More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2511 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  100 
 
 		 507 aa  1041    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  38.88 
 
 		 519 aa  364  2e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  39.18 
 
 		 519 aa  363  4e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  38.51 
 
 		 517 aa  354  2e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  37.55 
 
 		 519 aa  352  7e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  38.7 
 
 		 517 aa  350  3e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  39.88 
 
 		 511 aa  349  7e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  37.92 
 
 		 517 aa  348  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  38.24 
 
 		 510 aa  345  1e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  36.94 
 
 		 517 aa  341  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  39.11 
 
 		 506 aa  335  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  39.09 
 
 		 506 aa  331  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  37.38 
 
 		 512 aa  331  2e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  39.29 
 
 		 506 aa  331  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  38.89 
 
 		 506 aa  329  6e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  37.57 
 
 		 517 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  39.08 
 
 		 521 aa  328  2.0000000000000001e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  37.85 
 
 		 500 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  40.27 
 
 		 508 aa  311  2e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  36.98 
 
 		 506 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  39.11 
 
 		 506 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  37.24 
 
 		 483 aa  310  5e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  36.68 
 
 		 518 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  39.83 
 
 		 494 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  36.62 
 
 		 506 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  36.42 
 
 		 506 aa  301  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  35.73 
 
 		 515 aa  298  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  37.72 
 
 		 519 aa  293  7e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  36.91 
 
 		 511 aa  289  7e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  36.35 
 
 		 520 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  34.88 
 
 		 499 aa  281  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  34.05 
 
 		 521 aa  277  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  34.31 
 
 		 500 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0299  flavocytochrome c  34.39 
 
 		 506 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0588345 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1414  flavocytochrome c flavin subunit, putative  34.18 
 
 		 506 aa  265  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2534  flavocytochrome c  34.87 
 
 		 506 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135835  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0325  flavocytochrome c  34.32 
 
 		 507 aa  263  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0276  flavocytochrome c  33.99 
 
 		 505 aa  263  4e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1643  FAD binding domain-containing protein  34.26 
 
 		 491 aa  255  1.0000000000000001e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4184  flavocytochrome c  33.82 
 
 		 503 aa  252  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.159689 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1548  flavocytochrome c flavin subunit  33.46 
 
 		 501 aa  250  5e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00203617  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  32.88 
 
 		 505 aa  247  4e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0254  flavocytochrome c  40.45 
 
 		 367 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  31.77 
 
 		 599 aa  209  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  32.55 
 
 		 515 aa  206  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1545  putative flavocytochrome c flavin subunit  31.5 
 
 		 447 aa  204  2e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  31.74 
 
 		 582 aa  200  6e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  31.58 
 
 		 515 aa  199  9e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  31.58 
 
 		 515 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  30.75 
 
 		 584 aa  196  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  30.94 
 
 		 582 aa  194  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  31.42 
 
 		 609 aa  194  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  29.28 
 
 		 582 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  31.49 
 
 		 605 aa  183  5.0000000000000004e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  29.64 
 
 		 582 aa  183  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  29.64 
 
 		 582 aa  183  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  33.9 
 
 		 596 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  33.69 
 
 		 596 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  33.9 
 
 		 597 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  33.69 
 
 		 596 aa  181  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  30.17 
 
 		 464 aa  178  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  30.45 
 
 		 603 aa  177  4e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  33.26 
 
 		 596 aa  177  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  32.84 
 
 		 596 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  32.84 
 
 		 596 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  32.84 
 
 		 596 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  32.84 
 
 		 596 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  30.56 
 
 		 598 aa  176  9e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  28.94 
 
 		 586 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.68 
 
 		 457 aa  172  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  31.56 
 
 		 631 aa  171  4e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  30.58 
 
 		 650 aa  170  6e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  28.09 
 
 		 586 aa  169  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  31.34 
 
 		 925 aa  168  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  29.8 
 
 		 591 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  31.05 
 
 		 925 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  29.18 
 
 		 588 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  31.5 
 
 		 593 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  30.35 
 
 		 957 aa  162  9e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  28.96 
 
 		 606 aa  162  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.36 
 
 		 465 aa  161  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  29.3 
 
 		 926 aa  159  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  28.97 
 
 		 598 aa  158  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.75 
 
 		 502 aa  157  5.0000000000000005e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  29.23 
 
 		 583 aa  156  7e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  29.18 
 
 		 589 aa  154  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  28.33 
 
 		 598 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  29.01 
 
 		 596 aa  152  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  29.91 
 
 		 608 aa  151  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  28.33 
 
 		 637 aa  150  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  29.01 
 
 		 596 aa  150  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  28.54 
 
 		 597 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  28.97 
 
 		 616 aa  147  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  28.48 
 
 		 589 aa  147  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  28.48 
 
 		 596 aa  147  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  28.73 
 
 		 596 aa  147  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  28.09 
 
 		 591 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  28.35 
 
 		 596 aa  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.43 
 
 		 589 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  27.68 
 
 		 504 aa  134  5e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>