196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0377 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0377  YadA-like protein  100 
 
 		 423 aa  832    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.337345  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  45.9 
 
 		 877 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  43.33 
 
 		 810 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  44.2 
 
 		 472 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  50.56 
 
 		 1190 aa  158  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  50.56 
 
 		 1440 aa  159  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  48.31 
 
 		 2504 aa  155  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  48.31 
 
 		 1390 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  34.1 
 
 		 1446 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  39.41 
 
 		 330 aa  149  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  33.82 
 
 		 1472 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  32.66 
 
 		 1447 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  32.66 
 
 		 1342 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  32.66 
 
 		 1447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.84402 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  34.3 
 
 		 1616 aa  144  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  34.3 
 
 		 1616 aa  144  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  39.62 
 
 		 597 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  52.36 
 
 		 831 aa  143  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  33.72 
 
 		 1616 aa  142  9e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  33.72 
 
 		 1549 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  34.01 
 
 		 1674 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  44.62 
 
 		 575 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  43.6 
 
 		 589 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  33.43 
 
 		 1588 aa  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  50.51 
 
 		 816 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  50.51 
 
 		 816 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  50.51 
 
 		 816 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  50.51 
 
 		 816 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  50.51 
 
 		 831 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  50.51 
 
 		 831 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  39.68 
 
 		 597 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  39.68 
 
 		 597 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  50.51 
 
 		 820 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  40.69 
 
 		 279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  49.43 
 
 		 655 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  42.79 
 
 		 536 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  37.28 
 
 		 990 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  46.11 
 
 		 716 aa  133  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  45.93 
 
 		 1125 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  47.4 
 
 		 1197 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  47.4 
 
 		 1197 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  45.66 
 
 		 1204 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  47.4 
 
 		 1197 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  45.35 
 
 		 1451 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  45.6 
 
 		 716 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  50.27 
 
 		 880 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  49.18 
 
 		 876 aa  126  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  37.79 
 
 		 1117 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6312  surface protein  48.44 
 
 		 356 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  41.52 
 
 		 1309 aa  123  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  44.04 
 
 		 3635 aa  123  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  51.25 
 
 		 878 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  47.09 
 
 		 4384 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  39.55 
 
 		 1713 aa  121  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  48.7 
 
 		 492 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  46.11 
 
 		 735 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  42.18 
 
 		 4726 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  35.88 
 
 		 963 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  40.6 
 
 		 1417 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  35.55 
 
 		 1246 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  43.79 
 
 		 373 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  43.79 
 
 		 373 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  43.59 
 
 		 1516 aa  111  3e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  46.11 
 
 		 1072 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  43.79 
 
 		 378 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  43.71 
 
 		 192 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  43.71 
 
 		 192 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  50 
 
 		 3126 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  41.32 
 
 		 2157 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  50 
 
 		 898 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03061  adhesin-like protein B  56.35 
 
 		 989 aa  106  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  43.2 
 
 		 378 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  37.84 
 
 		 3192 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6865  YadA domain-containing protein  44.72 
 
 		 967 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557127  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  34.63 
 
 		 2832 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  43.2 
 
 		 460 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  43.43 
 
 		 533 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  50.68 
 
 		 1265 aa  102  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  44.83 
 
 		 1326 aa  99.8  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  38.27 
 
 		 2868 aa  99.8  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  44.24 
 
 		 617 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  37 
 
 		 2392 aa  97.4  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  43.2 
 
 		 1012 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  43.2 
 
 		 1068 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  47.58 
 
 		 2095 aa  95.1  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  43.2 
 
 		 962 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  43.02 
 
 		 1186 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  33.8 
 
 		 4191 aa  93.6  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  45.71 
 
 		 1090 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  45.71 
 
 		 1074 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  45.71 
 
 		 1122 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  45.71 
 
 		 1090 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  45.71 
 
 		 1090 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  45.71 
 
 		 1122 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  45.71 
 
 		 1122 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  44.24 
 
 		 827 aa  91.3  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  46.21 
 
 		 2396 aa  90.9  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  42.25 
 
 		 473 aa  90.9  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3661  hemagluttinin-like protein  43.56 
 
 		 418 aa  86.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0725058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  42.2 
 
 		 548 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>