More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3958 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 		 234 aa  478  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  78.88 
 
 		 231 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5127  cytochrome c oxidase subunit III  71.67 
 
 		 234 aa  346  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  76.42 
 
 		 236 aa  342  2.9999999999999997e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7359  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  69.53 
 
 		 239 aa  319  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5939  cytochrome c oxidase subunit III  71.67 
 
 		 240 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6212  cytochrome c oxidase, subunit III  70.82 
 
 		 240 aa  318  6e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  69.66 
 
 		 239 aa  315  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  69.83 
 
 		 241 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1567  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  74.12 
 
 		 234 aa  311  5.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  69.23 
 
 		 239 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  68.33 
 
 		 240 aa  310  9e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4875  cytochrome c oxidase subunit III  76.39 
 
 		 230 aa  309  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.617721  normal  0.156188 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3798  cytochrome c oxidase subunit III  76.39 
 
 		 230 aa  309  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2477  cytochrome c oxidase, subunit III  72 
 
 		 240 aa  298  6e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  66.67 
 
 		 240 aa  297  9e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0251  cytochrome c oxidase subunit III  75.81 
 
 		 248 aa  289  3e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348503 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  63.03 
 
 		 225 aa  259  3e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  46.05 
 
 		 224 aa  171  7.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0299  cytochrome c oxidase subunit III  45.54 
 
 		 235 aa  161  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405282 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5675  cytochrome c oxidase subunit III  39.67 
 
 		 265 aa  151  8.999999999999999e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.670128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2202  cytochrome c oxidase, subunit III  39.5 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00239455  normal  0.978852 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3466  cytochrome c oxidase subunit III  40 
 
 		 256 aa  140  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0380593 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  42.93 
 
 		 208 aa  125  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  37.67 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  39.38 
 
 		 202 aa  115  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  37.07 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  38.14 
 
 		 832 aa  108  8.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  33.16 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  33.16 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  39.75 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  39.75 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  32.22 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  33.16 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  39.13 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  34.65 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  35.42 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  32.84 
 
 		 208 aa  99  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  38.51 
 
 		 296 aa  97.8  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  39.86 
 
 		 295 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  34.45 
 
 		 209 aa  95.9  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  32.84 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  40.15 
 
 		 290 aa  92.8  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  34.81 
 
 		 291 aa  92.4  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  34.01 
 
 		 229 aa  91.7  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3520  cytochrome c oxidase, subunit III  35.22 
 
 		 291 aa  91.7  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2864  cytochrome c oxidase subunit III  36.23 
 
 		 205 aa  91.7  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0115873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  34.34 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  32.55 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2959  cytochrome c oxidase, subunit III  40.29 
 
 		 289 aa  90.5  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3151  cytochrome c oxidase, subunit III  40 
 
 		 270 aa  90.1  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.874863 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  35.11 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  39.35 
 
 		 209 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  37.91 
 
 		 199 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2808  cytochrome c oxidase, subunit III  39.57 
 
 		 289 aa  89.7  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0330  cytochrome c oxidase, subunit III  36.14 
 
 		 288 aa  90.1  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.625024  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0367  cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  33.72 
 
 		 286 aa  89.4  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  33.82 
 
 		 199 aa  89  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3575  cytochrome c oxidase subunit III  33.86 
 
 		 222 aa  88.6  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515089  normal  0.0102703 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  32.8 
 
 		 201 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  29.22 
 
 		 291 aa  87.8  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  34.02 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1383  cytochrome c oxidase, subunit III  29.82 
 
 		 293 aa  87.8  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3177  putative cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  29.36 
 
 		 293 aa  87.8  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00203621  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  32.39 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  37.76 
 
 		 295 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  29.54 
 
 		 291 aa  87  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 288 aa  87.4  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0187  cytochrome c oxidase, subunit III  30.32 
 
 		 284 aa  87.4  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  33.96 
 
 		 293 aa  87  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0223  cytochrome c oxidase subunit III  34.59 
 
 		 286 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  32.47 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  37.76 
 
 		 295 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  32.8 
 
 		 200 aa  86.7  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  28.63 
 
 		 291 aa  86.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  31.49 
 
 		 201 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  30.69 
 
 		 198 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3903  cytochrome c oxidase, subunit III  31.25 
 
 		 294 aa  86.3  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0637958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1742  cytochrome ubiquinol oxidase subunit III  34.92 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  28.94 
 
 		 293 aa  86.3  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0242  cytochrome c oxidase subunit III  36.62 
 
 		 286 aa  85.9  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0155178 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  30.18 
 
 		 293 aa  85.9  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.69 
 
 		 209 aa  85.5  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  40 
 
 		 200 aa  85.5  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  33.16 
 
 		 825 aa  85.9  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  35.22 
 
 		 291 aa  85.5  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  28.74 
 
 		 234 aa  85.1  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  34.78 
 
 		 295 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  31.75 
 
 		 204 aa  85.1  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4583  cytochrome c oxidase, subunit III  38.17 
 
 		 284 aa  85.1  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4220  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.05 
 
 		 206 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  33.51 
 
 		 201 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  32.11 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  37.01 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  32.82 
 
 		 974 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  31.53 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2332  cytochrome c oxidase, subunit III  38.36 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.938653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0654  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.79 
 
 		 202 aa  84.7  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  35.22 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>