase  50.73 
 
 		 418 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2218  argininosuccinate synthase  53.06 
 
 		 404 aa  397  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2417  argininosuccinate synthase  50 
 
 		 406 aa  395  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.20961  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2758  argininosuccinate synthase  52.3 
 
 		 403 aa  397  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0487  argininosuccinate synthase  49 
 
 		 410 aa  397  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00571423  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0253  argininosuccinate synthase  51.52 
 
 		 407 aa  397  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0194  argininosuccinate synthase  51.52 
 
 		 407 aa  396  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2361  argininosuccinate synthase  50.25 
 
 		 397 aa  395  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0152126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0777  argininosuccinate synthase  49.11 
 
 		 399 aa  394  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0914  argininosuccinate synthase  50.5 
 
 		 402 aa  394  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000289862  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3751  argininosuccinate synthase  49.25 
 
 		 419 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1064  argininosuccinate synthase  50.89 
 
 		 406 aa  393  1e-108  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.269529  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1708  argininosuccinate synthase  50.87 
 
 		 406 aa  395  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0472214  hitchhiker  0.00281031 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1864  argininosuccinate synthase  50 
 
 		 412 aa  392  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0468314  normal  0.0853528 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2698  argininosuccinate synthase  50.25 
 
 		 397 aa  389  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.823792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0760  argininosuccinate synthase  50.89 
 
 		 406 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2067  argininosuccinate synthase  49.12 
 
 		 414 aa  390  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2916  argininosuccinate synthase  48.65 
 
 		 410 aa  390  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  49.37 
 
 		 403 aa  389  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0061  argininosuccinate synthase  47.98 
 
 		 401 aa  389  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0559  Argininosuccinate synthase  48.69 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.487039 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0231  argininosuccinate synthase  49.5 
 
 		 402 aa  390  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000109496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1533  argininosuccinate synthase  48.63 
 
 		 410 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.535542  normal  0.279557 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2013  argininosuccinate synthase  49.88 
 
 		 409 aa  388  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0978065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1631  argininosuccinate synthase  49.26 
 
 		 412 aa  385  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0894235  hitchhiker  0.00967015 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1332  argininosuccinate synthase  46.91 
 
 		 402 aa  388  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00292839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3472  argininosuccinate synthase  49.38 
 
 		 406 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4763  argininosuccinate synthase  49.13 
 
 		 407 aa  385  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2127  argininosuccinate synthase  50.37 
 
 		 406 aa  385  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.263511  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1071  argininosuccinate synthase  47.46 
 
 		 401 aa  385  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3742  argininosuccinate synthase  48.37 
 
 		 407 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000983467 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3171  argininosuccinate synthase  48.15 
 
 		 408 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0767  argininosuccinate synthase  50.63 
 
 		 406 aa  383  1e-105  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3031  argininosuccinate synthase  50.99 
 
 		 468 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.526147  normal  0.562744 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1849  argininosuccinate synthase  49.5 
 
 		 409 aa  382  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2803  argininosuccinate synthase  49.37 
 
 		 409 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.953161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1044  argininosuccinate synthase  47.46 
 
 		 400 aa  383  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0228  argininosuccinate synthase  47.16 
 
 		 406 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3623  argininosuccinate synthase  49.37 
 
 		 409 aa  382  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.724533  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0692  argininosuccinate synthase  50.38 
 
 		 406 aa  382  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3331  argininosuccinate synthase  47.19 
 
 		 409 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2588  argininosuccinate synthase  49.37 
 
 		 403 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1334  argininosuccinate synthase  50.13 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2452  Argininosuccinate synthase  48.39 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341026  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2537  argininosuccinate synthase  47.98 
 
 		 403 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.994167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2293  argininosuccinate synthase  48.64 
 
 		 413 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2568  argininosuccinate synthase  48.64 
 
 		 413 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0384503 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3638  argininosuccinate synthase  46.8 
 
 		 406 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3745  argininosuccinate synthase  46.8 
 
 		 406 aa  378  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0067  argininosuccinate synthase  49.13 
 
 		 407 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2231  argininosuccinate synthase  47.38 
 
 		 404 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>