155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2171 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2171  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 415 aa  791    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00952498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1176  Outer membrane efflux protein  33.7 
 
 		 429 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1877  Outer membrane efflux protein  34.97 
 
 		 413 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0040  outer membrane efflux protein  35.59 
 
 		 471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  27.51 
 
 		 479 aa  99.8  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3836  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmvC  30.95 
 
 		 445 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3501  Outer membrane efflux protein  31 
 
 		 489 aa  96.7  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  27.87 
 
 		 437 aa  94  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6550  outer membrane efflux protein  25.58 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2567  outer membrane efflux protein  30.65 
 
 		 433 aa  71.6  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  28.65 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  26.79 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4485  outer membrane efflux protein  22.52 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  24.23 
 
 		 471 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  28.02 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1551  outer membrane efflux protein  28.36 
 
 		 443 aa  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  28.17 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2609  outer membrane efflux protein  30.81 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  27.35 
 
 		 451 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  25.74 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  24.54 
 
 		 421 aa  62  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  25.68 
 
 		 418 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  24.62 
 
 		 433 aa  59.7  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2504  outer membrane efflux protein  29.23 
 
 		 436 aa  59.7  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10477  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1614  outer membrane efflux protein  19.71 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  24.58 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  27.7 
 
 		 458 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  27.83 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  29.5 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  25.77 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  24.48 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2577  outer membrane efflux protein  27.46 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  24.82 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  26.84 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  28.85 
 
 		 438 aa  55.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1957  putative RND efflux system protein  24.69 
 
 		 444 aa  55.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  28.97 
 
 		 408 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2318  outer membrane protein  27.3 
 
 		 479 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  26.01 
 
 		 439 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  26.01 
 
 		 439 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  27.36 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  27.9 
 
 		 473 aa  53.9  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  27.9 
 
 		 473 aa  53.9  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  27.48 
 
 		 428 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27410  putative outer membrane protein precursor  25.83 
 
 		 479 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.721932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  28.12 
 
 		 423 aa  53.5  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  23.24 
 
 		 426 aa  53.1  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.85 
 
 		 452 aa  53.1  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  27.9 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  25.74 
 
 		 435 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2616  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.76 
 
 		 501 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05806  putative outer membrane lipoprotein  31.67 
 
 		 490 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.300905 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0491  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  29.15 
 
 		 441 aa  52.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2509  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.98 
 
 		 471 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1958  aconitate hydratase 1  27.49 
 
 		 422 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0713794  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4765  outer membrane efflux protein  31.36 
 
 		 485 aa  51.6  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.55701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3427  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.13 
 
 		 471 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0491334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7201  outer membrane efflux protein  22.11 
 
 		 418 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2447  outer membrane efflux protein  29.81 
 
 		 423 aa  51.6  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2335  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.13 
 
 		 471 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.66 
 
 		 477 aa  50.8  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0790  outer membrane efflux protein  21.02 
 
 		 423 aa  50.8  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  29.55 
 
 		 443 aa  50.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.37 
 
 		 495 aa  50.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_003296  RS01780  outer membrane CHANEL lipoprotein  26.09 
 
 		 522 aa  50.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2742  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.23 
 
 		 517 aa  50.4  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0384  outer membrane efflux protein  24.25 
 
 		 444 aa  50.4  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.895564  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6200  multidrug efflux system outer membrane subunit  26.71 
 
 		 504 aa  50.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.584656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0144  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.86 
 
 		 483 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.16245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1359  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.21 
 
 		 462 aa  50.1  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4156  outer membrane efflux protein  25.73 
 
 		 446 aa  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2820  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.77 
 
 		 517 aa  49.7  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  26.83 
 
 		 423 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  26.83 
 
 		 423 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4969  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  33.53 
 
 		 497 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3455  outer membrane efflux protein  24.08 
 
 		 449 aa  49.3  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414344  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3191  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.53 
 
 		 497 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4288  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.53 
 
 		 467 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.22095  normal  0.428638 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  25.87 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  26.83 
 
 		 423 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2240  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.46 
 
 		 518 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  25.44 
 
 		 438 aa  48.5  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.7 
 
 		 546 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16116  normal  0.32958 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3900  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.45 
 
 		 488 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.362136  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0665  outer membrane efflux protein  25.65 
 
 		 453 aa  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000306808  hitchhiker  0.00231848 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2451  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.33 
 
 		 514 aa  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1695  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.54 
 
 		 512 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.6 
 
 		 482 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3371  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.45 
 
 		 484 aa  47.4  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00556392  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1740  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.84 
 
 		 517 aa  47.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3184  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.2 
 
 		 475 aa  47.4  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  26.77 
 
 		 464 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  26.77 
 
 		 425 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2127  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.54 
 
 		 513 aa  47  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.9 
 
 		 428 aa  46.6  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  21.72 
 
 		 437 aa  46.6  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1343  outer membrane efflux protein  19.68 
 
 		 429 aa  46.6  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  27.09 
 
 		 417 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2446  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.74 
 
 		 471 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0814  outer membrane efflux protein  24.71 
 
 		 455 aa  46.6  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.881482  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>