More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1733 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  100 
 
 
250 aa  503  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  75.3 
 
 
251 aa  386  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  55.02 
 
 
268 aa  286  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  55.2 
 
 
250 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  55.42 
 
 
249 aa  261  8e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  53.75 
 
 
252 aa  255  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  51.41 
 
 
248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  51.57 
 
 
256 aa  246  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  51.41 
 
 
248 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  52.21 
 
 
248 aa  236  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  48.4 
 
 
270 aa  235  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  50.58 
 
 
259 aa  233  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  53.82 
 
 
246 aa  221  7e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  49.81 
 
 
257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  44.36 
 
 
256 aa  202  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  44.96 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  46.94 
 
 
245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08360  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  48.41 
 
 
271 aa  191  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2582  hypothetical protein  43.23 
 
 
265 aa  188  8e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000119552  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  42.44 
 
 
267 aa  181  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2314  hypothetical protein  43.61 
 
 
265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  45.23 
 
 
265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  43.4 
 
 
262 aa  171  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0886  hypothetical protein  41.13 
 
 
267 aa  170  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09930  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  42.86 
 
 
260 aa  167  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.65106  normal  0.185671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2357  beta-lactamase-like protein  43.64 
 
 
257 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047895  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  39.33 
 
 
265 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  43.88 
 
 
273 aa  166  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3845  beta-lactamase-like protein  43.64 
 
 
257 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3919  beta-lactamase domain-containing protein  43.64 
 
 
257 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3831  beta-lactamase domain-containing protein  43.64 
 
 
257 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4288  beta-lactamase-like protein  43.64 
 
 
257 aa  161  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1059  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III  38.11 
 
 
284 aa  159  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.623679  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  40.08 
 
 
253 aa  159  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  40.24 
 
 
246 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  33.46 
 
 
244 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  35.6 
 
 
244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  36.65 
 
 
257 aa  136  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  32 
 
 
244 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  34.66 
 
 
256 aa  132  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  30.8 
 
 
244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  34.54 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 
244 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  30 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  30 
 
 
244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  30 
 
 
244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5275  beta-lactamase domain protein  34.24 
 
 
263 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
244 aa  123  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  34.94 
 
 
240 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  29.6 
 
 
244 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  30 
 
 
244 aa  123  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 
244 aa  122  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  34.35 
 
 
259 aa  119  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  29.2 
 
 
244 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0399  AtsA/ElaC family protein  33.86 
 
 
258 aa  116  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000165635  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  35.61 
 
 
248 aa  115  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  31.33 
 
 
244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  32.58 
 
 
249 aa  112  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  32.37 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3623  beta-lactamase domain protein  30.65 
 
 
253 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00997339  normal  0.648861 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  37.92 
 
 
273 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  31.33 
 
 
240 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  29.46 
 
 
259 aa  97.1  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3962  beta-lactamase domain-containing protein  35.42 
 
 
285 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17682  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 
263 aa  93.6  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1506  beta-lactamase domain-containing protein  31.91 
 
 
253 aa  88.2  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  31.09 
 
 
247 aa  85.5  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  29.04 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  32.58 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  31.28 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  32.09 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2229  ribonuclease Z  29.27 
 
 
324 aa  79  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_002620  TC0625  ribonuclease Z  28.37 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  27.51 
 
 
251 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  30.68 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  33.19 
 
 
237 aa  77  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  30.77 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  29.17 
 
 
250 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  30.53 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  30.04 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  31.74 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  30.09 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  28.74 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  34.65 
 
 
322 aa  72.4  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  27.88 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  28.02 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  26.55 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1966  beta-lactamase domain protein  27.11 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  32.67 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  26.11 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  23.13 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  30.24 
 
 
286 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  27.43 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0914  ribonuclease Z  29.18 
 
 
307 aa  68.9  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  27.63 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  26.9 
 
 
285 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  26.9 
 
 
285 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  29.75 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  30.22 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>