More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8434 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8434  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 359 aa  716    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3027  aminotransferase class I and II  83.29 
 
 		 359 aa  578  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.396849 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0492  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  72.83 
 
 		 370 aa  512  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.711349  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1150  aminotransferase class I and II  72.73 
 
 		 363 aa  504  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0584766  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3902  succinyldiaminopimelate transaminase  70.87 
 
 		 368 aa  491  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7962  aminotransferase class I and II  65.47 
 
 		 365 aa  454  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2171  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  63.2 
 
 		 379 aa  444  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.881952  normal  0.0135925 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06260  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  66.85 
 
 		 363 aa  440  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11203  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.64 
 
 		 362 aa  435  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4140  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.92 
 
 		 368 aa  423  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867426  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3320  succinyldiaminopimelate transaminase  61.9 
 
 		 376 aa  422  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.399623  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0872  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  64.61 
 
 		 618 aa  420  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3857  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  65.17 
 
 		 433 aa  421  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.947972  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4528  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  64.87 
 
 		 359 aa  413  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1855  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  68.21 
 
 		 328 aa  410  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.867359 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3758  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  63.76 
 
 		 368 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4259  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  63.19 
 
 		 330 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015166 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1152  succinyldiaminopimelate transaminase  60.74 
 
 		 368 aa  406  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240594  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4104  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  63.5 
 
 		 330 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4306  aminotransferase class I and II  60.74 
 
 		 353 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.643765  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4029  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  63.5 
 
 		 330 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0771  aminotransferase class I and II  60.22 
 
 		 363 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157611  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5502  aminotransferase class I and II  61.73 
 
 		 361 aa  394  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11140  aminotransferase  58.92 
 
 		 396 aa  394  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.197788  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2532  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  57.57 
 
 		 379 aa  386  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000986388 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15500  aminotransferase  57.1 
 
 		 383 aa  384  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.694902  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2812  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  56.64 
 
 		 382 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1139  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  57.45 
 
 		 389 aa  368  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0971  aminotransferase class I and II  58.81 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1129  aminotransferase class I and II  56.49 
 
 		 382 aa  357  9.999999999999999e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1193  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  65.02 
 
 		 285 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26000  aminotransferase  57.38 
 
 		 378 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1088  succinyldiaminopimelate transaminase  57.3 
 
 		 373 aa  349  3e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0802  aminotransferase class I and II  51.05 
 
 		 392 aa  337  1.9999999999999998e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0994  succinyldiaminopimelate transaminase  58.82 
 
 		 382 aa  334  2e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.511076  normal  0.844482 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1685  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.05 
 
 		 411 aa  266  5e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  39.66 
 
 		 396 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  39.94 
 
 		 396 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  40.23 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  40.12 
 
 		 388 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  38.52 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  33.69 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0659  aminotransferase class I and II  41.81 
 
 		 361 aa  186  5e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1386  succinyldiaminopimelate transaminase  34.88 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  30.45 
 
 		 386 aa  184  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  33.77 
 
 		 391 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1221  succinyldiaminopimelate transaminase  34.97 
 
 		 398 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  35.66 
 
 		 397 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.313049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2485  succinyldiaminopimelate transaminase  37.21 
 
 		 400 aa  176  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.354726  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0274  succinyldiaminopimelate transaminase  35.49 
 
 		 409 aa  176  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1394  succinyldiaminopimelate transaminase  35.13 
 
 		 417 aa  176  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1469  aminotransferase, class I and II  35.83 
 
 		 399 aa  176  7e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1531  aminotransferase, classes I and II  35.14 
 
 		 397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  32.19 
 
 		 392 aa  173  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  32.98 
 
 		 403 aa  173  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1331  succinyldiaminopimelate transaminase  33.93 
 
 		 399 aa  173  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1891  succinyldiaminopimelate transaminase  32.99 
 
 		 399 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.49 
 
 		 387 aa  171  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1727  succinyldiaminopimelate transaminase  32.47 
 
 		 396 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1267  succinyldiaminopimelate transaminase  33.25 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589506  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2047  succinyldiaminopimelate transaminase  33.33 
 
 		 409 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  32.98 
 
 		 394 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  32.98 
 
 		 394 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.93 
 
 		 391 aa  169  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2551  aminotransferase, class I and II  33.94 
 
 		 400 aa  169  9e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.138065  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3617  succinyldiaminopimelate transaminase  35.66 
 
 		 401 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115899  normal  0.0503817 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  31.66 
 
 		 402 aa  167  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  34.52 
 
 		 388 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  34.13 
 
 		 384 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3056  succinyldiaminopimelate transaminase  34.46 
 
 		 398 aa  166  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.433541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  31.93 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.56 
 
 		 388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1807  succinyldiaminopimelate transaminase  34.72 
 
 		 400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.41 
 
 		 388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.89 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  33.33 
 
 		 390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.41 
 
 		 388 aa  162  6e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1032  succinyldiaminopimelate transaminase  33.67 
 
 		 397 aa  162  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  32.19 
 
 		 382 aa  161  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1997  succinyldiaminopimelate transaminase  34.44 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0044  succinyldiaminopimelate transaminase  31.63 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2720  succinyldiaminopimelate transaminase  34.54 
 
 		 403 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  31.62 
 
 		 390 aa  159  6e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1295  aminotransferase  30.55 
 
 		 407 aa  159  6e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1248  succinyldiaminopimelate transaminase  33.76 
 
 		 410 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.83 
 
 		 388 aa  159  7e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  30.71 
 
 		 400 aa  159  8e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4601  aminotransferase class I and II  33.67 
 
 		 398 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.3 
 
 		 385 aa  157  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1098  succinyldiaminopimelate transaminase  31.33 
 
 		 399 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2603  succinyldiaminopimelate transaminase  31.39 
 
 		 407 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2061  succinyldiaminopimelate transaminase  34.15 
 
 		 387 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1424  succinyldiaminopimelate transaminase  33.59 
 
 		 410 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000365494  normal  0.0284066 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0168  aminotransferase class I and II  30.26 
 
 		 403 aa  157  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.391722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2048  succinyldiaminopimelate transaminase  32.99 
 
 		 410 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2193  succinyldiaminopimelate transaminase  32.88 
 
 		 397 aa  156  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4085  succinyldiaminopimelate transaminase  31.73 
 
 		 398 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1813  succinyldiaminopimelate transaminase  33.42 
 
 		 402 aa  156  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1889  succinyldiaminopimelate transaminase  35.28 
 
 		 404 aa  156  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6048  succinyldiaminopimelate transaminase  32.99 
 
 		 410 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>