More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4054 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4054  histidine kinase  100 
 
 		 547 aa  1108    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0100  histidine kinase  43.94 
 
 		 572 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.102093  normal  0.549311 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4735  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 		 594 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1771  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 		 613 aa  206  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228361 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4899  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 		 607 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  0.0631454 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.31 
 
 		 608 aa  193  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  hitchhiker  0.000174254 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0782  Signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 611 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0955  putative two-component regulator histidine sensor kinase  28.45 
 
 		 602 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0633  MmoS, putative  28.2 
 
 		 602 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0794  sensory box histidine kinase/response regulator  27.53 
 
 		 602 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214236  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4800  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.95 
 
 		 610 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3368  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.95 
 
 		 610 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0390016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4148  histidine kinase  25.95 
 
 		 610 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5145  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.06 
 
 		 603 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3302  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.43 
 
 		 606 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00552774 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2513  ATP-binding region, ATPase-like  28.79 
 
 		 945 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.543755  normal  0.160676 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2888  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.16 
 
 		 606 aa  156  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5222  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.05 
 
 		 601 aa  154  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5316  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.15 
 
 		 1069 aa  154  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72275  normal  0.481403 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2306  histidine kinase  29.05 
 
 		 479 aa  152  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.808548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  31.1 
 
 		 1346 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.21 
 
 		 674 aa  152  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 		 730 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.97 
 
 		 760 aa  151  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  28.28 
 
 		 923 aa  150  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1424  sensor histidine kinase  28.94 
 
 		 736 aa  149  9e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5254  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.39 
 
 		 579 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601488  normal  0.0228125 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  30.95 
 
 		 742 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.36 
 
 		 957 aa  148  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.71 
 
 		 1007 aa  148  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3675  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 		 966 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.65 
 
 		 1238 aa  146  9e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4759  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.41 
 
 		 593 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.65 
 
 		 1238 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1864  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.72 
 
 		 1069 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.94 
 
 		 1238 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  28.53 
 
 		 984 aa  146  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.3 
 
 		 877 aa  146  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  28.39 
 
 		 1188 aa  145  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3207  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.6 
 
 		 910 aa  145  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02280  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  28.72 
 
 		 509 aa  144  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5320  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.27 
 
 		 903 aa  145  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.544718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.39 
 
 		 1238 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1876  histidine kinase  26.35 
 
 		 979 aa  144  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0246829  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0303  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.89 
 
 		 1196 aa  144  6e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.723835  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.85 
 
 		 633 aa  143  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.88 
 
 		 1223 aa  143  8e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.53 
 
 		 641 aa  143  8e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.870294  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1012  response regulator, histidine kinase  26.72 
 
 		 578 aa  143  9e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.12 
 
 		 1236 aa  143  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  29.05 
 
 		 1177 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.15 
 
 		 1234 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  27.66 
 
 		 578 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.12 
 
 		 1236 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.12 
 
 		 1236 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  28.46 
 
 		 758 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.81 
 
 		 1199 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  24.87 
 
 		 651 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0229  histidine kinase  29.17 
 
 		 724 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0610831  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.63 
 
 		 1234 aa  141  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  28.04 
 
 		 1200 aa  141  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2154  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.17 
 
 		 815 aa  141  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2119  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.56 
 
 		 607 aa  141  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2667  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.34 
 
 		 737 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.149434  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5710  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase (bvgS-like)  29.44 
 
 		 1040 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.86 
 
 		 667 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  23 
 
 		 631 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  27.75 
 
 		 810 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.72 
 
 		 969 aa  140  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06119  histidine kinase  28.23 
 
 		 985 aa  140  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02504  Signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 667 aa  139  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.83 
 
 		 868 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.65 
 
 		 524 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.2 
 
 		 639 aa  139  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3858  PAS sensor protein  29.46 
 
 		 797 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4576  histidine kinase  24.84 
 
 		 678 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.354871 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  26.9 
 
 		 1763 aa  139  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  27.44 
 
 		 1574 aa  139  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4222  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.18 
 
 		 1002 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480663  normal  0.970552 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.15 
 
 		 1245 aa  139  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.74 
 
 		 1009 aa  139  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  28.12 
 
 		 1344 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.12 
 
 		 1240 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0206  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  24.94 
 
 		 771 aa  139  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.21 
 
 		 913 aa  139  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.12 
 
 		 1059 aa  139  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.65 
 
 		 1323 aa  139  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0924  aerobic respiration control sensor protein ArcB  27.33 
 
 		 753 aa  138  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.178911  normal  0.270801 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000317  sensor protein TorS  26.94 
 
 		 987 aa  139  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1575  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.65 
 
 		 577 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.09451  normal  0.420465 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  27.84 
 
 		 772 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1753  sensor protein LuxQ  26.7 
 
 		 583 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.042622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.1 
 
 		 785 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.69 
 
 		 1120 aa  138  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2178  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.12 
 
 		 750 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00477296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.23 
 
 		 1078 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0829  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.1 
 
 		 812 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177536 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  24.94 
 
 		 651 aa  137  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0393x  response regulator, histidine kinase  30.12 
 
 		 943 aa  137  5e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621999  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1055  sensor histidine kinase/response regulator  28.3 
 
 		 514 aa  137  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>