More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2798 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2798  HflK protein  100 
 
 
357 aa  732    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0313  hflK protein, putative  60.2 
 
 
329 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3678  HflK protein  46 
 
 
350 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3613  HflK protein  46 
 
 
350 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3522  HflK protein  48.41 
 
 
378 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0184  HflK protein  43.46 
 
 
350 aa  263  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0545  HflK protein  44.55 
 
 
366 aa  259  6e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000873771  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2262  HflK protein  43.85 
 
 
333 aa  256  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015812  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1332  hflK protein, putative  44.37 
 
 
318 aa  246  6e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.683912  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  37.54 
 
 
387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  36.13 
 
 
388 aa  208  9e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  35.9 
 
 
308 aa  200  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  35.58 
 
 
308 aa  198  9e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0630  HflK protein  36.9 
 
 
309 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0205  HflK protein  37.76 
 
 
311 aa  195  1e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  34.55 
 
 
407 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  34.95 
 
 
359 aa  193  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  34.75 
 
 
368 aa  191  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  34.38 
 
 
378 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  35.31 
 
 
383 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  37.25 
 
 
405 aa  186  6e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  35.47 
 
 
362 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0702  HflK protein  35.31 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  36.45 
 
 
395 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1321  HflK protein  36.18 
 
 
331 aa  182  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  34.62 
 
 
382 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  34.08 
 
 
385 aa  179  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  36.33 
 
 
389 aa  178  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  34.03 
 
 
383 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  35.15 
 
 
390 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  34.32 
 
 
433 aa  177  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  33.71 
 
 
389 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0665  HflK protein  34.2 
 
 
322 aa  176  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  34.75 
 
 
398 aa  176  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  34.09 
 
 
395 aa  176  6e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  33.53 
 
 
367 aa  175  8e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  32.96 
 
 
383 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  33.8 
 
 
361 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  34.13 
 
 
385 aa  172  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  34 
 
 
464 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  31.67 
 
 
355 aa  171  1e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  32.95 
 
 
403 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  34.69 
 
 
393 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  31.12 
 
 
376 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  31.44 
 
 
384 aa  170  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  31.37 
 
 
394 aa  170  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  34.69 
 
 
405 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  32.91 
 
 
344 aa  170  4e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  34.49 
 
 
407 aa  170  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  33.76 
 
 
395 aa  170  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  32.11 
 
 
360 aa  170  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  34.69 
 
 
393 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  34.03 
 
 
436 aa  169  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0579  HflK protein  32.91 
 
 
386 aa  169  7e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  34.35 
 
 
393 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  32.26 
 
 
386 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  34.56 
 
 
351 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  37.25 
 
 
379 aa  168  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  31.16 
 
 
382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  31.73 
 
 
383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  32.65 
 
 
399 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  34.81 
 
 
379 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  33.89 
 
 
471 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  30.86 
 
 
389 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  32.65 
 
 
400 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  33.9 
 
 
400 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  34.35 
 
 
389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  33.99 
 
 
357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  35.42 
 
 
386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  30.31 
 
 
381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  30.31 
 
 
381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  33.33 
 
 
452 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  33.56 
 
 
451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  35.2 
 
 
399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  33.56 
 
 
451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  33.22 
 
 
399 aa  164  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  33.56 
 
 
395 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  33.45 
 
 
464 aa  162  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  31.58 
 
 
456 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00092  serine protease  33 
 
 
401 aa  161  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  33.67 
 
 
393 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  33.22 
 
 
389 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1886  hflK protein  32 
 
 
397 aa  161  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0003  HflK protein  36.26 
 
 
329 aa  161  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1561  HflK protein  32 
 
 
397 aa  161  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.920628  hitchhiker  0.00000000145898 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  33.01 
 
 
381 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  29.55 
 
 
379 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  33.56 
 
 
378 aa  160  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  33.44 
 
 
393 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1956  HflK protein  32.79 
 
 
387 aa  160  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.733622  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  33.44 
 
 
393 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2800  HflK protein  36.77 
 
 
360 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182223  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  34.42 
 
 
413 aa  159  7e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  32 
 
 
503 aa  159  8e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  31.16 
 
 
447 aa  159  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4760  FtsH protease regulator HflK  35 
 
 
419 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  33.22 
 
 
382 aa  158  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4631  FtsH protease regulator HflK  35 
 
 
419 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130009  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  32.89 
 
 
435 aa  158  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  34.15 
 
 
414 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>