More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4916 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4916  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 283 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4397  LysR family transcriptional regulator  98.59 
 
 		 295 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544326  normal  0.0963466 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7231  LysR family transcriptional regulator  73.93 
 
 		 301 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.112256 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0669  transcriptional regulator LysR family  71.43 
 
 		 299 aa  429  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2967  LysR family transcriptional regulator  72.5 
 
 		 292 aa  426  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.991326 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0031  LysR family transcriptional regulator  72.24 
 
 		 299 aa  422  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.213809  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1990  LysR family transcriptional regulator  70.92 
 
 		 298 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288797  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6055  LysR family transcriptional regulator  72.24 
 
 		 297 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0813453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5691  LysR family transcriptional regulator  72.24 
 
 		 297 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6539  LysR family transcriptional regulator  71.17 
 
 		 297 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.189801 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1476  LysR family transcriptional regulator  73.05 
 
 		 299 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.955554  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1882  LysR family transcriptional regulator  56.38 
 
 		 302 aa  338  4e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0116  LysR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 299 aa  223  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.734759  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5015  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  41.46 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.46519  normal  0.168867 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5069  LysR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00568872  normal  0.0350365 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5462  transcriptional regulator, LysR family  41.7 
 
 		 306 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.278821  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0157  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 305 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000802537 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0176  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 305 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.175853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0117  transcriptional regulator, LysR family  42.56 
 
 		 302 aa  212  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0174  LysR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0550  putative transcriptional regulator  40.64 
 
 		 302 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05850  LysR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 302 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0894  LysR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0681  LysR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0776  LysR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.861314  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0499  LysR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0570  LysR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.546598  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2084  LysR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1635  LysR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1987  LysR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58662  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2772  LysR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.500434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1983  LysR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360577  hitchhiker  0.00420822 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5573  LysR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6757  transcriptional regulator, LysR family  44.01 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4430  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.3079  normal  0.432703 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1461  LysR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1019  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 297 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3409  LysR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 317 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.690541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24960  LysR family transcriptional regulator protein  37.68 
 
 		 304 aa  192  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5241  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 317 aa  191  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.11151  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0906  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 310 aa  191  9e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2690  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0983  LysR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288934  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3156  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4055  LysR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 315 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3466  LysR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 315 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5160  LysR family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 317 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.709796 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1256  LysR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 310 aa  190  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.196796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0418  transcriptional regulator, LysR family  38.71 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2519  LysR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  hitchhiker  0.00756718 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1341  transcriptional regulator, LysR family  43.21 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.281725  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0665  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 304 aa  185  8e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0688297  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02150  transcription regulator transcription regulator protein  40.21 
 
 		 296 aa  185  9e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2208  LysR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.860838  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2978  LysR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 317 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2406  transcriptional regulator, LysR family  40.5 
 
 		 317 aa  179  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4071  LysR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5311  LysR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 296 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256019  normal  0.0494064 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0879  LysR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 314 aa  176  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1038  transcriptional regulator, LysR family  40.82 
 
 		 302 aa  175  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.143731 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0212  LysR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 296 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0028482  normal  0.250883 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4107  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 298 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.41444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3604  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5533  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  41.84 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1757  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 298 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074148 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3680  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.301341  hitchhiker  0.00043388 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5169  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 296 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal  0.0670669 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3381  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 298 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5259  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 296 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2995  transcriptional regulator, LysR family  39.72 
 
 		 297 aa  171  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64910  LysR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 312 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1725  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8482  transcriptional regulator, LysR family  41.35 
 
 		 311 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5664  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318296 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5641  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 309 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3949  LysR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2377  LysR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.120288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0823  transcriptional regulator, LysR family  35.66 
 
 		 301 aa  165  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2532  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.54 
 
 		 301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0596  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.27 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.327486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0878  LysR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4920  transcriptional regulator, LysR family  34.27 
 
 		 301 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0743  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 301 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.876946 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3787  transcriptional regulator, LysR family  38.08 
 
 		 300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4524  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4116  transcriptional regulator, LysR family  38.81 
 
 		 300 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5716  transcriptional regulator LysR family  37.19 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340323  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2171  LysR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5907  transcriptional regulator LysR family  34.62 
 
 		 305 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2804  transcriptional regulator, LysR family  37.26 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.860406  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1035  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 317 aa  156  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7468  LysR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0892  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 325 aa  154  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6151  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410647  normal  0.467276 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4413  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.163519  normal  0.82352 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5786  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6082  LysR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 329 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2271  transcriptional regulator, LysR family  36.65 
 
 		 311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2729  LysR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.270725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1048  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 310 aa  152  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>