More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5038 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  94.46 
 
 		 1646 aa  3012    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  59.73 
 
 		 1987 aa  1009    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  59.27 
 
 		 1992 aa  1017    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  53.76 
 
 		 2423 aa  916    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  67.09 
 
 		 2458 aa  822    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 1758 aa  664    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  46.58 
 
 		 1971 aa  1070    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  94.46 
 
 		 1646 aa  3014    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  86.88 
 
 		 1629 aa  2750    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  50.5 
 
 		 2336 aa  728    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  44.38 
 
 		 1974 aa  637    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  67.36 
 
 		 2476 aa  818    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1647 aa  3259    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 		 2539 aa  815    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  34.63 
 
 		 2301 aa  623  1e-177  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  47.16 
 
 		 2301 aa  610  1e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  34.51 
 
 		 2284 aa  609  9.999999999999999e-173  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  46.38 
 
 		 2212 aa  602  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  44.74 
 
 		 1832 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  42.82 
 
 		 1725 aa  564  1.0000000000000001e-159  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  43.2 
 
 		 1725 aa  561  1e-158  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 		 1609 aa  561  1e-158  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  50 
 
 		 1834 aa  555  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  39.21 
 
 		 1960 aa  498  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0518  CheA signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 		 2175 aa  495  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  37.59 
 
 		 2026 aa  477  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  40.05 
 
 		 2092 aa  479  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 		 1907 aa  474  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  37.61 
 
 		 1866 aa  476  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 2026 aa  474  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  38.6 
 
 		 1983 aa  474  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  36.97 
 
 		 1643 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  37.32 
 
 		 2048 aa  466  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  37.08 
 
 		 1888 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 		 2009 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  37.2 
 
 		 1956 aa  452  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 2164 aa  452  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  42.35 
 
 		 2414 aa  453  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 		 2012 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  36.17 
 
 		 2070 aa  449  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  34.36 
 
 		 1989 aa  449  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  35.48 
 
 		 1970 aa  442  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 2137 aa  431  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 2022 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  30.95 
 
 		 769 aa  335  3e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  30.95 
 
 		 769 aa  332  4e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  30.45 
 
 		 769 aa  330  1.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 1616 aa  327  1e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.38 
 
 		 2325 aa  324  7e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  29.75 
 
 		 770 aa  321  7.999999999999999e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 934 aa  319  3e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  35.47 
 
 		 770 aa  318  4e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 740 aa  313  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  34.15 
 
 		 785 aa  311  1.0000000000000001e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  31.97 
 
 		 734 aa  309  3e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.3 
 
 		 1180 aa  309  4.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  33.46 
 
 		 783 aa  303  1e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  31.8 
 
 		 764 aa  302  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 911 aa  302  4e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 755 aa  299  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  30.84 
 
 		 768 aa  299  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  34.2 
 
 		 774 aa  299  4e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 952 aa  297  1e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  33.04 
 
 		 752 aa  296  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  35.54 
 
 		 803 aa  296  3e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  31.11 
 
 		 769 aa  295  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3244  putative CheA signal transduction histidine kinases  32.98 
 
 		 1197 aa  295  7e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11034  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 1127 aa  294  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0519  putative CheA signal transduction histidine kinases  32.61 
 
 		 1029 aa  294  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 		 1125 aa  293  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 765 aa  292  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 767 aa  292  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 741 aa  292  4e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.84 
 
 		 764 aa  290  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 1012 aa  290  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 1137 aa  291  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 762 aa  289  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  35.91 
 
 		 789 aa  288  7e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 679 aa  288  8e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 1155 aa  287  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 1098 aa  285  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 742 aa  283  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 1065 aa  283  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.6 
 
 		 974 aa  283  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0416  CheA signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 977 aa  283  3e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 1736 aa  282  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 		 974 aa  281  8e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 1098 aa  281  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 928 aa  280  1e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  35.38 
 
 		 793 aa  280  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 660 aa  280  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  35.06 
 
 		 878 aa  280  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 1078 aa  275  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.55 
 
 		 864 aa  273  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.55 
 
 		 864 aa  273  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.55 
 
 		 864 aa  273  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.55 
 
 		 864 aa  273  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 		 679 aa  273  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0714  CheA signal transduction histidine kinases  30.95 
 
 		 1020 aa  272  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 783 aa  273  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>