More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5918 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5918  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  293  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2291  UspA domain protein  70.39 
 
 
152 aa  185  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000481924  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2992  hypothetical protein  55.03 
 
 
148 aa  148  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485783  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3007  UspA domain-containing protein  55.03 
 
 
148 aa  148  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015244 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3036  UspA domain-containing protein  55.03 
 
 
148 aa  148  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28580  universal stress protein UspA-like protein  55.7 
 
 
149 aa  142  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.243649 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11652  hypothetical protein  55.03 
 
 
146 aa  142  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.615716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3551  UspA domain-containing protein  53.69 
 
 
147 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3342  UspA domain-containing protein  53.02 
 
 
147 aa  137  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537895  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2864  UspA domain protein  54.36 
 
 
148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.428205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2426  UspA domain protein  50 
 
 
148 aa  131  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.384614  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4166  UspA domain protein  52.32 
 
 
152 aa  123  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.441072  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  38.1 
 
 
148 aa  94.4  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0390  UspA domain-containing protein  46.32 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422401  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3952  UspA domain protein  39.61 
 
 
166 aa  73.6  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.163149 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4023  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3813  UspA domain protein  37.06 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  34.46 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.77 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  32.19 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  33.77 
 
 
345 aa  61.6  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 
289 aa  61.6  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0519  UspA domain-containing protein  37.18 
 
 
188 aa  61.6  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  32.19 
 
 
139 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  33.11 
 
 
341 aa  60.5  0.000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
291 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  29.93 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3285  UspA domain protein  34.51 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  26.85 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  27.52 
 
 
166 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  27.52 
 
 
166 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  36.17 
 
 
295 aa  57.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  33.56 
 
 
140 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  39.19 
 
 
294 aa  57  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  30 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  28.19 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  36.77 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  31.03 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 
152 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 
147 aa  55.1  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  28.67 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  29.22 
 
 
157 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  29.33 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  29.33 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  29.33 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  29.33 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  29.22 
 
 
157 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  29.33 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  29.33 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  29.33 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  29.33 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  34.03 
 
 
309 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  32.19 
 
 
147 aa  54.3  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  31.79 
 
 
294 aa  54.3  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.24 
 
 
288 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 
143 aa  53.9  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  32.17 
 
 
140 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  31.47 
 
 
295 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
295 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
295 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3647  UspA domain protein  36.62 
 
 
183 aa  53.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  normal  0.0586956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 
300 aa  53.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2918  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 
297 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519295 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  26.17 
 
 
166 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  24.53 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  24.53 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  24.53 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  24.53 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  29.87 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  24.53 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  24.53 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  28.67 
 
 
150 aa  52.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.3 
 
 
284 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1774  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  28.57 
 
 
143 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  28.93 
 
 
156 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  24.53 
 
 
140 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 
161 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 
165 aa  52  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 
145 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  31.08 
 
 
146 aa  52  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 
140 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  34.75 
 
 
277 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
291 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  29.01 
 
 
160 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
137 aa  52  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  32.45 
 
 
317 aa  51.6  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  25.16 
 
 
140 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  32 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  30.92 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  34.18 
 
 
292 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  30.61 
 
 
152 aa  51.2  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  34.18 
 
 
292 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>