189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1606 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  100 
 
 
696 aa  1412  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  8.72297e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  35.04 
 
 
668 aa  402  1e-110  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  33.93 
 
 
699 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  31.66 
 
 
702 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 
702 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  34.97 
 
 
673 aa  365  2e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  4.12727e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  30.8 
 
 
702 aa  363  6e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 
661 aa  339  9e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 
685 aa  332  2e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 
684 aa  189  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  25.87 
 
 
695 aa  163  8e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 
697 aa  152  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 
760 aa  151  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 
793 aa  146  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  24.75 
 
 
662 aa  142  2e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 
699 aa  134  8e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 
681 aa  130  1e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  24.33 
 
 
668 aa  129  1e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  24.59 
 
 
668 aa  127  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 
668 aa  125  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  23.87 
 
 
663 aa  125  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 
766 aa  121  4e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 
750 aa  120  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  22.04 
 
 
726 aa  119  2e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  21.78 
 
 
723 aa  116  1e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  21.57 
 
 
719 aa  116  1e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  22.48 
 
 
716 aa  113  1e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  22.98 
 
 
687 aa  113  2e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  23.84 
 
 
745 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  23.84 
 
 
745 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  22.87 
 
 
667 aa  112  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  23.84 
 
 
745 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2086  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  24.45 
 
 
665 aa  111  4e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  2.85057e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  23.9 
 
 
661 aa  111  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  23.39 
 
 
749 aa  110  7e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  23.39 
 
 
745 aa  110  8e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  23.39 
 
 
749 aa  110  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  22.2 
 
 
676 aa  108  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2688  TonB-dependent receptor protein  21.28 
 
 
772 aa  107  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.96874  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  22.52 
 
 
753 aa  107  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 
729 aa  107  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 
713 aa  107  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  21.35 
 
 
688 aa  107  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  22.89 
 
 
687 aa  107  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  23.29 
 
 
710 aa  107  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  22.2 
 
 
676 aa  106  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  22.89 
 
 
709 aa  107  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  21.9 
 
 
688 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  21.9 
 
 
688 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  22.02 
 
 
724 aa  104  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  22.22 
 
 
667 aa  103  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  22.36 
 
 
725 aa  102  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 
768 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  22.21 
 
 
710 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  21.75 
 
 
688 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  22.36 
 
 
698 aa  102  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 
685 aa  102  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  22.21 
 
 
710 aa  99.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  22.21 
 
 
710 aa  99.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  22.21 
 
 
710 aa  99.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0484  TonB-dependent receptor  21.7 
 
 
749 aa  98.2  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698636  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  22.63 
 
 
713 aa  97.8  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  22.03 
 
 
718 aa  97.4  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  22.54 
 
 
767 aa  97.1  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  22.77 
 
 
708 aa  96.3  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  22.77 
 
 
713 aa  95.1  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  22.19 
 
 
713 aa  94.4  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  22.03 
 
 
686 aa  94  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  23.21 
 
 
684 aa  94  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  21.73 
 
 
708 aa  93.6  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 
672 aa  92.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3368  TonB-dependent receptor  21.11 
 
 
717 aa  89.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3454  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 
713 aa  89  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0534  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 
713 aa  88.6  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5315  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.26 
 
 
767 aa  88.2  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0425  TonB-dependent receptor domain-containing protein  25.63 
 
 
625 aa  87.4  9e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00623502  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 
769 aa  87  1e-15  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0496  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 
713 aa  86.7  1e-15  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2813  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.64 
 
 
752 aa  85.9  2e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409295  normal  0.033455 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 
698 aa  84.3  7e-15  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  21.52 
 
 
713 aa  84  8e-15  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  23.61 
 
 
669 aa  82.4  3e-14  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4299  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 
766 aa  82  4e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.570809  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0440  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  22.19 
 
 
764 aa  80.9  7e-14  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0221  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.29 
 
 
755 aa  80.9  8e-14  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3079  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.4 
 
 
749 aa  80.9  8e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578184  normal  0.640721 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1781  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.19 
 
 
769 aa  80.5  1e-13  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5431  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  24.68 
 
 
755 aa  80.1  1e-13  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0347  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  22.44 
 
 
759 aa  80.5  1e-13  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5431  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.68 
 
 
755 aa  80.1  1e-13  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469015  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1115  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  22.44 
 
 
767 aa  79.3  2e-13  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4838  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.68 
 
 
757 aa  79.7  2e-13  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2089  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  22.44 
 
 
767 aa  79.3  2e-13  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329074  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1826  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.44 
 
 
718 aa  79.3  2e-13  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0529347  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0824  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  22.19 
 
 
767 aa  79.3  2e-13  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.359227  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4772  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.23 
 
 
769 aa  79  3e-13  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.784759  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3338  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.6 
 
 
755 aa  75.9  2e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.275973  decreased coverage  0.000566863 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2139  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.1 
 
 
766 aa  73.6  1e-11  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3082  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.8 
 
 
730 aa  73.2  1e-11  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25355  normal  0.407735 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0422  TonB-dependent receptor  23.01 
 
 
744 aa  73.2  2e-11  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328306  normal  0.298969 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>