More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0859 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.56 
 
 		 675 aa  866    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.547128  hitchhiker  0.00024543 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.51 
 
 		 674 aa  890    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0859  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 673 aa  1326    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3642  methyl-accepting chemotaxis protein  60.48 
 
 		 673 aa  719    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.56 
 
 		 673 aa  786    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1076  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.26 
 
 		 673 aa  784    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.450868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.52 
 
 		 675 aa  826    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.98 
 
 		 673 aa  751    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.990285  normal  0.659639 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0974  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.56 
 
 		 673 aa  787    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2891  chemotaxis sensory transducer  60.33 
 
 		 673 aa  781    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.92 
 
 		 673 aa  741    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.73728 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2822  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.66 
 
 		 673 aa  804    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.77 
 
 		 673 aa  741    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0986  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.98 
 
 		 673 aa  742    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.603679  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.26 
 
 		 673 aa  794    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1043  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.41 
 
 		 673 aa  786    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.530938  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.32 
 
 		 674 aa  504  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.560716  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03417  methyl-accepting chemotaxis protein  43.2 
 
 		 674 aa  481  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617562  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4528  methyl-accepting chemotaxis protein  42.58 
 
 		 672 aa  473  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01085  methyl-accepting chemotaxis protein  31.11 
 
 		 672 aa  268  2.9999999999999995e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0241745  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.14 
 
 		 543 aa  261  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.54 
 
 		 637 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0207  methyl-accepting chemotaxis protein  31.82 
 
 		 666 aa  253  6e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.152775  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.23 
 
 		 674 aa  250  5e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.54 
 
 		 636 aa  250  7e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2638  chemotaxis sensory transducer  30.16 
 
 		 675 aa  249  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.58 
 
 		 541 aa  246  9e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  42.22 
 
 		 638 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0580  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.62 
 
 		 679 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.9 
 
 		 640 aa  244  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.8 
 
 		 637 aa  243  6e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.79 
 
 		 572 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  40.17 
 
 		 642 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28 
 
 		 677 aa  239  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.98 
 
 		 638 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0728  chemotaxis sensory transducer  42.74 
 
 		 639 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.67 
 
 		 638 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  40.22 
 
 		 629 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.55 
 
 		 552 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40.5 
 
 		 640 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.37 
 
 		 638 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0712  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.5 
 
 		 624 aa  234  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5092  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  41.87 
 
 		 640 aa  233  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4833  chemotaxis sensory transducer  41.44 
 
 		 541 aa  232  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000956827  normal  0.082646 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.92 
 
 		 564 aa  232  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1215  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.9 
 
 		 678 aa  232  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5553  methyl-accepting chemotaxis protein  41.32 
 
 		 640 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.47 
 
 		 638 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.89 
 
 		 642 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.39 
 
 		 650 aa  231  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.07 
 
 		 639 aa  231  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66043 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.89 
 
 		 552 aa  230  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.4 
 
 		 634 aa  228  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  37.63 
 
 		 712 aa  228  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.05 
 
 		 544 aa  228  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0900  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.04 
 
 		 573 aa  228  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.476047  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.77 
 
 		 639 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.886367 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.76 
 
 		 716 aa  227  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  37.37 
 
 		 712 aa  227  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4658  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.77 
 
 		 639 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  41.57 
 
 		 541 aa  226  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1124  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.77 
 
 		 547 aa  226  8e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00163985  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.07 
 
 		 639 aa  226  9e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5159  methyl-accepting chemotaxis protein  38.18 
 
 		 638 aa  226  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.54 
 
 		 675 aa  226  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.11864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.54 
 
 		 675 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43710  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  41.79 
 
 		 541 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.18 
 
 		 541 aa  224  3e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.2 
 
 		 646 aa  225  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.64 
 
 		 425 aa  224  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.54 
 
 		 634 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  35.7 
 
 		 713 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  38.27 
 
 		 634 aa  224  6e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1402  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.25 
 
 		 675 aa  223  6e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1386  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.54 
 
 		 675 aa  223  8e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1007  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.4 
 
 		 573 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.02936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1418  chemotaxis sensory transducer  43.21 
 
 		 541 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.98 
 
 		 541 aa  221  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3557  methyl-accepting chemotaxis transducer  40.79 
 
 		 714 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.62 
 
 		 688 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.79 
 
 		 714 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0931  methyl-accepting chemotaxis protein  40 
 
 		 543 aa  220  6e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.53 
 
 		 681 aa  220  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  38.35 
 
 		 553 aa  219  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.4 
 
 		 541 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  38.8 
 
 		 633 aa  219  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.71 
 
 		 541 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  39.16 
 
 		 541 aa  219  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.56 
 
 		 540 aa  219  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.44 
 
 		 634 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.12 
 
 		 638 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.86 
 
 		 541 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.476721 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.94 
 
 		 438 aa  218  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.65 
 
 		 522 aa  217  5e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3864  methyl-accepting chemotaxis protein  39.5 
 
 		 568 aa  217  5.9999999999999996e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  37.64 
 
 		 541 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2268  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.16 
 
 		 541 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.57 
 
 		 541 aa  216  8e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  39.41 
 
 		 676 aa  216  8e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  39.49 
 
 		 553 aa  216  8e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>