More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0803 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  100 
 
 
160 aa  313  6e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  39.46 
 
 
155 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  39.31 
 
 
153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  43.57 
 
 
147 aa  110  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  39.58 
 
 
152 aa  107  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  40.97 
 
 
153 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0960  CBS domain-containing protein  37.76 
 
 
153 aa  102  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0461508  hitchhiker  0.00174257 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  37.86 
 
 
150 aa  98.2  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  37.06 
 
 
152 aa  97.8  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  42.07 
 
 
153 aa  97.4  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  35.66 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  38.46 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  36.81 
 
 
150 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  35 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  38.89 
 
 
154 aa  94.7  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  37.06 
 
 
149 aa  94.4  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  38.19 
 
 
149 aa  94.4  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  36.11 
 
 
149 aa  93.6  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  38.03 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  38.19 
 
 
149 aa  92  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  38 
 
 
153 aa  90.9  7e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  36.81 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  36.11 
 
 
153 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  30.14 
 
 
149 aa  89.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  37.14 
 
 
155 aa  89.4  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  36.11 
 
 
153 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  38.57 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  38.57 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  42.18 
 
 
247 aa  87.8  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  37.14 
 
 
153 aa  87  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1597  CBS domain containing membrane protein  34.67 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.105679 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1925  CBS domain protein  34.67 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  32.86 
 
 
149 aa  84.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  43.18 
 
 
246 aa  84.7  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  34.27 
 
 
150 aa  84.7  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  40 
 
 
229 aa  84  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  35.57 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  40.69 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  41.61 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  35.92 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  37.41 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  36.67 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  35.1 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1182  putative transcriptional regulator, XRE family  30.5 
 
 
147 aa  80.9  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000705125  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  38.19 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  33.1 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17501  IMP dehydrogenase-like protein  33.57 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1879  CBS  29.93 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  32.87 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  40.74 
 
 
249 aa  78.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  35.95 
 
 
223 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  39.04 
 
 
212 aa  77  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  37.93 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  33.76 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  37.93 
 
 
233 aa  75.5  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  31.13 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  36.67 
 
 
232 aa  74.7  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  28.67 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  33.1 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  33.78 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  37.24 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0774  CBS  29.25 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  30.46 
 
 
154 aa  72  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  42.36 
 
 
246 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.5 
 
 
243 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  35.77 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  29.79 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  35.62 
 
 
217 aa  70.5  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  36.77 
 
 
769 aa  70.5  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  34.97 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  32.39 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  36.11 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  35.53 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  30.5 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  32.43 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  34.46 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  35.22 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0640  CBS domain-containing protein  32.87 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  36.81 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  33.55 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  37.67 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  34.21 
 
 
427 aa  68.6  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  36.42 
 
 
348 aa  68.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  36.03 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  28.38 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  32.64 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  29.86 
 
 
155 aa  67  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  31.47 
 
 
427 aa  65.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  30.92 
 
 
385 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  34.27 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  36.03 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  35.1 
 
 
423 aa  66.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  30.67 
 
 
384 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  33.11 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  30.67 
 
 
384 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2651  putative signal transduction protein with CBS domains  30.92 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  31.2 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
216 aa  63.9  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  30.82 
 
 
863 aa  63.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>