More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0031 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0031  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.213809  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2967  LysR family transcriptional regulator  90.1 
 
 		 292 aa  534  1e-151  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.991326 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0669  transcriptional regulator LysR family  84.51 
 
 		 299 aa  518  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1990  LysR family transcriptional regulator  82.77 
 
 		 298 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288797  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6055  LysR family transcriptional regulator  77.89 
 
 		 297 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0813453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5691  LysR family transcriptional regulator  77.89 
 
 		 297 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6539  LysR family transcriptional regulator  77.13 
 
 		 297 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.189801 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7231  LysR family transcriptional regulator  76.09 
 
 		 301 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.112256 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1476  LysR family transcriptional regulator  76.69 
 
 		 299 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.955554  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4397  LysR family transcriptional regulator  73.54 
 
 		 295 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544326  normal  0.0963466 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4916  LysR family transcriptional regulator  72.24 
 
 		 283 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1882  LysR family transcriptional regulator  58.16 
 
 		 302 aa  362  3e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5015  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  43.77 
 
 		 328 aa  245  8e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.46519  normal  0.168867 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5069  LysR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00568872  normal  0.0350365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0116  LysR family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.734759  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05850  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0550  putative transcriptional regulator  44.41 
 
 		 302 aa  242  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0157  LysR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 305 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000802537 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0176  LysR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 305 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.175853  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5462  transcriptional regulator, LysR family  43.2 
 
 		 306 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.278821  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0174  LysR family transcriptional regulator  42.09 
 
 		 305 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0894  LysR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0776  LysR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 302 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.861314  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0499  LysR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 302 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0681  LysR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 302 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0570  LysR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 302 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.546598  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2084  LysR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 302 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1987  LysR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 302 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58662  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1635  LysR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 302 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4430  LysR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 298 aa  225  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.3079  normal  0.432703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0117  transcriptional regulator, LysR family  41.81 
 
 		 302 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02150  transcription regulator transcription regulator protein  43.1 
 
 		 296 aa  215  8e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2690  LysR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 316 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1983  LysR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360577  hitchhiker  0.00420822 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3409  LysR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.690541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2772  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.500434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6757  transcriptional regulator, LysR family  44.48 
 
 		 310 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0418  transcriptional regulator, LysR family  43.77 
 
 		 298 aa  212  7e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5241  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 317 aa  212  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.11151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3466  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 315 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4055  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 315 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5160  LysR family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 317 aa  210  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.709796 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24960  LysR family transcriptional regulator protein  39.46 
 
 		 304 aa  209  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2208  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 315 aa  209  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.860838  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5573  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 301 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1256  LysR family transcriptional regulator  39 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.196796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1461  LysR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 310 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0665  LysR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 304 aa  196  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0688297  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1019  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1341  transcriptional regulator, LysR family  41.98 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.281725  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5311  LysR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 296 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256019  normal  0.0494064 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4071  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5169  LysR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal  0.0670669 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2519  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  hitchhiker  0.00756718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5641  LysR family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 309 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5259  LysR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 296 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0212  LysR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 296 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0028482  normal  0.250883 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4107  LysR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 298 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.41444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1757  LysR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 298 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074148 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0906  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3680  LysR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.301341  hitchhiker  0.00043388 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0983  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288934  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64910  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 312 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3381  LysR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3604  LysR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 323 aa  189  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1038  transcriptional regulator, LysR family  38.01 
 
 		 302 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.143731 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5533  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  41 
 
 		 302 aa  189  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3156  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 297 aa  188  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2406  transcriptional regulator, LysR family  38.83 
 
 		 317 aa  188  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2978  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2995  transcriptional regulator, LysR family  40.96 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1725  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 326 aa  185  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3949  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 296 aa  185  9e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2377  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 298 aa  183  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.120288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0596  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.88 
 
 		 301 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.327486 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4920  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5907  transcriptional regulator LysR family  37.63 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2171  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1048  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0879  LysR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1086  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 310 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404999  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3787  transcriptional regulator, LysR family  39.31 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5664  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 306 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318296 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5716  transcriptional regulator LysR family  39.59 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340323  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8482  transcriptional regulator, LysR family  38.46 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0253  DNA-binding transcriptional activator GcvA  39.74 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208187  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0892  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 325 aa  176  5e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4494  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1418  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.380241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4116  transcriptional regulator, LysR family  39.46 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0418  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.58 
 
 		 306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171121  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4000  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 294 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117315 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0823  transcriptional regulator, LysR family  36.18 
 
 		 301 aa  172  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0743  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 301 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.876946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0878  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3007  DNA-binding transcriptional activator GcvA  38.93 
 
 		 294 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3783  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.00000939543 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0477  DNA-binding transcriptional activator GcvA  38.67 
 
 		 293 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0281  DNA-binding transcriptional activator GcvA  38.67 
 
 		 293 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4524  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 308 aa  169  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>