More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0683 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0683  argininosuccinate synthase  100 
 
 		 403 aa  822    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0179  argininosuccinate synthase  68.58 
 
 		 405 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0795  argininosuccinate synthase  67.84 
 
 		 401 aa  558  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1345  argininosuccinate synthase  65.82 
 
 		 404 aa  553  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000339578  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  64.9 
 
 		 1496 aa  539  9.999999999999999e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0277  argininosuccinate synthase  64.14 
 
 		 401 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0571  argininosuccinate synthase  64.9 
 
 		 401 aa  537  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0663  argininosuccinate synthase  63.07 
 
 		 410 aa  528  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1249  argininosuccinate synthase  63.75 
 
 		 403 aa  523  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000123934  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1049  argininosuccinate synthase  61.6 
 
 		 407 aa  518  1e-146  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2285  argininosuccinate synthase  62.37 
 
 		 408 aa  520  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3356  argininosuccinate synthase  58.73 
 
 		 402 aa  492  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1931  argininosuccinate synthase  60.65 
 
 		 407 aa  491  9.999999999999999e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00337254  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4058  argininosuccinate synthase  59.49 
 
 		 407 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0344  argininosuccinate synthase  57.58 
 
 		 399 aa  484  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4140  argininosuccinate synthase  57.14 
 
 		 403 aa  485  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1828  argininosuccinate synthase  55.87 
 
 		 399 aa  483  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2270  argininosuccinate synthase  57 
 
 		 399 aa  465  9.999999999999999e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4158  argininosuccinate synthase  56.27 
 
 		 405 aa  461  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0852735  normal  0.163205 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2531  argininosuccinate synthase  53.08 
 
 		 400 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00599814  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0923  argininosuccinate synthase  57.44 
 
 		 404 aa  454  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.909799  hitchhiker  0.00000000000000121809 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1729  argininosuccinate synthase  54.76 
 
 		 407 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.57009  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0556  argininosuccinate synthase  53.98 
 
 		 405 aa  445  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0532  argininosuccinate synthase  53.5 
 
 		 405 aa  445  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0979  argininosuccinate synthase  55.56 
 
 		 412 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0247  argininosuccinate synthase  54.62 
 
 		 403 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0047  argininosuccinate synthase  52.19 
 
 		 401 aa  443  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1900  argininosuccinate synthase  52.31 
 
 		 396 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0278  argininosuccinate synthase  54.41 
 
 		 407 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00529  argininosuccinate synthase  54.16 
 
 		 401 aa  441  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4210  argininosuccinate synthase  54.45 
 
 		 412 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0230  argininosuccinate synthase  54.39 
 
 		 412 aa  437  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.633621  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3714  argininosuccinate synthase  54.41 
 
 		 407 aa  435  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3706  argininosuccinate synthase  54.41 
 
 		 407 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0239  argininosuccinate synthase  54.41 
 
 		 407 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3902  argininosuccinate synthase  54.41 
 
 		 407 aa  436  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.940793  normal  0.44318 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02900  Argininosuccinate synthase  52.49 
 
 		 413 aa  435  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0259  argininosuccinate synthase  53.94 
 
 		 407 aa  435  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.803281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4092  argininosuccinate synthase  54.45 
 
 		 412 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4273  argininosuccinate synthase  54.66 
 
 		 407 aa  432  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.898095  normal  0.346198 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3751  argininosuccinate synthase  53.22 
 
 		 419 aa  431  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4011  argininosuccinate synthase  54.45 
 
 		 412 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0194  argininosuccinate synthase  54.1 
 
 		 407 aa  432  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4121  argininosuccinate synthase  54.45 
 
 		 412 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0332  argininosuccinate synthase  54.45 
 
 		 408 aa  431  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0253  argininosuccinate synthase  53.85 
 
 		 407 aa  428  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0487  argininosuccinate synthase  53.57 
 
 		 410 aa  430  1e-119  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00571423  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0228  argininosuccinate synthase  51.36 
 
 		 406 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3745  argininosuccinate synthase  51.12 
 
 		 406 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3638  argininosuccinate synthase  51.36 
 
 		 406 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0067  argininosuccinate synthase  51.97 
 
 		 407 aa  427  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002314  argininosuccinate synthase  54.45 
 
 		 404 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.957831  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1095  argininosuccinate synthase  51.24 
 
 		 401 aa  426  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.142038  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2361  argininosuccinate synthase  53.28 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0152126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0205  argininosuccinate synthase  53.94 
 
 		 407 aa  427  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0718658 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3472  argininosuccinate synthase  53.3 
 
 		 406 aa  424  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1377  argininosuccinate synthase  53.61 
 
 		 410 aa  423  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2916  argininosuccinate synthase  50.87 
 
 		 410 aa  422  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2698  argininosuccinate synthase  52.02 
 
 		 397 aa  420  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.823792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00041  argininosuccinate synthase  53.94 
 
 		 404 aa  420  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2491  argininosuccinate synthase  50.65 
 
 		 399 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0463  argininosuccinate synthase  52.33 
 
 		 418 aa  416  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2650  argininosuccinate synthase  51.77 
 
 		 408 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1659  argininosuccinate synthase  51.24 
 
 		 411 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2218  argininosuccinate synthase  52.84 
 
 		 404 aa  418  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1976  argininosuccinate synthase  51.51 
 
 		 419 aa  413  1e-114  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1212  argininosuccinate synthase  51.77 
 
 		 408 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2417  argininosuccinate synthase  52.9 
 
 		 406 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.20961  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1373  argininosuccinate synthase  51.12 
 
 		 404 aa  414  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0310982  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1708  argininosuccinate synthase  50.74 
 
 		 406 aa  412  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0472214  hitchhiker  0.00281031 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2873  argininosuccinate synthase  51.77 
 
 		 408 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4779  argininosuccinate synthase  50.63 
 
 		 406 aa  414  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0355  argininosuccinate synthase  50.62 
 
 		 407 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.752574  normal  0.580202 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0153  argininosuccinate synthase  49.88 
 
 		 406 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2758  argininosuccinate synthase  52.32 
 
 		 403 aa  411  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1064  argininosuccinate synthase  51.11 
 
 		 406 aa  410  1e-113  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.269529  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1849  argininosuccinate synthase  49.88 
 
 		 409 aa  408  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1027  argininosuccinate synthase  51 
 
 		 409 aa  408  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00571105  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3148  argininosuccinate synthase  49.88 
 
 		 405 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  51.28 
 
 		 403 aa  409  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0495  argininosuccinate synthase  51.92 
 
 		 405 aa  410  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.337809  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3344  argininosuccinate synthase  52.81 
 
 		 419 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2250  argininosuccinate synthase  51.65 
 
 		 413 aa  409  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137068  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0725  argininosuccinate synthase  51.12 
 
 		 403 aa  409  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.304208  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0231  argininosuccinate synthase  50.12 
 
 		 402 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000109496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0754  argininosuccinate synthase  51.6 
 
 		 406 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4161  argininosuccinate synthase  52.42 
 
 		 409 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3031  argininosuccinate synthase  50 
 
 		 468 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.526147  normal  0.562744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2568  argininosuccinate synthase  51.39 
 
 		 413 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0384503 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2293  argininosuccinate synthase  51.39 
 
 		 413 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0206  argininosuccinate synthase  49.38 
 
 		 406 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000461564 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0914  argininosuccinate synthase  50.25 
 
 		 402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000289862  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1273  argininosuccinate synthase  49.88 
 
 		 426 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0227151 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0390  argininosuccinate synthase  49.49 
 
 		 397 aa  405  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1219  argininosuccinate synthase  50.49 
 
 		 407 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.099929  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0499  argininosuccinate synthase  51.79 
 
 		 408 aa  405  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3331  argininosuccinate synthase  50 
 
 		 409 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0559  Argininosuccinate synthase  50.48 
 
 		 430 aa  401  1e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.487039 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0692  argininosuccinate synthase  51.12 
 
 		 406 aa  402  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2588  argininosuccinate synthase  48.51 
 
 		 403 aa  403  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>