More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0763 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  100 
 
 		 852 aa  1745    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  40.48 
 
 		 869 aa  673    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  40.44 
 
 		 869 aa  690    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  39.18 
 
 		 828 aa  611  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  37.79 
 
 		 931 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  38.12 
 
 		 912 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  39.15 
 
 		 828 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  37.27 
 
 		 921 aa  602  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  37.13 
 
 		 920 aa  597  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  37.39 
 
 		 915 aa  595  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  36.34 
 
 		 910 aa  597  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  36.57 
 
 		 919 aa  586  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  35.94 
 
 		 922 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  39.06 
 
 		 828 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  36.69 
 
 		 897 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  39.08 
 
 		 837 aa  582  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  39.08 
 
 		 837 aa  582  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  35.65 
 
 		 919 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  38.08 
 
 		 837 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  36.99 
 
 		 827 aa  560  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  36.1 
 
 		 920 aa  544  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  36.47 
 
 		 833 aa  496  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  30.85 
 
 		 781 aa  347  7e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  27.73 
 
 		 940 aa  250  8e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  25.52 
 
 		 824 aa  234  4.0000000000000004e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  28.1 
 
 		 753 aa  225  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  29.32 
 
 		 948 aa  224  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  26.13 
 
 		 823 aa  224  7e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  28.69 
 
 		 833 aa  218  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  27.96 
 
 		 869 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  26.8 
 
 		 834 aa  207  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  26.19 
 
 		 977 aa  205  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  29.01 
 
 		 1055 aa  205  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  27.83 
 
 		 952 aa  198  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  26.63 
 
 		 936 aa  193  9e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  32.44 
 
 		 800 aa  189  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  32.21 
 
 		 846 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  25.56 
 
 		 791 aa  184  8.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  33.75 
 
 		 947 aa  182  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  31.04 
 
 		 803 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  25.97 
 
 		 812 aa  181  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  28.1 
 
 		 779 aa  181  5.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  26.49 
 
 		 849 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  28.99 
 
 		 830 aa  174  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  28.46 
 
 		 830 aa  174  9e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  35.36 
 
 		 576 aa  169  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  25.51 
 
 		 877 aa  163  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  25.32 
 
 		 875 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  25.51 
 
 		 800 aa  162  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.02 
 
 		 877 aa  160  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  30.03 
 
 		 568 aa  148  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  28.74 
 
 		 580 aa  119  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  30.19 
 
 		 478 aa  114  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1344  polysaccharide export protein  34.33 
 
 		 425 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232143 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  26.8 
 
 		 603 aa  107  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  31 
 
 		 579 aa  104  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  34.72 
 
 		 552 aa  103  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  33.95 
 
 		 552 aa  102  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  31.15 
 
 		 552 aa  102  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  28.77 
 
 		 587 aa  101  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  26.8 
 
 		 605 aa  100  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  27.8 
 
 		 351 aa  91.7  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  29.03 
 
 		 606 aa  91.3  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  27.85 
 
 		 379 aa  87.8  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  29.93 
 
 		 558 aa  85.9  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  29.93 
 
 		 558 aa  85.9  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  25.71 
 
 		 495 aa  84.7  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  25.4 
 
 		 495 aa  84.3  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  29.59 
 
 		 558 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0621  KpsD protein  28.32 
 
 		 606 aa  84  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  26.7 
 
 		 282 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  25.35 
 
 		 473 aa  83.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  27.08 
 
 		 388 aa  82.8  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  25.99 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  27.48 
 
 		 609 aa  81.3  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  27.44 
 
 		 565 aa  80.5  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  24.23 
 
 		 495 aa  79.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  26.34 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  25.65 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  26.39 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  26.43 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  25.83 
 
 		 537 aa  77  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000856367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  25.35 
 
 		 282 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  28.02 
 
 		 508 aa  77  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  25.81 
 
 		 358 aa  76.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  27.73 
 
 		 277 aa  75.5  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  28.07 
 
 		 557 aa  75.1  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  26.5 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  25.51 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  29.31 
 
 		 205 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  22.77 
 
 		 478 aa  72.4  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  24.88 
 
 		 391 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  25 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  28.93 
 
 		 184 aa  72  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  27.69 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  27.81 
 
 		 386 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  26.76 
 
 		 270 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  27.22 
 
 		 386 aa  70.1  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  27.22 
 
 		 386 aa  70.1  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  27.22 
 
 		 379 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>