More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3924 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3924  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 238 aa  465  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  48.15 
 
 		 1033 aa  81.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  44.34 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  41.94 
 
 		 727 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  30.49 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0112  heat shock protein DnaJ domain protein  43.4 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0108  heat shock protein DnaJ domain protein  43.4 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.8375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  45.13 
 
 		 449 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  39.2 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  42.2 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  39.86 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  40.71 
 
 		 537 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  41.86 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  44.54 
 
 		 493 aa  68.9  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  35.14 
 
 		 343 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  35.14 
 
 		 343 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  46 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  44.64 
 
 		 866 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  36.59 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  33.6 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  38.94 
 
 		 524 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4550  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  41.59 
 
 		 526 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  43.14 
 
 		 517 aa  66.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  44.35 
 
 		 332 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  43.81 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  42.73 
 
 		 521 aa  65.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  49.07 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  43.4 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  39.84 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  44.83 
 
 		 416 aa  65.1  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  36.3 
 
 		 386 aa  65.1  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  37.17 
 
 		 381 aa  65.1  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  42.02 
 
 		 309 aa  65.1  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  37.37 
 
 		 491 aa  65.1  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  38.51 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  48.6 
 
 		 411 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  44.57 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0864  heat shock protein DnaJ-like  46.32 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  45.95 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  45.95 
 
 		 973 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  39.81 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  41 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  47.47 
 
 		 165 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  35.29 
 
 		 600 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1383  pentapeptide repeat protein  50.49 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.100104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2673  serine/threonine protein kinase  34.68 
 
 		 533 aa  63.9  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  43.64 
 
 		 745 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1853  pentapeptide repeat protein  45.65 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.150883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  41.41 
 
 		 493 aa  64.3  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  44.23 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  45.56 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  36.28 
 
 		 862 aa  64.3  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  38.71 
 
 		 949 aa  63.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  41.51 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  39.84 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  33.54 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  38.3 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4194  pentapeptide repeat protein  41.32 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  38.3 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  41.49 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  40.48 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  41.49 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  40.48 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  41.49 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  44.44 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  40.48 
 
 		 567 aa  62.8  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2559  pentapeptide repeat-containing protein  39.02 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1585  pentapeptide repeat-containing protein  39.16 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000106738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  35.78 
 
 		 448 aa  62.4  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  45.37 
 
 		 576 aa  62  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  47.73 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  42.34 
 
 		 203 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  48.48 
 
 		 433 aa  61.6  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  40.34 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4759  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.33 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  40.34 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  33.8 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  36.43 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  43.56 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  53.66 
 
 		 1901 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  36.43 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  39.26 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  40.91 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  43.75 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  35.44 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0631  pentapeptide repeat protein  42.31 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  43.56 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  36.67 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  44.21 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  38.46 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  38.74 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0707  pentapeptide repeat protein  37.6 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0857  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  35.77 
 
 		 563 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  37.19 
 
 		 489 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  41.27 
 
 		 1807 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  41.13 
 
 		 903 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  45.26 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  40.95 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0884  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  35.77 
 
 		 563 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741036  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>