More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2320 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  100 
 
 		 530 aa  1059    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0654  choline/carnitine/betaine transport  45.25 
 
 		 544 aa  464  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  45.53 
 
 		 523 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  42.51 
 
 		 503 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  43.69 
 
 		 490 aa  423  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  43.71 
 
 		 498 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  42.22 
 
 		 659 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  42.16 
 
 		 659 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  42.46 
 
 		 532 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  43.56 
 
 		 516 aa  397  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0757  choline/carnitine/betaine transport  43.75 
 
 		 525 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26622  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  38.62 
 
 		 600 aa  394  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  41.95 
 
 		 504 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  40.79 
 
 		 516 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  39.65 
 
 		 506 aa  389  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  40.96 
 
 		 494 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  40.83 
 
 		 505 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  40.76 
 
 		 504 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  39.24 
 
 		 657 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  40.56 
 
 		 505 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  41.15 
 
 		 505 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  41.15 
 
 		 505 aa  388  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  41.15 
 
 		 505 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  41.15 
 
 		 505 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  41.15 
 
 		 505 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  41.19 
 
 		 516 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  41.15 
 
 		 505 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  40.91 
 
 		 504 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  40.4 
 
 		 516 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  40.59 
 
 		 516 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  40.59 
 
 		 516 aa  385  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  40.59 
 
 		 516 aa  385  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  40.59 
 
 		 516 aa  385  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  40.79 
 
 		 516 aa  382  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  40.59 
 
 		 516 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  40.04 
 
 		 508 aa  384  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2025  choline/carnitine/betaine transporter  41.94 
 
 		 533 aa  383  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  38.68 
 
 		 531 aa  382  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  39.88 
 
 		 606 aa  376  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3326  choline/carnitine/betaine transporter  39.96 
 
 		 525 aa  375  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188195  normal  0.774831 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  38.68 
 
 		 520 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  38.68 
 
 		 520 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  37.21 
 
 		 548 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  37.21 
 
 		 548 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  37.57 
 
 		 542 aa  372  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3628  choline/carnitine/betaine transporter  37.48 
 
 		 581 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  37.23 
 
 		 546 aa  369  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  37.26 
 
 		 551 aa  371  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2105  choline/carnitine/betaine transporter  37.48 
 
 		 581 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3164  choline/carnitine/betaine transporter  38.79 
 
 		 660 aa  371  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  40.34 
 
 		 497 aa  370  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2676  choline/carnitine/betaine transporter  39.34 
 
 		 582 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2288  choline/carnitine/betaine transporter  37.28 
 
 		 582 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529795 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  36.99 
 
 		 531 aa  365  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  38.49 
 
 		 637 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  39.07 
 
 		 610 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1610  hypothetical protein  37.55 
 
 		 646 aa  367  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00096761  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1505  choline/carnitine/betaine transporter  38.52 
 
 		 668 aa  365  1e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  38.68 
 
 		 606 aa  364  2e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2906  choline/carnitine/betaine transporter  38.54 
 
 		 577 aa  363  4e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  40.17 
 
 		 545 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  39.39 
 
 		 573 aa  362  7.0000000000000005e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  40.48 
 
 		 573 aa  362  8e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0727  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  37.1 
 
 		 681 aa  359  6e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  37.83 
 
 		 550 aa  359  6e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  39.24 
 
 		 661 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25390  choline/carnitine/betaine transport  38.88 
 
 		 514 aa  357  2.9999999999999997e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.229483  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1132  choline/carnitine/betaine transporter  36.5 
 
 		 574 aa  357  2.9999999999999997e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  37.68 
 
 		 667 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2741  choline/carnitine/betaine transporter  37.38 
 
 		 661 aa  355  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1301  BCCT family betaine/choline/carnitine/glycine transporter  36.78 
 
 		 682 aa  355  1e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0875  choline/carnitine/betaine transport  39.37 
 
 		 681 aa  355  1e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  36.91 
 
 		 583 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1174  choline transporter  36.09 
 
 		 671 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12990  choline transporter  35.96 
 
 		 653 aa  352  8e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.283179 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04148  secondary glycine betaine transporter BetU  39.8 
 
 		 667 aa  352  1e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1441  choline/carnitine/betaine transporter  38.94 
 
 		 658 aa  351  1e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04111  hypothetical protein  39.8 
 
 		 667 aa  352  1e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  37.01 
 
 		 685 aa  352  1e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0764  transporter, BCCT family  39.8 
 
 		 667 aa  351  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.846408  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  36.84 
 
 		 582 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4336  choline/carnitine/betaine transporter  37.33 
 
 		 529 aa  351  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  36.84 
 
 		 582 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0154  choline/carnitine/betaine transporter  38.55 
 
 		 682 aa  350  3e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  36.33 
 
 		 567 aa  350  3e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13010  choline/carnitine/betaine transport  37.89 
 
 		 603 aa  350  3e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.639384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  36.84 
 
 		 582 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4850  BCCT family transporter  39.6 
 
 		 667 aa  350  4e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0079  choline/carnitine/betaine transporter  36.85 
 
 		 558 aa  350  5e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2609  choline/carnitine/betaine transporter  40.3 
 
 		 573 aa  349  8e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0501554  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5061  choline/carnitine/betaine transporter  32.84 
 
 		 667 aa  349  9e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536897  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  38.11 
 
 		 530 aa  349  9e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  38.43 
 
 		 661 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1485  choline/carnitine/betaine transporter  34.88 
 
 		 580 aa  348  2e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00724238  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1576  choline/carnitine/betaine transporter  37.95 
 
 		 658 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1542  choline/carnitine/betaine transporter  37.95 
 
 		 658 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.869304  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1362  choline/carnitine/betaine transport  38.25 
 
 		 673 aa  347  3e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000623924  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2804  choline/carnitine/betaine transporter  37.95 
 
 		 658 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  37.85 
 
 		 656 aa  347  4e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4934  choline/carnitine/betaine transporter  32.65 
 
 		 667 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.205263  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>