More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2970 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1382  argininosuccinate synthase  79.8 
 
 		 416 aa  669    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.924271 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3472  argininosuccinate synthase  79.26 
 
 		 406 aa  660    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2803  argininosuccinate synthase  79.7 
 
 		 409 aa  660    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.953161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7386  argininosuccinate synthase  78.62 
 
 		 413 aa  657    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1212  argininosuccinate synthase  75.56 
 
 		 408 aa  641    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0609  argininosuccinate synthase  79.21 
 
 		 412 aa  666    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4763  argininosuccinate synthase  75.87 
 
 		 407 aa  638    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1195  argininosuccinate synthase  86.67 
 
 		 404 aa  701    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2873  argininosuccinate synthase  75.56 
 
 		 408 aa  641    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2293  argininosuccinate synthase  79.35 
 
 		 413 aa  661    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3623  argininosuccinate synthase  78.95 
 
 		 409 aa  655    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.724533  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2883  argininosuccinate synthase  76.54 
 
 		 407 aa  649    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0495  argininosuccinate synthase  85.61 
 
 		 405 aa  714    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.337809  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2250  argininosuccinate synthase  80.1 
 
 		 413 aa  664    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137068  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2013  argininosuccinate synthase  79.75 
 
 		 409 aa  674    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0978065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6641  argininosuccinate synthase  79.7 
 
 		 413 aa  656    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.453364  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2568  argininosuccinate synthase  79.1 
 
 		 413 aa  659    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0384503 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2650  argininosuccinate synthase  75.31 
 
 		 408 aa  638    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2970  argininosuccinate synthase  100 
 
 		 405 aa  828    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0499  argininosuccinate synthase  77.09 
 
 		 408 aa  652    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1273  argininosuccinate synthase  78.7 
 
 		 426 aa  659    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0227151 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1377  argininosuccinate synthase  77.26 
 
 		 410 aa  627  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0074  argininosuccinate synthase  73.57 
 
 		 406 aa  616  1e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0086  argininosuccinate synthase  74.06 
 
 		 412 aa  616  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.509496  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0067  argininosuccinate synthase  73.95 
 
 		 407 aa  615  1e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2916  argininosuccinate synthase  75.87 
 
 		 410 aa  616  1e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0073  argininosuccinate synthase  73.57 
 
 		 406 aa  616  1e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0747  argininosuccinate synthase  75.31 
 
 		 409 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3063  argininosuccinate synthase  73.32 
 
 		 405 aa  609  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0084  argininosuccinate synthase  73.71 
 
 		 409 aa  610  1e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0882429  normal  0.0155281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3344  argininosuccinate synthase  74.25 
 
 		 419 aa  610  1e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3718  argininosuccinate synthase  72.07 
 
 		 407 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4161  argininosuccinate synthase  72.57 
 
 		 409 aa  607  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4040  argininosuccinate synthase  72.07 
 
 		 407 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1361  argininosuccinate synthase  72.07 
 
 		 407 aa  594  1e-169  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.515773  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2537  argininosuccinate synthase  69.88 
 
 		 403 aa  590  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.994167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2231  argininosuccinate synthase  69.65 
 
 		 404 aa  587  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3331  argininosuccinate synthase  69.33 
 
 		 409 aa  582  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3751  argininosuccinate synthase  69.95 
 
 		 419 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_19853  predicted protein  70.48 
 
 		 402 aa  579  1e-164  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1043  argininosuccinate synthase  70.93 
 
 		 407 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1533  argininosuccinate synthase  67.99 
 
 		 410 aa  573  1.0000000000000001e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.535542  normal  0.279557 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0725  argininosuccinate synthase  69.38 
 
 		 403 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.304208  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1753  argininosuccinate synthase  70.18 
 
 		 410 aa  569  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.233709  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2674  argininosuccinate synthase  70 
 
 		 409 aa  565  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2423  argininosuccinate synthase  67.41 
 
 		 409 aa  564  1e-160  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.106011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0601  argininosuccinate synthase  67.99 
 
 		 402 aa  567  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000197496 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1027  argininosuccinate synthase  69.5 
 
 		 409 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00571105  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1659  argininosuccinate synthase  66.08 
 
 		 411 aa  563  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0756  argininosuccinate synthase  69.42 
 
 		 408 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.589205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1468  argininosuccinate synthase  68.92 
 
 		 410 aa  561  1.0000000000000001e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0853487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3742  argininosuccinate synthase  69.11 
 
 		 407 aa  564  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000983467 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0914  argininosuccinate synthase  65.92 
 
 		 402 aa  559  1e-158  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000289862  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3206  argininosuccinate synthase  68.67 
 
 		 408 aa  558  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1099  argininosuccinate synthase  67.41 
 
 		 408 aa  556  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1849  argininosuccinate synthase  67.32 
 
 		 409 aa  557  1e-157  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4517  argininosuccinate synthase  67.16 
 
 		 405 aa  555  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1219  argininosuccinate synthase  68.32 
 
 		 407 aa  556  1e-157  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.099929  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1373  argininosuccinate synthase  67.92 
 
 		 404 aa  555  1e-157  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0310982  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2127  argininosuccinate synthase  66.17 
 
 		 406 aa  557  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.263511  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4324  argininosuccinate synthase  67.41 
 
 		 405 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2452  Argininosuccinate synthase  67.91 
 
 		 404 aa  556  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341026  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1088  argininosuccinate synthase  66.92 
 
 		 405 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1129  argininosuccinate synthase  66.92 
 
 		 405 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.504857  normal  0.904376 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3031  argininosuccinate synthase  66.34 
 
 		 468 aa  553  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.526147  normal  0.562744 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1622  argininosuccinate synthase  66.67 
 
 		 405 aa  551  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00134855  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18740  argininosuccinate synthase  66.67 
 
 		 405 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00166387  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1394  argininosuccinate synthase  67.34 
 
 		 405 aa  553  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.664295 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0355  argininosuccinate synthase  67.49 
 
 		 407 aa  553  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.752574  normal  0.580202 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2588  argininosuccinate synthase  66.58 
 
 		 403 aa  551  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4155  argininosuccinate synthase  66.92 
 
 		 405 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3892  argininosuccinate synthase  66.92 
 
 		 405 aa  549  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.141657 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2108  argininosuccinate synthase  67.67 
 
 		 405 aa  550  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1117  argininosuccinate synthase  66.92 
 
 		 405 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0767  argininosuccinate synthase  66.67 
 
 		 406 aa  546  1e-154  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0680  argininosuccinate synthase  68.09 
 
 		 408 aa  547  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1708  argininosuccinate synthase  68 
 
 		 406 aa  546  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0472214  hitchhiker  0.00281031 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1976  argininosuccinate synthase  67.84 
 
 		 419 aa  545  1e-154  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0692  argininosuccinate synthase  66.67 
 
 		 406 aa  547  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0842  argininosuccinate synthase  66.34 
 
 		 407 aa  547  1e-154  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00643097  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14080  argininosuccinate synthase  67.34 
 
 		 406 aa  545  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00581538  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1334  argininosuccinate synthase  66.67 
 
 		 406 aa  546  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1631  argininosuccinate synthase  64.25 
 
 		 412 aa  542  1e-153  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0894235  hitchhiker  0.00967015 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1864  argininosuccinate synthase  64.25 
 
 		 412 aa  543  1e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0468314  normal  0.0853528 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0568  Argininosuccinate synthase  67.33 
 
 		 399 aa  534  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0404  argininosuccinate synthase  67.33 
 
 		 399 aa  534  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1064  argininosuccinate synthase  64.36 
 
 		 406 aa  530  1e-149  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.269529  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0754  argininosuccinate synthase  65.1 
 
 		 406 aa  528  1e-149  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0247  argininosuccinate synthase  64.99 
 
 		 403 aa  525  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2491  argininosuccinate synthase  64.54 
 
 		 399 aa  520  1e-146  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0228  argininosuccinate synthase  62.47 
 
 		 406 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0367  argininosuccinate synthase  65.06 
 
 		 393 aa  508  1e-143  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3745  argininosuccinate synthase  62.22 
 
 		 406 aa  510  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3638  argininosuccinate synthase  62.22 
 
 		 406 aa  511  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1729  argininosuccinate synthase  62.69 
 
 		 407 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.57009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0680  argininosuccinate synthase  64.56 
 
 		 393 aa  504  9.999999999999999e-143  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.90622  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3171  argininosuccinate synthase  61.46 
 
 		 408 aa  504  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1900  argininosuccinate synthase  62.72 
 
 		 396 aa  501  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2531  argininosuccinate synthase  61.5 
 
 		 400 aa  500  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00599814  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2067  argininosuccinate synthase  61.25 
 
 		 414 aa  500  1e-140  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.369104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>