More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3251 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 428 aa  867    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  50.46 
 
 		 435 aa  444  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  51.15 
 
 		 438 aa  441  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  39.5 
 
 		 448 aa  339  5e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  41.41 
 
 		 441 aa  334  1e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  39.68 
 
 		 442 aa  321  1.9999999999999998e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  39.2 
 
 		 442 aa  316  4e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  41.41 
 
 		 441 aa  304  2.0000000000000002e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  38.07 
 
 		 434 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  38.94 
 
 		 424 aa  280  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  32.65 
 
 		 422 aa  196  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  32.37 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  28.91 
 
 		 435 aa  177  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  32.47 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  27.34 
 
 		 431 aa  152  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  28.93 
 
 		 451 aa  147  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  28.14 
 
 		 495 aa  143  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 		 441 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  32.47 
 
 		 427 aa  125  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3985  putative ABC sugar transporter (substrate binding protein)  27.63 
 
 		 419 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 		 424 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  29.93 
 
 		 441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 		 435 aa  117  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  30.38 
 
 		 434 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  31.23 
 
 		 429 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  29.23 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  28.65 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  29.66 
 
 		 434 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  30.63 
 
 		 435 aa  107  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 		 431 aa  100  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 434 aa  99  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 408 aa  97.4  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  30.51 
 
 		 413 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  30.51 
 
 		 399 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 		 424 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 		 419 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 		 420 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 		 419 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 		 419 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 		 420 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  28.72 
 
 		 441 aa  93.2  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 		 434 aa  92.8  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2754  extracellular solute-binding protein family 1  28.98 
 
 		 443 aa  92  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.7 
 
 		 428 aa  91.7  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0882  extracellular solute-binding protein family 1  32.68 
 
 		 419 aa  91.3  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.632389 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 		 468 aa  90.5  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 419 aa  90.1  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  28.2 
 
 		 408 aa  89.7  9e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 		 408 aa  89.7  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.01 
 
 		 426 aa  89.4  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 		 421 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  27.99 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  28.2 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1695  extracellular solute-binding protein  31.43 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.157617 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.19 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  27.41 
 
 		 432 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  29.35 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  24.45 
 
 		 451 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  23.1 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 422 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 		 445 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 		 461 aa  76.6  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 412 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  29.29 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  27.24 
 
 		 445 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0929  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4071  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.89 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00185695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0489  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0816838  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1705  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.751939  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0968  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278189  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0059  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  31.56 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  28.68 
 
 		 431 aa  73.6  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1956  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  36.14 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318288  normal  0.222736 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0840  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.961003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0628  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0828  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00532301  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 		 451 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5887  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5435  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207139 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3491  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2083  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.71 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  24.84 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  29.27 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  31.02 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 		 493 aa  70.1  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2430  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.682399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  22.18 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.94 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1939  putative sugar ABC transporter binding protein subunit  34.34 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>