More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3212 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  460  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  82.74 
 
 		 225 aa  368  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  68.14 
 
 		 224 aa  315  4e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  68.33 
 
 		 222 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  65.92 
 
 		 222 aa  295  4e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  46.51 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.93 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 214 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.17 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.69 
 
 		 225 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  31.37 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.07 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.69 
 
 		 242 aa  112  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5111  cAMP-regulatory protein  38.3 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4219  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  31.22 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  35.87 
 
 		 217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4779  cAMP-regulatory protein  36.32 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46100  cAMP-regulatory protein  34.76 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4099  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 237 aa  109  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000655046 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0454  cAMP-regulatory protein  35.79 
 
 		 214 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.993891  normal  0.32004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0457  cAMP-regulatory protein  35.79 
 
 		 223 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89409  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0424  cAMP-regulatory protein  35.79 
 
 		 214 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.328198  normal  0.870698 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3943  cAMP-regulatory protein  34.22 
 
 		 214 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  34.24 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.07 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.25 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08370  cAMP-regulatory protein  33.69 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000340418 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4577  cAMP-regulatory protein  35.29 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  28.3 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.13 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.23 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.24 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0596  catabolite gene activator Crp  34.22 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  29.06 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2797  cAMP-regulatory protein  33.33 
 
 		 198 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207531  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  28.77 
 
 		 225 aa  101  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.33 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.78 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.45 
 
 		 243 aa  99.8  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.78 
 
 		 251 aa  99.4  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 225 aa  98.6  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 225 aa  98.2  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  30.27 
 
 		 212 aa  98.2  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.5 
 
 		 226 aa  95.5  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  30.05 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  31.52 
 
 		 214 aa  93.2  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.5 
 
 		 220 aa  93.2  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 248 aa  92.8  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  28 
 
 		 224 aa  92.8  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.16 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 228 aa  92.4  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  29.8 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  30.89 
 
 		 211 aa  92  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1010  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 257 aa  91.7  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  30.89 
 
 		 211 aa  91.7  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.28 
 
 		 225 aa  91.7  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  29.51 
 
 		 211 aa  91.7  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  29.51 
 
 		 211 aa  91.7  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  29.51 
 
 		 211 aa  91.7  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000475791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  29.51 
 
 		 211 aa  91.7  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000398691  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  29.51 
 
 		 211 aa  91.7  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.82 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  30.89 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000247338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.69 
 
 		 224 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  30.89 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  27 
 
 		 226 aa  90.9  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3873  cAMP-regulatory protein  29.51 
 
 		 211 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000159716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  29.51 
 
 		 211 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  29.12 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  29.51 
 
 		 211 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  29.51 
 
 		 211 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.81 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.81 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  29.67 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  30.81 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  30.81 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  30.81 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  29.12 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0355  cAMP-regulatory protein  30.81 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0526852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4580  cAMP-regulatory protein  30.65 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0550419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  30.11 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  29.12 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  29.12 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  30.11 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  30.11 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  28.96 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4032  cAMP-regulatory protein  30.65 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  30.81 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  29.12 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  27.05 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>