More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1725 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  100 
 
 
236 aa  481  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  60.35 
 
 
235 aa  285  2.9999999999999996e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  58.95 
 
 
230 aa  276  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  60.36 
 
 
226 aa  274  9e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  58.67 
 
 
228 aa  271  8.000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  58.67 
 
 
229 aa  266  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  56.64 
 
 
248 aa  265  4e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  56.31 
 
 
235 aa  264  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  59.39 
 
 
241 aa  263  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  59.19 
 
 
230 aa  263  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  58.11 
 
 
260 aa  262  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  56.44 
 
 
228 aa  261  8e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  57.14 
 
 
246 aa  259  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  56.19 
 
 
237 aa  258  4e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  56.31 
 
 
242 aa  258  6e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  57.21 
 
 
242 aa  258  7e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  56.5 
 
 
236 aa  257  9e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  55.86 
 
 
233 aa  257  9e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  55.56 
 
 
240 aa  257  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  56.05 
 
 
244 aa  255  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  56 
 
 
241 aa  256  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  55.75 
 
 
238 aa  255  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  52.68 
 
 
238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  54.95 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  55.41 
 
 
233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  53.85 
 
 
252 aa  252  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  52.7 
 
 
240 aa  253  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  54.95 
 
 
253 aa  251  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  56.76 
 
 
239 aa  251  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  54.95 
 
 
241 aa  251  6e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  53.36 
 
 
237 aa  251  7e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  54.22 
 
 
241 aa  251  7e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  54.05 
 
 
247 aa  251  9.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  54.5 
 
 
232 aa  250  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  54.39 
 
 
236 aa  250  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  52.44 
 
 
238 aa  250  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  54.5 
 
 
239 aa  250  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  53.15 
 
 
252 aa  249  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  52.7 
 
 
236 aa  250  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  57.89 
 
 
255 aa  248  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  56.76 
 
 
244 aa  248  5e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  56.76 
 
 
225 aa  248  6e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  55.31 
 
 
225 aa  248  7e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  57.97 
 
 
236 aa  247  9e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1413  ABC transporter ATPase  53.54 
 
 
233 aa  247  1e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  53.3 
 
 
251 aa  247  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  53.48 
 
 
256 aa  247  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  54.05 
 
 
224 aa  246  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  54.11 
 
 
236 aa  246  2e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  55.11 
 
 
234 aa  246  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  53.74 
 
 
226 aa  246  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  54.34 
 
 
228 aa  246  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  53.6 
 
 
224 aa  246  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  54.05 
 
 
224 aa  246  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  55.11 
 
 
234 aa  246  2e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  54.05 
 
 
224 aa  246  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3234  ABC transporter related  56.89 
 
 
227 aa  246  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0162255  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  54.05 
 
 
224 aa  246  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  53.15 
 
 
225 aa  246  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  55.86 
 
 
240 aa  245  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  53.6 
 
 
224 aa  246  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  54.95 
 
 
235 aa  245  4e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  53.6 
 
 
224 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  53.3 
 
 
226 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  53.6 
 
 
224 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  53.6 
 
 
224 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  51.77 
 
 
233 aa  245  6e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  54.63 
 
 
266 aa  244  8e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  53.3 
 
 
226 aa  244  8e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3037  ABC transporter-related protein  58.7 
 
 
241 aa  244  9e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000724399  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  52.86 
 
 
226 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  52.86 
 
 
226 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  53.15 
 
 
224 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  52.86 
 
 
226 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  52.86 
 
 
226 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  52.86 
 
 
226 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  56.31 
 
 
224 aa  244  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  57.56 
 
 
211 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  52.86 
 
 
226 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  52.86 
 
 
226 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  52.86 
 
 
226 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  52.7 
 
 
244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  55.41 
 
 
233 aa  243  3e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  52.7 
 
 
224 aa  243  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  52.42 
 
 
253 aa  243  3e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0816  ABC-type transport system, ATPase component  53.12 
 
 
235 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  54.05 
 
 
228 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  53.98 
 
 
233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  51.8 
 
 
228 aa  241  5e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  53.88 
 
 
230 aa  242  5e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  53.39 
 
 
259 aa  241  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3549  ABC transporter related  53.15 
 
 
255 aa  242  5e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  52.25 
 
 
640 aa  241  7e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  54.71 
 
 
230 aa  240  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  53.12 
 
 
249 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  54.22 
 
 
707 aa  240  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  51.79 
 
 
277 aa  239  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2038  ABC transporter related  52.7 
 
 
233 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.376795  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  53.15 
 
 
228 aa  240  2e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  51.35 
 
 
644 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>