More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1066 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  100 
 
 		 264 aa  533  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  79.77 
 
 		 262 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  80.16 
 
 		 263 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  80.54 
 
 		 263 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  79.38 
 
 		 263 aa  417  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  76.06 
 
 		 260 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  74.9 
 
 		 260 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  75.19 
 
 		 261 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  68.46 
 
 		 261 aa  353  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  68.46 
 
 		 261 aa  352  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  59.35 
 
 		 261 aa  305  4.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  43.01 
 
 		 296 aa  202  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  39.11 
 
 		 286 aa  168  7e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  52.98 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  36.33 
 
 		 270 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  39.69 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  37.25 
 
 		 271 aa  145  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  36.65 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  36.47 
 
 		 271 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  36.65 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  36.65 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  43.98 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  35.83 
 
 		 270 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  40.82 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  35.68 
 
 		 269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  39.27 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1973  OmpA/MotB domain-containing protein  32.46 
 
 		 311 aa  122  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  46.51 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  43.8 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.54 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 		 206 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  42.52 
 
 		 890 aa  102  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  47.41 
 
 		 222 aa  102  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  41.54 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  39.26 
 
 		 236 aa  99  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  45.39 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  45.71 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  49.07 
 
 		 229 aa  97.1  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0934  OmpA/MotB domain-containing protein  39.13 
 
 		 217 aa  96.7  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000729955  hitchhiker  0.000000173865 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  39.42 
 
 		 669 aa  97.1  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  45.54 
 
 		 222 aa  96.3  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  40.3 
 
 		 175 aa  96.3  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  41.3 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  42.11 
 
 		 208 aa  95.9  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  47.62 
 
 		 351 aa  95.9  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  48.51 
 
 		 321 aa  95.5  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  41.48 
 
 		 237 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  46.49 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  47.27 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  42.22 
 
 		 225 aa  95.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  47.62 
 
 		 344 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  42.11 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  39.71 
 
 		 230 aa  94.4  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  44.76 
 
 		 350 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  44.76 
 
 		 350 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  46.23 
 
 		 330 aa  93.6  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  46.49 
 
 		 220 aa  93.6  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  43.44 
 
 		 1755 aa  93.6  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  39.71 
 
 		 222 aa  92.8  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  47.62 
 
 		 344 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  43.69 
 
 		 374 aa  92.8  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  47.62 
 
 		 327 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  50 
 
 		 219 aa  92.8  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 		 525 aa  92.4  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  42.24 
 
 		 236 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  45.37 
 
 		 498 aa  92.4  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  43.75 
 
 		 189 aa  92.4  7e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  42.24 
 
 		 240 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  42.24 
 
 		 247 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  46.67 
 
 		 344 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  44.07 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  37.68 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  46.67 
 
 		 344 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  41.38 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  46.67 
 
 		 344 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  45.87 
 
 		 218 aa  91.7  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  42.34 
 
 		 631 aa  91.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  44.04 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  47.62 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  42.98 
 
 		 429 aa  90.9  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  47.62 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  48.08 
 
 		 214 aa  90.9  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  38.71 
 
 		 398 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  47.62 
 
 		 219 aa  90.9  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  47.62 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  47.62 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  47.62 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  47.62 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  45.79 
 
 		 318 aa  90.5  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1386  OmpA/MotB domain protein  42.73 
 
 		 238 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.848199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  47.06 
 
 		 215 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  47.06 
 
 		 215 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  47.06 
 
 		 215 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  41.38 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  47.52 
 
 		 261 aa  90.1  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  47.06 
 
 		 215 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  38.39 
 
 		 1026 aa  90.1  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  35.84 
 
 		 227 aa  90.1  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  46.6 
 
 		 215 aa  90.1  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>