More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4862 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  51 
 
 
2336 aa  735  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1646 aa  3260  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  43.8 
 
 
2458 aa  876  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  46.54 
 
 
1971 aa  1061  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  59.11 
 
 
1987 aa  998  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 
1758 aa  666  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  58.84 
 
 
1992 aa  1008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  86.1 
 
 
1629 aa  2726  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  94.46 
 
 
1647 aa  3014  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  44.38 
 
 
1974 aa  637  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  53.89 
 
 
2423 aa  910  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 
2539 aa  811  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  98.24 
 
 
1646 aa  3212  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  67.2 
 
 
2476 aa  817  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  44.81 
 
 
2301 aa  633  1e-180  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  38.76 
 
 
2284 aa  623  1e-177  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  47.04 
 
 
2301 aa  611  1e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  46.63 
 
 
2212 aa  606  1e-171  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  44.1 
 
 
1832 aa  582  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  43.59 
 
 
1725 aa  567  1e-160  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  50.32 
 
 
1834 aa  564  1e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  43.47 
 
 
1725 aa  565  1e-159  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  41.58 
 
 
1609 aa  566  1e-159  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  39.93 
 
 
1960 aa  502  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0518  CheA signal transduction histidine kinase  38.88 
 
 
2175 aa  498  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 
2414 aa  481  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  38.16 
 
 
1866 aa  483  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  38.03 
 
 
1983 aa  479  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 
1907 aa  476  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  38.67 
 
 
2026 aa  475  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
2026 aa  474  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  35.75 
 
 
2048 aa  474  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  37.32 
 
 
1643 aa  473  1e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  45.39 
 
 
2092 aa  469  1e-130  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  36.89 
 
 
1888 aa  462  1e-128  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  36.95 
 
 
1956 aa  461  1e-128  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 
2009 aa  454  1e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  34.88 
 
 
1989 aa  455  1e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 
2164 aa  456  1e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 
2012 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  35.46 
 
 
1970 aa  445  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  40.52 
 
 
2070 aa  439  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 
2137 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
2022 aa  430  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  30.86 
 
 
769 aa  339  3e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  30.6 
 
 
769 aa  337  1e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  30.41 
 
 
769 aa  336  2e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  33.38 
 
 
1616 aa  331  8e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.89 
 
 
2325 aa  327  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
934 aa  324  7e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  35.28 
 
 
770 aa  322  5e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  30.1 
 
 
770 aa  321  7e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  31.23 
 
 
734 aa  315  6e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  33.58 
 
 
785 aa  308  7e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.5 
 
 
764 aa  307  8e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  33.29 
 
 
740 aa  307  1e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.32 
 
 
1180 aa  305  3e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
911 aa  305  4e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  31.62 
 
 
764 aa  304  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  33.08 
 
 
783 aa  303  2e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  30.92 
 
 
768 aa  303  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
952 aa  302  5e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 
765 aa  301  7e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  29 
 
 
803 aa  301  7e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 
1127 aa  301  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
767 aa  300  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
755 aa  300  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
741 aa  299  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3244  putative CheA signal transduction histidine kinases  33.59 
 
 
1197 aa  298  5e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11034  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  33.64 
 
 
774 aa  296  2e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  32.45 
 
 
752 aa  295  4e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 
762 aa  295  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
1125 aa  295  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  31.14 
 
 
769 aa  294  8e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
1012 aa  294  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 
742 aa  293  3e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  36.1 
 
 
789 aa  292  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 
1137 aa  292  5e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.07 
 
 
974 aa  289  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0519  putative CheA signal transduction histidine kinases  32.46 
 
 
1029 aa  290  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 
1155 aa  289  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
679 aa  288  6e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 
1098 aa  287  9e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 
1065 aa  286  3e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  1.40381e-06 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
1736 aa  286  3e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  35.91 
 
 
793 aa  285  7e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
1098 aa  284  8e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
974 aa  283  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
1078 aa  281  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 
928 aa  281  7e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  32.03 
 
 
864 aa  277  1e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  32.03 
 
 
864 aa  277  1e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  32.03 
 
 
864 aa  277  1e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  32.03 
 
 
864 aa  277  1e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  32.03 
 
 
864 aa  276  2e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  32.03 
 
 
864 aa  276  2e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  34.74 
 
 
878 aa  276  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0416  CheA signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
977 aa  276  3e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 
783 aa  275  6e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 
679 aa  275  6e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>