More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6181 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  100 
 
 
542 aa  1085    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  56.65 
 
 
535 aa  554  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  54.64 
 
 
537 aa  546  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  52.39 
 
 
542 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  55.62 
 
 
538 aa  507  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  48.71 
 
 
545 aa  432  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  42.72 
 
 
569 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  39.11 
 
 
541 aa  346  6e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  33.94 
 
 
574 aa  319  7e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  42.35 
 
 
548 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  42.35 
 
 
548 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  42.35 
 
 
548 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  37.8 
 
 
564 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  37.64 
 
 
573 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  40.34 
 
 
544 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  37.39 
 
 
616 aa  299  7e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  36.38 
 
 
560 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  35.13 
 
 
569 aa  283  7.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  39.03 
 
 
530 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  37.04 
 
 
569 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  35.86 
 
 
573 aa  276  9e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  35.2 
 
 
564 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  39.08 
 
 
574 aa  272  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  36.69 
 
 
556 aa  272  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  37.89 
 
 
532 aa  270  4e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  36.93 
 
 
620 aa  270  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  34.5 
 
 
553 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  34.93 
 
 
543 aa  267  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  35.05 
 
 
576 aa  267  4e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  34.37 
 
 
565 aa  267  4e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  33.33 
 
 
546 aa  266  8.999999999999999e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  32.7 
 
 
550 aa  265  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  33.58 
 
 
613 aa  265  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  36.36 
 
 
583 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  36.36 
 
 
583 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  33.64 
 
 
608 aa  263  6e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  31.91 
 
 
585 aa  262  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  36.01 
 
 
543 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  36.59 
 
 
560 aa  257  3e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  37.52 
 
 
553 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  34.4 
 
 
601 aa  255  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  31.76 
 
 
619 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  33.33 
 
 
527 aa  254  3e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  33.21 
 
 
603 aa  253  6e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  34.69 
 
 
545 aa  252  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  32.45 
 
 
553 aa  249  7e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  34.18 
 
 
606 aa  249  8e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  33.39 
 
 
580 aa  249  9e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  31.56 
 
 
556 aa  249  9e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  33.75 
 
 
580 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  33.64 
 
 
584 aa  248  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  34.44 
 
 
546 aa  247  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  30.15 
 
 
557 aa  247  4e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  36.18 
 
 
543 aa  246  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  33.95 
 
 
549 aa  244  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  32 
 
 
582 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  35.52 
 
 
575 aa  242  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  32.28 
 
 
556 aa  240  5e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  36.07 
 
 
522 aa  239  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  33.27 
 
 
565 aa  239  9e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  30.47 
 
 
552 aa  238  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1053  hypothetical protein  32.57 
 
 
583 aa  237  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  33.33 
 
 
583 aa  237  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0992  hypothetical protein  32.57 
 
 
583 aa  236  7e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  34.42 
 
 
564 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  35.18 
 
 
565 aa  234  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  36.36 
 
 
568 aa  233  5e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  33.15 
 
 
544 aa  233  8.000000000000001e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  30.89 
 
 
548 aa  230  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4734  Amidohydrolase 3  36.83 
 
 
547 aa  229  7e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.238595  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  32.27 
 
 
589 aa  227  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  31.33 
 
 
560 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  32.51 
 
 
576 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  28.96 
 
 
596 aa  224  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  31.68 
 
 
560 aa  223  8e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  36.02 
 
 
536 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  30.94 
 
 
558 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  35.03 
 
 
554 aa  220  5e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  28.86 
 
 
544 aa  216  7e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  36.31 
 
 
536 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3767  amidohydrolase 3  31.31 
 
 
544 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  31.53 
 
 
543 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2556  Amidohydrolase 3  36.25 
 
 
556 aa  212  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  32.55 
 
 
552 aa  209  8e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.74 
 
 
575 aa  207  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.74 
 
 
575 aa  207  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  32.78 
 
 
579 aa  206  8e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  35.08 
 
 
565 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3862  amidohydrolase 3  30.57 
 
 
563 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  28.14 
 
 
580 aa  204  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3987  amidohydrolase 3  30.57 
 
 
563 aa  203  6e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  32.44 
 
 
581 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  32.86 
 
 
540 aa  201  3e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  33.88 
 
 
537 aa  201  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  30.67 
 
 
555 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  29.91 
 
 
563 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  32.59 
 
 
556 aa  199  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  36.21 
 
 
532 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.88 
 
 
540 aa  198  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  30.7 
 
 
601 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>