More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3544 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  85.23 
 
 		 730 aa  1263    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 727 aa  1500    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  45.33 
 
 		 718 aa  587  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  46.26 
 
 		 742 aa  581  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  40.17 
 
 		 774 aa  503  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  38.17 
 
 		 716 aa  490  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1183  TonB-dependent siderophore receptor  39.2 
 
 		 757 aa  462  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0174  TonB-dependent siderophore receptor  38.73 
 
 		 772 aa  449  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.191382 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0366  TonB-dependent siderophore receptor  36.79 
 
 		 750 aa  439  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1289  TonB-dependent receptor domain-containing protein  37.12 
 
 		 727 aa  393  1e-108  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00967025  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1610  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 		 733 aa  333  9e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1560  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 714 aa  311  2.9999999999999997e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.3619  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  29.32 
 
 		 811 aa  278  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0879  TonB-dependent receptor  41.46 
 
 		 378 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.928768  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 		 811 aa  275  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  27.97 
 
 		 728 aa  262  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  28.37 
 
 		 728 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  30.51 
 
 		 727 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  30.08 
 
 		 727 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  28.31 
 
 		 726 aa  242  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  29.25 
 
 		 698 aa  238  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 708 aa  233  8.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  27.23 
 
 		 710 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  29.44 
 
 		 710 aa  233  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  26.94 
 
 		 729 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.61 
 
 		 724 aa  224  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 		 743 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  30.3 
 
 		 706 aa  221  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  27.04 
 
 		 743 aa  219  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  26.76 
 
 		 712 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  27.52 
 
 		 743 aa  217  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  27.4 
 
 		 751 aa  217  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  26.26 
 
 		 710 aa  216  9e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  27.37 
 
 		 724 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 		 743 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 		 743 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  28.15 
 
 		 722 aa  214  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  27.81 
 
 		 743 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  28.19 
 
 		 809 aa  210  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  28.8 
 
 		 744 aa  211  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 		 737 aa  206  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  27.26 
 
 		 804 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  28.09 
 
 		 737 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  27.3 
 
 		 772 aa  201  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  27.3 
 
 		 772 aa  201  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  26.97 
 
 		 804 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  27.57 
 
 		 726 aa  198  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  27.02 
 
 		 738 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 731 aa  197  5.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 		 707 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 		 707 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 		 707 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  25.66 
 
 		 729 aa  193  7e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  27.02 
 
 		 742 aa  193  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  27.98 
 
 		 805 aa  193  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  26.87 
 
 		 719 aa  193  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  24.07 
 
 		 705 aa  192  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  24.96 
 
 		 708 aa  192  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  26.77 
 
 		 802 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 819 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  26.57 
 
 		 801 aa  190  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1080  TonB dependent receptor  36.39 
 
 		 335 aa  189  1e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1656  ferrichrome receptor FcuA  28.3 
 
 		 720 aa  189  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000210688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3692  TonB-dependent siderophore receptor  26.91 
 
 		 685 aa  189  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235893  normal  0.294422 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  26.87 
 
 		 771 aa  188  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  26.11 
 
 		 801 aa  187  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.9 
 
 		 704 aa  185  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 		 755 aa  185  3e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  27.02 
 
 		 746 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  26.37 
 
 		 722 aa  184  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  26.48 
 
 		 753 aa  184  6e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  25.78 
 
 		 715 aa  183  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  25.96 
 
 		 800 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2373  ferrichrome receptor FcuA  27.67 
 
 		 763 aa  182  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000216306  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2469  TonB-dependent siderophore receptor  27.67 
 
 		 768 aa  182  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000279609  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  25.73 
 
 		 762 aa  182  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  27.14 
 
 		 728 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  26.8 
 
 		 725 aa  181  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1058  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 728 aa  179  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0962342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  25.98 
 
 		 804 aa  178  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  25.65 
 
 		 754 aa  178  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  25.15 
 
 		 702 aa  177  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  26.61 
 
 		 728 aa  177  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  28 
 
 		 734 aa  177  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  27.71 
 
 		 729 aa  177  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  24.78 
 
 		 702 aa  174  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  24.97 
 
 		 729 aa  173  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  26.86 
 
 		 753 aa  172  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3800  TonB-dependent siderophore receptor  25.91 
 
 		 712 aa  171  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  25.2 
 
 		 730 aa  171  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1003  TonB-dependent siderophore receptor  26.68 
 
 		 758 aa  170  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  26.17 
 
 		 823 aa  170  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0825  TonB-dependent siderophore receptor  25.29 
 
 		 759 aa  169  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000404003  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  37.6 
 
 		 768 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  25.14 
 
 		 749 aa  168  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0150  TonB-dependent siderophore receptor  24.97 
 
 		 729 aa  167  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  25.4 
 
 		 761 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  25.62 
 
 		 777 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 		 761 aa  157  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  33.22 
 
 		 808 aa  154  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>