More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2023 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2023  translation initiation factor 2, alpha subunit  100 
 
 		 266 aa  519  1e-146  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1802  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  65.66 
 
 		 256 aa  352  4e-96  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0642  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  40.91 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000204722  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0703  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  37.84 
 
 		 262 aa  166  5e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1359  translation initiation factor 2, alpha subunit  37.35 
 
 		 277 aa  165  5.9999999999999996e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.256809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  36.95 
 
 		 265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1699  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  36.33 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.328913  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0964  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  36.73 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.497618  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0995  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  38.67 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0982  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  36.33 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1687  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  36.5 
 
 		 264 aa  158  1e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.640158  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0433  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  36.33 
 
 		 264 aa  158  1e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1152  translation initiation factor 2, alpha subunit  34.92 
 
 		 254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1783  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  36.73 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.030089 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1567  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  34.4 
 
 		 268 aa  148  7e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0416  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  31.8 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.131172  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1128  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  32.53 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1299  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  33.19 
 
 		 257 aa  125  7e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0957  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  32.07 
 
 		 261 aa  125  9e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.652274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1396  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  33.05 
 
 		 265 aa  122  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1951  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  31.01 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.612676 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2051  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  29.39 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2502  translation initiation factor 2, alpha subunit  28.75 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0870  translation initiation factor 2, alpha subunit  27.57 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0077  RNA-binding S1 domain-containing protein  29.22 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.541121 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2790  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  30.13 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.289487  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2880  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.29 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.651055  normal  0.408906 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.15 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00230  eukaryotic translation initiation factor 2 alpha subunit, putative  23.75 
 
 		 300 aa  89.4  5e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.433033  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34538  predicted protein  28.47 
 
 		 320 aa  87  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000454395  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03156  translation initiation factor eIF2 alpha subunit (Eurofung)  25.11 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119592  Eukaryotic translation initiation factor 2, alpha subunit  24.81 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0150821  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1301  RNA binding S1 domain protein  31.3 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000152887  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1607  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.18 
 
 		 365 aa  55.5  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00859677  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1593  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.49 
 
 		 697 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.029457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1167  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.04 
 
 		 721 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.859366  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1235  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.04 
 
 		 721 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.434132  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1308  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.78 
 
 		 696 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00697732  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1107  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.04 
 
 		 749 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.583336  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2976  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.78 
 
 		 696 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.31401e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2145  ribosomal protein S1  37.97 
 
 		 573 aa  53.1  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000142665  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1591  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.78 
 
 		 697 aa  52.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274375  normal  0.0293067 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1146  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.48 
 
 		 722 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119982  normal  0.231253 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1906  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.78 
 
 		 696 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000617154  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3006  general stress protein 13  32.95 
 
 		 124 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1102  30S ribosomal protein S1  35.9 
 
 		 401 aa  50.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000946853  normal  0.0119462 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0696  hypothetical protein  34.74 
 
 		 140 aa  50.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000983919  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0747  RNA binding S1 domain protein  34.67 
 
 		 699 aa  49.7  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.338297  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  37.18 
 
 		 579 aa  49.7  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1535  30S ribosomal protein S1  32.61 
 
 		 555 aa  49.3  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00152799  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0981  RNA-binding S1 domain-containing protein  32.73 
 
 		 124 aa  49.3  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000445297  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0931  30S ribosomal protein S1  33.33 
 
 		 561 aa  49.3  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0642  30S ribosomal protein S1  32.61 
 
 		 551 aa  49.3  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000269635  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0092  RNA binding S1  37.8 
 
 		 130 aa  49.3  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000304617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0563  30S ribosomal protein S1  34.62 
 
 		 560 aa  48.9  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.647894  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1292  SSU ribosomal protein S1P  36.49 
 
 		 396 aa  48.9  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00025498  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4661  SSU ribosomal protein S1P  32.91 
 
 		 609 aa  48.9  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0143658  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2080  cytidylate kinase/ribosomal protein S1  36.71 
 
 		 811 aa  48.5  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1597  30S ribosomal protein S1  31.52 
 
 		 558 aa  48.1  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2257  30S ribosomal protein S1  29.35 
 
 		 570 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1561  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.51 
 
 		 699 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000108143  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0867  30S ribosomal protein S1  32.91 
 
 		 586 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314961  normal  0.0879612 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0507  30S ribosomal protein S1  30.4 
 
 		 574 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.762722  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1543  30S ribosomal protein S1  31.52 
 
 		 558 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1149  RNA-binding S1 domain-containing protein  32.73 
 
 		 124 aa  48.5  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000879414  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3070  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.93 
 
 		 707 aa  48.5  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.526485  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  28.8 
 
 		 577 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3847  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  32.91 
 
 		 711 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147568  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1540  30S ribosomal protein S1  31.52 
 
 		 558 aa  48.1  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0142  RNA binding S1 domain protein  34.78 
 
 		 128 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000417569  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0201  30S ribosomal protein S1  29.35 
 
 		 570 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1221  30S ribosomal protein S1  35.62 
 
 		 382 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000730459  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  29.35 
 
 		 589 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2882  30S ribosomal protein S1  29.35 
 
 		 570 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0077101  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0428  30S ribosomal protein S1  29.35 
 
 		 570 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1308  30S ribosomal protein S1  29.89 
 
 		 557 aa  47.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.302956  hitchhiker  0.0000000365743 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01200  rRNA processing-related protein, putative  34.25 
 
 		 1484 aa  47.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2572  30S ribosomal protein S1  29.35 
 
 		 570 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.196878  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  33.71 
 
 		 121 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  29.35 
 
 		 570 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4160  30S ribosomal protein S1  29.35 
 
 		 570 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1638  30S ribosomal protein S1  29.35 
 
 		 570 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.82562  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  29.35 
 
 		 576 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  29.35 
 
 		 571 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0947  30S ribosomal protein S1  29.35 
 
 		 570 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579155  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0923  30S ribosomal protein S1  29.35 
 
 		 576 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261659  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0927  30S ribosomal protein S1  29.35 
 
 		 576 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2945  30S ribosomal protein S1  29.35 
 
 		 570 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.855668  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  29.35 
 
 		 570 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3001  30S ribosomal protein S1  29.35 
 
 		 577 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213018  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1674  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.94 
 
 		 703 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000759629  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1047  30S ribosomal protein S1  29.35 
 
 		 576 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2997  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.94 
 
 		 711 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1212  ribosomal protein S1  31.52 
 
 		 556 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0374524  normal  0.207409 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2759  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.94 
 
 		 736 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00521923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0500  30S ribosomal protein S1  29.89 
 
 		 557 aa  47.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.170768  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2169  30S ribosomal protein S1  35.62 
 
 		 387 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000104963  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2662  RNA binding S1  35.53 
 
 		 140 aa  47  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000144376  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0653  RNA binding S1 domain protein  33.96 
 
 		 120 aa  47  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131287  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2069  30S ribosomal protein S1  31.65 
 
 		 571 aa  47.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0000607618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>