More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0281 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0477  DNA-binding transcriptional activator GcvA  100 
 
 
293 aa  587  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0281  DNA-binding transcriptional activator GcvA  100 
 
 
293 aa  587  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0293  DNA-binding transcriptional activator GcvA  100 
 
 
293 aa  587  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0253  DNA-binding transcriptional activator GcvA  95.9 
 
 
293 aa  560  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208187  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6358  DNA-binding transcriptional activator GcvA  86.94 
 
 
294 aa  510  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.478035  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3012  DNA-binding transcriptional activator GcvA  85.91 
 
 
294 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3031  DNA-binding transcriptional activator GcvA  86.25 
 
 
294 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3007  DNA-binding transcriptional activator GcvA  86.6 
 
 
294 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2922  DNA-binding transcriptional activator GcvA  86.94 
 
 
294 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.554203 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2398  DNA-binding transcriptional activator GcvA  85.91 
 
 
294 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273893  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3057  DNA-binding transcriptional activator GcvA  86.94 
 
 
294 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2086  glycine cleavage system transcriptional activator  100 
 
 
335 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.606063  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4417  DNA-binding transcriptional activator GcvA  75.86 
 
 
307 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.838235  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6790  DNA-binding transcriptional activator GcvA  75.78 
 
 
305 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668323  hitchhiker  0.00000431754 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3007  transcriptional regulator  99.56 
 
 
335 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2271  transcriptional regulator, LysR family  53.5 
 
 
311 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1948  transcriptional regulator, LysR family  52.8 
 
 
311 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.244059  normal  0.065003 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4415  LysR family transcriptional regulator  51.88 
 
 
295 aa  287  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6525  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 
301 aa  264  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5893  LysR family transcriptional regulator  47.6 
 
 
295 aa  264  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5998  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 
300 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123891  normal  0.186417 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5325  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 
301 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.972364  normal  0.036575 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5754  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 
300 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4194  transcriptional regulator, LysR family  46.96 
 
 
302 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0402435 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3473  LysR family transcriptional regulator  46.76 
 
 
302 aa  258  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6198  LysR family transcriptional regulator  48.47 
 
 
296 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0533844 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5831  LysR family transcriptional regulator  48.47 
 
 
296 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6674  LysR family transcriptional regulator  48.47 
 
 
296 aa  255  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.143364 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0010  LysR family transcriptional regulator  44.37 
 
 
301 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2479  LysR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
316 aa  239  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102884  hitchhiker  0.0063597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2674  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 
310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.910839 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5947  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 
321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.287273 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5583  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 
321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6419  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 
297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6131  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 
310 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6448  LysR family transcriptional regulator  41.87 
 
 
318 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2422  transcriptional regulator, LysR family  40.89 
 
 
300 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0409685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2145  LysR substrate-binding  41.52 
 
 
300 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.46623  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2465  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
309 aa  205  8e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000370846 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1584  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 
295 aa  204  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534905  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3150  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 
297 aa  203  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2105  transcriptional regulator, LysR family  43.25 
 
 
300 aa  202  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.289933 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2565  DNA-binding transcriptional activator GcvA  38.38 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1048  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 
310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1086  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404999  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2171  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2452  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 
320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000228881 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3066  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.249094  hitchhiker  0.00377983 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2203  DNA-binding transcriptional activator GcvA  37.41 
 
 
303 aa  196  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0223993  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2522  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
320 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00304048  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2639  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 
296 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2764  DNA-binding transcriptional activator GcvA  38.06 
 
 
303 aa  194  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.872031  normal  0.426445 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2795  DNA-binding transcriptional activator GcvA  38.72 
 
 
303 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119571  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7137  DNA-binding transcriptional activator GcvA  39.12 
 
 
306 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126779  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0691  DNA-binding transcriptional activator GcvA  37.25 
 
 
302 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652779  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2894  DNA-binding transcriptional activator GcvA  38.72 
 
 
303 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00417784  hitchhiker  0.00000518904 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2429  DNA-binding transcriptional activator GcvA  38.05 
 
 
303 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0671136  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1449  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 
305 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3737  DNA-binding transcriptional activator GcvA  41.58 
 
 
314 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.42879  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2724  DNA-binding transcriptional activator GcvA  38.72 
 
 
303 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000916948  normal  0.0913399 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1533  DNA-binding transcriptional activator GcvA  38.72 
 
 
303 aa  193  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2614  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 
320 aa  193  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000028926 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2901  transcriptional regulator, LysR family  44.91 
 
 
304 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108446  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0418  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.82 
 
 
306 aa  192  6e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171121  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2984  DNA-binding transcriptional activator GcvA  38.75 
 
 
303 aa  192  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0851103  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3485  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 
305 aa  192  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3471  DNA-binding transcriptional activator GcvA  37.37 
 
 
303 aa  192  8e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000267837  hitchhiker  0.000102426 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1529  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 
301 aa  191  9e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1282  DNA-binding transcriptional activator GcvA  38.38 
 
 
303 aa  191  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433323  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2783  DNA-binding transcriptional activator GcvA  37.02 
 
 
303 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.029199  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2996  DNA-binding transcriptional activator GcvA  38.38 
 
 
303 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.174451  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1350  DNA-binding transcriptional activator GcvA  38.38 
 
 
303 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.960187  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1389  DNA-binding transcriptional activator GcvA  38.38 
 
 
303 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1364  DNA-binding transcriptional activator GcvA  38.38 
 
 
303 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0933505  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1674  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
295 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.126025  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0906  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
299 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.306914  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1652  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
295 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.287567  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004252  glycine cleavage system transcriptional activator GcvA  37.5 
 
 
306 aa  189  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000016906  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2847  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
297 aa  189  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1637  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
295 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0994273  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3322  DNA-binding transcriptional activator GcvA  37.72 
 
 
303 aa  189  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000222387  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01183  DNA-binding transcriptional activator GcvA  37.16 
 
 
306 aa  189  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2706  transcriptional regulator, LysR family  36.11 
 
 
295 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.173124  hitchhiker  0.000000993281 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1815  LysR family transcriptional regulator  40.35 
 
 
307 aa  189  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00510599  hitchhiker  0.000707933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5069  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
302 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00568872  normal  0.0350365 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2169  LysR family regulatory protein  36.01 
 
 
299 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225103  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0927  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.3 
 
 
307 aa  187  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00141405  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0814  LysR family transcriptional regulator  36.01 
 
 
299 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.959289  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2151  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
312 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.349903  normal  0.92042 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05850  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 
302 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1258  transcriptional regulator, LysR family  37.8 
 
 
315 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3377  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.3 
 
 
307 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.649245  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1256  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
310 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.196796  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5693  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 
307 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.45057 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3544  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.95 
 
 
310 aa  186  6e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00470366  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0983  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 
300 aa  185  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288934  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0550  putative transcriptional regulator  36.86 
 
 
302 aa  185  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2767  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 
296 aa  185  8e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1341  transcriptional regulator, LysR family  40.77 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.281725  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3270  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 
318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.321515  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>