More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0887 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
324 aa  663    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  91.36 
 
 
324 aa  615  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.12 
 
 
332 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.15 
 
 
340 aa  375  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.0406215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.58 
 
 
333 aa  352  5.9999999999999994e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.25 
 
 
343 aa  350  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.69 
 
 
341 aa  346  3e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.09 
 
 
339 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.4 
 
 
341 aa  338  8e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.78 
 
 
341 aa  333  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.87 
 
 
331 aa  328  7e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.98 
 
 
331 aa  328  7e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2701  oxidoreductase  52.2 
 
 
320 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359887  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.23 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  55.42 
 
 
321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6184  oxidoreductase  54.06 
 
 
321 aa  316  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.69376 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.27 
 
 
331 aa  314  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  54.49 
 
 
319 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.73 
 
 
328 aa  311  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165164  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.37 
 
 
315 aa  304  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  52.01 
 
 
320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.38 
 
 
331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1253  oxidoreductase  54.18 
 
 
321 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6579  oxidoreductase  54.18 
 
 
321 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.27 
 
 
318 aa  295  8e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456891  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  50.47 
 
 
318 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2559  Short-chain alcohol dehydrogenase  41.79 
 
 
339 aa  259  5.0000000000000005e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  48.31 
 
 
324 aa  249  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.06 
 
 
320 aa  248  9e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.23 
 
 
325 aa  247  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.79 
 
 
335 aa  244  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.48 
 
 
326 aa  243  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.59 
 
 
325 aa  239  5.999999999999999e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11239  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.65 
 
 
322 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  44.24 
 
 
329 aa  235  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.05 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.289594 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.82 
 
 
326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.93 
 
 
338 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200528  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.2 
 
 
323 aa  227  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 
327 aa  225  8e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.56 
 
 
318 aa  225  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.81 
 
 
313 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.93 
 
 
310 aa  216  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.4 
 
 
326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.86 
 
 
313 aa  209  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00430281  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.65 
 
 
312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863347  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  38.26 
 
 
316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
307 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.87 
 
 
298 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.48 
 
 
297 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.79 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  38.22 
 
 
317 aa  160  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.31 
 
 
312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01783  short-chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00280)  36.47 
 
 
661 aa  153  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0309502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.44 
 
 
241 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 
336 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.893798  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
327 aa  149  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.67 
 
 
303 aa  149  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  38.16 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.62 
 
 
301 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  37.66 
 
 
284 aa  147  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.58 
 
 
305 aa  145  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.66 
 
 
288 aa  143  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  37.85 
 
 
305 aa  143  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  36.98 
 
 
308 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  37.54 
 
 
304 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 
305 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  37.91 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
289 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
289 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
289 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.66 
 
 
303 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  36.72 
 
 
303 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  32.57 
 
 
309 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  39.22 
 
 
306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1061  short chain dehydrogenase  43.44 
 
 
320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  32.24 
 
 
309 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 
312 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 
307 aa  135  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
304 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
288 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  42.65 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  35.16 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.62 
 
 
298 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.95 
 
 
324 aa  132  6.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  41.38 
 
 
311 aa  132  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  38.66 
 
 
305 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  33.77 
 
 
301 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  35.14 
 
 
303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  31.25 
 
 
309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.03 
 
 
306 aa  130  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  33.86 
 
 
309 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  34.77 
 
 
300 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  34.77 
 
 
300 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 
305 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  hitchhiker  0.00451656 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.59 
 
 
328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.392114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>