16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0114 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0114  hypothetical protein  100 
 
 		 483 aa  981    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1951  hypothetical protein  49.89 
 
 		 424 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2309  hypothetical protein  49.89 
 
 		 424 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0988635  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0137  hypothetical protein  27.09 
 
 		 447 aa  113  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0760948  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1215  outer membrane porin  24.64 
 
 		 442 aa  111  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000387662  hitchhiker  0.0000000148872 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1497  hypothetical protein  24.64 
 
 		 442 aa  111  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1660  outer membrane porin  24.85 
 
 		 428 aa  97.8  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.133249  normal  0.448938 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1991  hypothetical protein  24.85 
 
 		 428 aa  97.8  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0954759  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0307  hypothetical protein  29.86 
 
 		 280 aa  87.8  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000284732  decreased coverage  0.00000657786 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0734  outer membrane porin  31.58 
 
 		 384 aa  56.2  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.536638  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1763  hypothetical protein  30.43 
 
 		 367 aa  54.3  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1540  outer membrane porin  23.02 
 
 		 456 aa  53.9  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000339272  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3175  outer membrane porin  21.76 
 
 		 420 aa  53.9  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.442937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0265  hypothetical protein  25.17 
 
 		 493 aa  45.8  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000273485  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0469  outer membrane porin  29.63 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000534788  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1456  hypothetical protein  27.14 
 
 		 450 aa  44.3  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>