More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4528 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  100 
 
 		 222 aa  443  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  78.44 
 
 		 229 aa  346  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  78.9 
 
 		 229 aa  346  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  65.77 
 
 		 223 aa  284  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  66.21 
 
 		 219 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  66.2 
 
 		 219 aa  281  5.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  64.81 
 
 		 223 aa  280  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  66.2 
 
 		 218 aa  279  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  65.42 
 
 		 217 aa  278  4e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  65.44 
 
 		 233 aa  275  5e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  65.42 
 
 		 218 aa  273  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  66.18 
 
 		 233 aa  268  5.9999999999999995e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  62.8 
 
 		 241 aa  267  8.999999999999999e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  62.84 
 
 		 221 aa  266  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  62.04 
 
 		 220 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  60.83 
 
 		 222 aa  263  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  61.57 
 
 		 219 aa  263  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  60.83 
 
 		 222 aa  263  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  60.83 
 
 		 222 aa  263  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  61.93 
 
 		 221 aa  263  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  59.62 
 
 		 249 aa  261  6e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  57.53 
 
 		 224 aa  261  6.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  65.09 
 
 		 259 aa  261  8.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  62.39 
 
 		 231 aa  259  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  58.45 
 
 		 225 aa  256  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  56.82 
 
 		 224 aa  255  5e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  59.02 
 
 		 220 aa  245  4e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  52.4 
 
 		 231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  55.87 
 
 		 299 aa  240  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  55.87 
 
 		 253 aa  238  4e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  50.66 
 
 		 231 aa  237  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  50.68 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  50.88 
 
 		 229 aa  201  8e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2875  TrkA-N domain protein  52.38 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  45.5 
 
 		 227 aa  174  7e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  37.84 
 
 		 220 aa  144  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  36.87 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  34.51 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  35.59 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  34.4 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  32.56 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  32.88 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  32.73 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  31.51 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  34.88 
 
 		 223 aa  118  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  31.82 
 
 		 220 aa  108  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  26.36 
 
 		 221 aa  101  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  26.94 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  29.02 
 
 		 221 aa  96.7  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  29.36 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  25.56 
 
 		 221 aa  95.5  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  28.44 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  27.19 
 
 		 457 aa  91.7  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  30.69 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2258  TrkA-N domain protein  30.67 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  26.48 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  32.45 
 
 		 225 aa  88.6  7e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  29.2 
 
 		 222 aa  88.2  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  26.58 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  28.77 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  29.1 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  29.61 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  30.8 
 
 		 226 aa  85.9  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  31.88 
 
 		 445 aa  85.1  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  31.4 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  29.72 
 
 		 458 aa  83.2  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  28.51 
 
 		 630 aa  82.4  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  27.95 
 
 		 458 aa  82  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  26.58 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0018  potassium transporter peripheral membrane component  29.58 
 
 		 477 aa  82  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.265003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2622  potassium transporter peripheral membrane component  28.1 
 
 		 458 aa  82  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637696 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  30.05 
 
 		 443 aa  81.6  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3020  potassium transporter peripheral membrane component  28.17 
 
 		 457 aa  81.6  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  28.38 
 
 		 458 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0769  TrkA-N domain protein  35.27 
 
 		 445 aa  81.3  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.601936 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0081  potassium transporter peripheral membrane component  26.13 
 
 		 458 aa  80.9  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0633  TrkA-N domain protein  28.83 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  27.8 
 
 		 457 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1062  TrkA-N domain-containing protein  37.23 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.121384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1602  TrkA-N domain protein  31.08 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.316093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  29.22 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  28.83 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2872  potassium transporter peripheral membrane component  30.43 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  28.57 
 
 		 458 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  28.38 
 
 		 458 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1686  TrkA domain-containing protein  25.69 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0415019  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  27.47 
 
 		 457 aa  79  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  27.27 
 
 		 465 aa  79  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4126  potassium transporter peripheral membrane component  27.73 
 
 		 458 aa  79  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  28.5 
 
 		 448 aa  78.6  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  27.96 
 
 		 459 aa  78.6  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  29.03 
 
 		 458 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  27.31 
 
 		 457 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  27.31 
 
 		 457 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  27.31 
 
 		 457 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  30.19 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0038  potassium transporter peripheral membrane component  27.1 
 
 		 458 aa  78.2  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1276  TrkA-N domain protein  29.6 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283168  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1216  TrkA-N domain protein  30.43 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  26.55 
 
 		 450 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>