More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3157 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  100 
 
 
238 aa  481  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  46.29 
 
 
233 aa  192  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  52.3 
 
 
229 aa  190  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  54.24 
 
 
375 aa  144  9e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  50 
 
 
453 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  44.51 
 
 
399 aa  141  7e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  59.29 
 
 
524 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  45.91 
 
 
690 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  52.71 
 
 
411 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  48.23 
 
 
456 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  48 
 
 
309 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  43.9 
 
 
399 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  56.25 
 
 
527 aa  138  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  45.64 
 
 
454 aa  137  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  39.5 
 
 
457 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  43.67 
 
 
455 aa  137  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  52.89 
 
 
569 aa  137  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  59.62 
 
 
529 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  46.97 
 
 
460 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  47.52 
 
 
459 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  46.67 
 
 
271 aa  137  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  54.55 
 
 
533 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  59.17 
 
 
490 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  45.16 
 
 
443 aa  135  8e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  46.43 
 
 
423 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  51.47 
 
 
303 aa  133  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  42.93 
 
 
442 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  45.39 
 
 
446 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  43.84 
 
 
455 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  53.12 
 
 
400 aa  132  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  48.61 
 
 
238 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  39.31 
 
 
325 aa  132  5e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  53.33 
 
 
429 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  52.54 
 
 
376 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  50.41 
 
 
265 aa  131  6.999999999999999e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  44.83 
 
 
392 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  58.65 
 
 
523 aa  131  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  48.48 
 
 
323 aa  131  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  47.73 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  46.15 
 
 
464 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  52.85 
 
 
741 aa  131  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  49.29 
 
 
439 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  52.5 
 
 
440 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  52.07 
 
 
692 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  51.64 
 
 
321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  52.5 
 
 
437 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0074  peptidase M23B  60.53 
 
 
513 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  52.5 
 
 
440 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  35.68 
 
 
300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  53.45 
 
 
372 aa  129  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  48.61 
 
 
238 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  50 
 
 
404 aa  130  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  52.5 
 
 
471 aa  129  3e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  47.66 
 
 
301 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  39.36 
 
 
460 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  46.34 
 
 
681 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  50.86 
 
 
377 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  44.06 
 
 
392 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  49.62 
 
 
299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  52.07 
 
 
695 aa  128  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  47.48 
 
 
645 aa  128  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  48.55 
 
 
415 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  45.74 
 
 
282 aa  128  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  50.41 
 
 
676 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  48.57 
 
 
440 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  52.14 
 
 
377 aa  128  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  57.14 
 
 
687 aa  128  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  55 
 
 
472 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  41.42 
 
 
695 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  46.88 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  49.59 
 
 
680 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  39.31 
 
 
450 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  51.67 
 
 
471 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  44.68 
 
 
447 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  62.75 
 
 
402 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  44.68 
 
 
447 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  50.83 
 
 
362 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  49.21 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  50.82 
 
 
468 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  42.68 
 
 
414 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  49.59 
 
 
681 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  54.46 
 
 
441 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  46.15 
 
 
379 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  44.06 
 
 
391 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1891  peptidase M23B  44.97 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  47.76 
 
 
271 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  48.48 
 
 
465 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  45.12 
 
 
676 aa  126  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  47.76 
 
 
271 aa  126  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  43.61 
 
 
430 aa  126  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0192  Peptidase M23  51.13 
 
 
312 aa  126  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  45.59 
 
 
446 aa  126  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  49.18 
 
 
523 aa  126  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  50.39 
 
 
417 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  53.28 
 
 
503 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  50.41 
 
 
346 aa  125  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  46.21 
 
 
457 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  37.86 
 
 
324 aa  126  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  50.82 
 
 
447 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  45.62 
 
 
651 aa  125  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>