More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0253 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  100 
 
 		 229 aa  469  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  88.89 
 
 		 229 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  65.75 
 
 		 235 aa  317  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  62.05 
 
 		 231 aa  302  4.0000000000000003e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  63.35 
 
 		 232 aa  300  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  62.22 
 
 		 234 aa  291  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1620  ABC transporter, ATPase subunit  65.47 
 
 		 241 aa  291  7e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  63.93 
 
 		 235 aa  284  7e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  60.09 
 
 		 230 aa  283  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  60.73 
 
 		 230 aa  281  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  60.18 
 
 		 231 aa  281  8.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  61.36 
 
 		 229 aa  280  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  60.36 
 
 		 231 aa  276  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  61.36 
 
 		 229 aa  276  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  60.63 
 
 		 235 aa  276  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  60.18 
 
 		 231 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  57.27 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  55.45 
 
 		 225 aa  270  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0284  ABC transporter related  60.63 
 
 		 232 aa  269  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  hitchhiker  0.00000395766 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2803  ABC transporter related  60.09 
 
 		 232 aa  268  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0893633  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0230  ABC transporter related  59.73 
 
 		 232 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000298 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  59.36 
 
 		 228 aa  266  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0222  ABC transporter related  59.73 
 
 		 232 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0303  ABC transporter related  59.64 
 
 		 232 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0537962  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3402  ABC efflux pump, ATPase subunit  59.73 
 
 		 232 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0029159  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  57.14 
 
 		 268 aa  259  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0206  ABC transporter related  59.28 
 
 		 232 aa  259  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  unclonable  0.000000000007713 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2260  ABC transporter related  54.55 
 
 		 232 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2582  ABC transporter related  56.82 
 
 		 234 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 		 224 aa  228  6e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 		 224 aa  228  6e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  50.68 
 
 		 222 aa  228  7e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  47.03 
 
 		 246 aa  228  7e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  48.86 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  50.68 
 
 		 239 aa  227  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  48.86 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 		 224 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  48.4 
 
 		 224 aa  226  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  48.4 
 
 		 224 aa  226  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  47.95 
 
 		 224 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 236 aa  225  4e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 226 aa  225  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  48.4 
 
 		 224 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  49.32 
 
 		 226 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  47.49 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  48.43 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 226 aa  223  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  49.32 
 
 		 226 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 226 aa  223  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 226 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 226 aa  222  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  49.32 
 
 		 226 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  46.64 
 
 		 230 aa  222  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 226 aa  222  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 226 aa  222  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  47.75 
 
 		 234 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  47.75 
 
 		 234 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  46.82 
 
 		 228 aa  221  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  48.2 
 
 		 234 aa  219  3e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  46.67 
 
 		 248 aa  219  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  47.93 
 
 		 237 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  48.87 
 
 		 252 aa  218  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  51.61 
 
 		 252 aa  218  6e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  47.95 
 
 		 237 aa  218  6e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  47.03 
 
 		 239 aa  218  7e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  50.67 
 
 		 238 aa  218  8.999999999999998e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  44.39 
 
 		 241 aa  217  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  47.47 
 
 		 229 aa  217  1e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  46.7 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  47.96 
 
 		 226 aa  217  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  48.42 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  46.7 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  47.75 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  46.58 
 
 		 242 aa  216  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  46.36 
 
 		 249 aa  215  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  46.61 
 
 		 225 aa  215  5e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  48.9 
 
 		 241 aa  215  5e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  50.45 
 
 		 233 aa  214  9e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.6 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  46.33 
 
 		 226 aa  214  9.999999999999999e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  47.75 
 
 		 226 aa  213  9.999999999999999e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  49.77 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  46.26 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  44.7 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  45.54 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  47.3 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  46.58 
 
 		 653 aa  213  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  45.91 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  46.54 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  46.67 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  45.21 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0816  ABC-type transport system, ATPase component  52.05 
 
 		 235 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  48.4 
 
 		 240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  45.5 
 
 		 240 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 		 221 aa  212  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  44.24 
 
 		 222 aa  211  7e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  46.36 
 
 		 231 aa  211  7e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>