More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3897 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  80 
 
 		 506 aa  843    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  84.36 
 
 		 506 aa  912    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  85.38 
 
 		 506 aa  915    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  80.2 
 
 		 506 aa  844    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  83.17 
 
 		 506 aa  885    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  82.18 
 
 		 506 aa  892    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  82.97 
 
 		 506 aa  897    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  100 
 
 		 506 aa  1048    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0254  flavocytochrome c  85.25 
 
 		 367 aa  672    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  54.03 
 
 		 500 aa  550  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  55.98 
 
 		 494 aa  533  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  46.49 
 
 		 517 aa  450  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  46.73 
 
 		 519 aa  448  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  46.09 
 
 		 517 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  44.4 
 
 		 519 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  45.67 
 
 		 519 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  45.29 
 
 		 517 aa  434  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  43.13 
 
 		 512 aa  395  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1414  flavocytochrome c flavin subunit, putative  41.98 
 
 		 506 aa  389  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4184  flavocytochrome c  40.25 
 
 		 503 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.159689 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0299  flavocytochrome c  41.77 
 
 		 506 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0588345 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0276  flavocytochrome c  40.92 
 
 		 505 aa  388  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0325  flavocytochrome c  39.41 
 
 		 507 aa  384  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  41.95 
 
 		 521 aa  382  1e-105  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2534  flavocytochrome c  40.3 
 
 		 506 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135835  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  41.1 
 
 		 511 aa  353  4e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  39.77 
 
 		 517 aa  348  1e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  38.54 
 
 		 510 aa  347  3e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  38.76 
 
 		 517 aa  342  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  40.5 
 
 		 519 aa  336  7e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  40.8 
 
 		 520 aa  335  1e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  38.71 
 
 		 499 aa  326  6e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  37.05 
 
 		 500 aa  317  5e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  37.89 
 
 		 511 aa  315  9.999999999999999e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  36.29 
 
 		 521 aa  313  5.999999999999999e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  39.27 
 
 		 507 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  36.77 
 
 		 515 aa  300  6e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  36.46 
 
 		 483 aa  298  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  35.02 
 
 		 518 aa  295  2e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  34.44 
 
 		 508 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1548  flavocytochrome c flavin subunit  34.17 
 
 		 501 aa  254  3e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00203617  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  32.54 
 
 		 505 aa  252  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  34.51 
 
 		 599 aa  236  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0251  flavocytochrome c  82.22 
 
 		 161 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  34.26 
 
 		 609 aa  224  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  33.27 
 
 		 584 aa  224  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  33.2 
 
 		 515 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1643  FAD binding domain-containing protein  31.18 
 
 		 491 aa  215  1.9999999999999998e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  32.94 
 
 		 515 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  32.75 
 
 		 515 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  32.26 
 
 		 586 aa  206  8e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  31.57 
 
 		 582 aa  197  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  34.94 
 
 		 596 aa  195  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  31.12 
 
 		 586 aa  195  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  31.15 
 
 		 605 aa  192  9e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  34.38 
 
 		 596 aa  192  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  35.02 
 
 		 596 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  35.02 
 
 		 596 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  35.02 
 
 		 596 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  34.31 
 
 		 597 aa  192  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  35.02 
 
 		 596 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  30.96 
 
 		 582 aa  190  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  34.17 
 
 		 596 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  33.11 
 
 		 596 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  32.35 
 
 		 598 aa  187  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  30.3 
 
 		 606 aa  187  6e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  31.7 
 
 		 582 aa  182  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  30.89 
 
 		 603 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  30.6 
 
 		 588 aa  180  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  31.03 
 
 		 591 aa  179  7e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  31.36 
 
 		 582 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  31.36 
 
 		 582 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  34.04 
 
 		 593 aa  177  6e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  30.58 
 
 		 596 aa  170  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1545  putative flavocytochrome c flavin subunit  27.35 
 
 		 447 aa  170  7e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  32.52 
 
 		 596 aa  168  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.98 
 
 		 457 aa  164  3e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  31.64 
 
 		 596 aa  161  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  29.02 
 
 		 650 aa  159  8e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  31.19 
 
 		 596 aa  159  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  29.64 
 
 		 598 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  28.36 
 
 		 464 aa  158  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  29.64 
 
 		 598 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  31.06 
 
 		 957 aa  156  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.49 
 
 		 502 aa  155  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  32.25 
 
 		 925 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  30.44 
 
 		 596 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  30.53 
 
 		 583 aa  154  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  29.22 
 
 		 589 aa  151  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  29.41 
 
 		 597 aa  151  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  29.54 
 
 		 608 aa  149  8e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.61 
 
 		 465 aa  149  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  29.28 
 
 		 631 aa  148  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  30.47 
 
 		 925 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  30.41 
 
 		 591 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.11 
 
 		 589 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  29.93 
 
 		 589 aa  138  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  27.63 
 
 		 616 aa  137  4e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  28.7 
 
 		 504 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  29.86 
 
 		 926 aa  133  9e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>