More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0852 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  100 
 
 		 140 aa  281  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  60.14 
 
 		 145 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  69.72 
 
 		 125 aa  157  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  73.2 
 
 		 122 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  63.93 
 
 		 124 aa  149  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  61.42 
 
 		 125 aa  147  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  59.66 
 
 		 124 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  58.4 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  60.18 
 
 		 114 aa  141  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  58.82 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  58.82 
 
 		 124 aa  140  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  63.83 
 
 		 170 aa  137  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  69.7 
 
 		 162 aa  137  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  54.17 
 
 		 131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  48.39 
 
 		 137 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  50 
 
 		 137 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  62.5 
 
 		 127 aa  133  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  71.43 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  62.11 
 
 		 360 aa  131  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  62.11 
 
 		 360 aa  131  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  49.17 
 
 		 137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  49.17 
 
 		 137 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  50.41 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  61.96 
 
 		 163 aa  131  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  64.13 
 
 		 124 aa  130  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  60.22 
 
 		 163 aa  130  7.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  54.21 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  58.93 
 
 		 119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  60.87 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3007  rare lipoprotein A  53.7 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0729065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  46.04 
 
 		 181 aa  127  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  61.54 
 
 		 342 aa  127  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  64.89 
 
 		 199 aa  127  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  58.76 
 
 		 262 aa  127  7.000000000000001e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  61.96 
 
 		 165 aa  126  8.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  51.82 
 
 		 137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  63.04 
 
 		 324 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  67.39 
 
 		 358 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  57.29 
 
 		 275 aa  124  5e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  57.29 
 
 		 275 aa  124  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  61.7 
 
 		 139 aa  123  7e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  57.29 
 
 		 266 aa  123  7e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  52.69 
 
 		 167 aa  123  9e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  65.59 
 
 		 371 aa  122  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  60.2 
 
 		 259 aa  122  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  58.95 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  59.34 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  62.64 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  61.8 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12600  Rare lipoprotein A, RplA  62.11 
 
 		 123 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817198  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  61.54 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  56.84 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  58.59 
 
 		 128 aa  121  4e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  61.46 
 
 		 322 aa  120  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  55.75 
 
 		 261 aa  120  5e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  58.16 
 
 		 142 aa  120  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  57.29 
 
 		 279 aa  120  6e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1773  rare lipoprotein A  58.33 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  60 
 
 		 153 aa  120  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  54.17 
 
 		 239 aa  120  8e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0531  rare lipoprotein A  61.96 
 
 		 370 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.863608  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  58.59 
 
 		 367 aa  118  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  59.57 
 
 		 324 aa  118  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5916  rare lipoprotein A  61.46 
 
 		 303 aa  117  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  59.41 
 
 		 200 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  53.92 
 
 		 323 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  50.96 
 
 		 246 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  58.42 
 
 		 200 aa  117  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  52.48 
 
 		 186 aa  117  7e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  42.65 
 
 		 265 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  62.77 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  49.21 
 
 		 214 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  55.91 
 
 		 211 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  43.75 
 
 		 321 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  60.64 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  54.08 
 
 		 249 aa  114  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2902  rare lipoprotein A  63.74 
 
 		 162 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.280863  normal  0.0524626 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  55.21 
 
 		 238 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  64.71 
 
 		 213 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  56.44 
 
 		 212 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1517  rare lipoprotein A  45.16 
 
 		 127 aa  114  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000581263  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  53.61 
 
 		 254 aa  114  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  59.34 
 
 		 227 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4765  rare lipoprotein A  63.33 
 
 		 179 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  53.76 
 
 		 202 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  53.76 
 
 		 242 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  42.4 
 
 		 269 aa  112  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4580  rare lipoprotein A  56.48 
 
 		 120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0743429 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  58.33 
 
 		 259 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  53.76 
 
 		 242 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  59.6 
 
 		 124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  57.3 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  51.72 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  57.73 
 
 		 285 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  61.54 
 
 		 331 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  53.76 
 
 		 211 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  53.76 
 
 		 211 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  53.76 
 
 		 230 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  51.02 
 
 		 260 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  53.76 
 
 		 203 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>