112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0734 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0734  outer membrane porin  100 
 
 		 384 aa  777    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.536638  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0366  outer membrane porin  35.47 
 
 		 403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000502534  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2087  outer membrane porin  33.17 
 
 		 452 aa  169  8e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0019  outer membrane porin  33.33 
 
 		 402 aa  153  4e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00360128  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0469  outer membrane porin  31.63 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000534788  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0715  outer membrane porin  28.98 
 
 		 451 aa  137  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0142723  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3627  outer membrane porin  30.11 
 
 		 435 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0474  outer membrane porin  32.77 
 
 		 407 aa  127  5e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000458474  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2207  metalloid reductase RarA  29.64 
 
 		 458 aa  110  3e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4147  outer membrane porin  26.79 
 
 		 407 aa  109  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.17719 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4293  outer membrane porin  26.01 
 
 		 398 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0195017  normal  0.981008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0255  outer membrane porin  24.93 
 
 		 406 aa  95.9  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1540  outer membrane porin  26.08 
 
 		 456 aa  94.4  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000339272  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2788  outer membrane porin  25.4 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.149615 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3175  outer membrane porin  25.83 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.442937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1456  hypothetical protein  33.33 
 
 		 450 aa  76.3  0.0000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3385  outer membrane porin  25 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.228993  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1155  outer membrane porin  23.8 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  25.9 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1260  outer membrane porin  22.18 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000749415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  26.45 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0137  hypothetical protein  26.46 
 
 		 447 aa  67.4  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0760948  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0307  hypothetical protein  29.36 
 
 		 280 aa  67  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000284732  decreased coverage  0.00000657786 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  25.33 
 
 		 433 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3618  outer membrane porin  24.3 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  25.9 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3692  outer membrane porin  23.76 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4009  outer membrane porin  27.12 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  25.34 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  24.58 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  24.1 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  24.64 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  24.27 
 
 		 433 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0265  hypothetical protein  23.95 
 
 		 493 aa  62  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000273485  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  23.29 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  24.79 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0046  porin, putative  22.22 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0060  outer membrane porin  22.22 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360119  hitchhiker  0.00983666 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0060  outer membrane porin  22.22 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0063  outer membrane porin  22.22 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166078 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1215  outer membrane porin  26.15 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000387662  hitchhiker  0.0000000148872 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1497  hypothetical protein  26.15 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  24.84 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  22.6 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  24.09 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  33.77 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3212  outer membrane porin  24.18 
 
 		 414 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0114  hypothetical protein  31.58 
 
 		 483 aa  56.2  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  32.3 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  23.75 
 
 		 431 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  23.48 
 
 		 431 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1097  outer membrane porin  24.37 
 
 		 446 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000158939  normal  0.0454814 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  24.16 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  22.51 
 
 		 439 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4807  outer membrane porin  22.17 
 
 		 441 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1660  outer membrane porin  23.92 
 
 		 428 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.133249  normal  0.448938 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1991  hypothetical protein  23.92 
 
 		 428 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0954759  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  26.18 
 
 		 411 aa  53.9  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32270  putative porin  21.85 
 
 		 448 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0369  outer membrane porin, OprD family  21.96 
 
 		 441 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2103  outer membrane porin  22.57 
 
 		 447 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02020  putative outer membrane porin  24.56 
 
 		 444 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.485691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2286  outer membrane porin  23.57 
 
 		 447 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197845  normal  0.381133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3630  porin, putative  21.25 
 
 		 447 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.563573  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3290  outer membrane porin, OprD family  23.99 
 
 		 441 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1171  outer membrane porin  22.3 
 
 		 446 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00378662  normal  0.540471 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4665  outer membrane porin  25.09 
 
 		 438 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109112  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1367  outer membrane porin  24.75 
 
 		 468 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  22.81 
 
 		 421 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1763  hypothetical protein  25.77 
 
 		 367 aa  49.7  0.00008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0242  porin  23.84 
 
 		 444 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  23.13 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  23.67 
 
 		 415 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2214  outer membrane porin  21.04 
 
 		 440 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154417  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2927  outer membrane porin OprE  27.35 
 
 		 443 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534215  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2267  hypothetical protein  29.13 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00968313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1363  outer membrane porin  34.43 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475695  normal  0.0504292 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  24.52 
 
 		 427 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  23.54 
 
 		 421 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  25.34 
 
 		 421 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  22.35 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  24.01 
 
 		 427 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  22.63 
 
 		 417 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  23.76 
 
 		 416 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  23.25 
 
 		 427 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2734  putative porin  20.54 
 
 		 455 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34191  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4878  outer membrane porin  22.15 
 
 		 448 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477958  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  25 
 
 		 421 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  23.53 
 
 		 416 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0799  outer membrane porin  23.05 
 
 		 444 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230822  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  38.55 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  23.33 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1463  hypothetical protein  23.63 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.62928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0822  outer membrane porin  23.76 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43059  normal  0.142629 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  38.55 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0833  outer membrane porin  23.4 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1456  outer membrane porin  33.33 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4394  outer membrane porin  24.11 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461784  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5250  porin, putative  21.74 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5160  outer membrane porin  22.4 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.264325 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>