More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0009 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0009  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
267 aa  513  1e-144  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1532  TPR repeat-containing protein  43.75 
 
 
246 aa  193  3e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.942756  normal  0.0737829 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  31.23 
 
 
1276 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.8 
 
 
373 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  33.33 
 
 
462 aa  92  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 
279 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  34.58 
 
 
352 aa  90.1  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 
260 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 
605 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.99 
 
 
261 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  31.28 
 
 
564 aa  86.3  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 
361 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  28.36 
 
 
706 aa  85.5  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  36.02 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 
562 aa  83.6  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 
4079 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 
617 aa  81.3  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  32.42 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 
376 aa  80.5  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 
515 aa  80.5  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 
425 aa  79.3  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 
306 aa  78.6  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  28.46 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 
391 aa  77.4  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 
1421 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 
366 aa  76.3  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 
1049 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 
878 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.04 
 
 
738 aa  75.9  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  28.2 
 
 
306 aa  75.5  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.1 
 
 
810 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  30.67 
 
 
581 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  33.54 
 
 
706 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.17 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.88 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.16 
 
 
1979 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.94 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.97 
 
 
746 aa  73.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.85 
 
 
632 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 
404 aa  73.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 
591 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.65 
 
 
1022 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 
1094 aa  72.8  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 
543 aa  72.8  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 
649 aa  72.8  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 
1192 aa  72.4  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  31.42 
 
 
750 aa  72  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  30.28 
 
 
1056 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 
935 aa  71.6  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  31.68 
 
 
539 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  31.68 
 
 
582 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 
446 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.2 
 
 
542 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 
428 aa  70.5  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.48 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.48 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.11 
 
 
1694 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 
927 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  33.33 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
1827 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
3145 aa  69.7  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.02 
 
 
836 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 
828 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 
465 aa  69.3  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  26.38 
 
 
442 aa  69.3  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 
1737 aa  68.9  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 
687 aa  69.3  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.16 
 
 
471 aa  68.9  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1768  heat shock protein DnaJ-like  32.54 
 
 
415 aa  68.9  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0454464  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  32.44 
 
 
685 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 
828 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 
804 aa  68.2  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 
3035 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.12 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 
547 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1228  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.73 
 
 
818 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  32.35 
 
 
295 aa  67  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 
3560 aa  67  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 
833 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 
371 aa  66.6  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 
4489 aa  66.2  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.84 
 
 
784 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.1 
 
 
725 aa  65.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  30.98 
 
 
331 aa  65.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2847  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 
594 aa  65.9  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  31.69 
 
 
909 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4604  protein kinase  28.09 
 
 
545 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4354  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 
304 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  36.52 
 
 
243 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 
329 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 
593 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>