More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2970 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  100 
 
 		 651 aa  1341    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1001  TonB-dependent receptor  40.18 
 
 		 628 aa  451  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.11298  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1301  TonB-dependent receptor  39.81 
 
 		 634 aa  445  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  26.27 
 
 		 656 aa  129  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 613 aa  126  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 679 aa  122  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  25.29 
 
 		 650 aa  120  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  25.42 
 
 		 663 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  25.14 
 
 		 663 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  25.14 
 
 		 659 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  25.14 
 
 		 663 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  25.14 
 
 		 663 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  25.14 
 
 		 663 aa  118  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  25.14 
 
 		 663 aa  118  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  25.29 
 
 		 650 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  25.1 
 
 		 650 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  25.1 
 
 		 650 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  25.1 
 
 		 650 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  25.53 
 
 		 646 aa  117  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  26.86 
 
 		 659 aa  114  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 653 aa  114  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.63 
 
 		 631 aa  114  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  25.2 
 
 		 641 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 635 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 649 aa  112  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 640 aa  109  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 1128 aa  109  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 621 aa  109  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  23.89 
 
 		 628 aa  106  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.2 
 
 		 619 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  24.35 
 
 		 617 aa  105  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.5 
 
 		 631 aa  104  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  24.91 
 
 		 698 aa  104  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  26.29 
 
 		 671 aa  104  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  26.19 
 
 		 668 aa  103  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 653 aa  104  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 602 aa  103  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 649 aa  103  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 649 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4414  TonB-dependent receptor plug  26.1 
 
 		 639 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 		 647 aa  101  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 632 aa  101  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.99 
 
 		 631 aa  101  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  25.28 
 
 		 693 aa  100  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 612 aa  100  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  26.28 
 
 		 611 aa  99.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  35.12 
 
 		 653 aa  99.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  25.31 
 
 		 695 aa  98.6  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  32.8 
 
 		 656 aa  98.2  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2071  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 629 aa  98.2  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00162344  hitchhiker  0.000156466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  25.7 
 
 		 753 aa  97.8  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  34.13 
 
 		 760 aa  97.4  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  25.15 
 
 		 634 aa  97.4  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  27.94 
 
 		 613 aa  97.1  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  25.55 
 
 		 628 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 692 aa  96.7  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4821  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 621 aa  96.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 662 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1524  TonB-dependent receptor plug  26.84 
 
 		 605 aa  95.9  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 662 aa  96.3  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 662 aa  96.3  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1262  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 651 aa  96.3  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612585  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  35.85 
 
 		 686 aa  95.1  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2744  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 701 aa  94.7  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  37.91 
 
 		 681 aa  94.4  6e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  25.14 
 
 		 700 aa  94.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 680 aa  94.4  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  36.71 
 
 		 709 aa  94  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1142  TonB-dependent receptor-related protein  24.49 
 
 		 650 aa  94  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.22175  normal  0.0805488 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  24.9 
 
 		 611 aa  94  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  25.39 
 
 		 696 aa  93.2  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  23.76 
 
 		 633 aa  93.2  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 611 aa  92.8  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  25.23 
 
 		 746 aa  92.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  25.14 
 
 		 636 aa  92.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 611 aa  92.8  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 627 aa  92  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  29.85 
 
 		 788 aa  91.7  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 627 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 788 aa  91.7  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0028  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 641 aa  91.7  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7217  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 707 aa  91.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  34.6 
 
 		 928 aa  90.9  7e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  24.51 
 
 		 673 aa  90.5  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 624 aa  90.5  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  25.27 
 
 		 757 aa  90.1  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  25.1 
 
 		 750 aa  90.1  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  22.94 
 
 		 647 aa  89.4  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4483  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 737 aa  89.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.00000231942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  24.68 
 
 		 647 aa  89.4  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  34.12 
 
 		 927 aa  89.4  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 641 aa  89  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3502  putative outer membrane cobalamin receptor, TonB dependent  23.9 
 
 		 623 aa  89  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.86203  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2666  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 		 638 aa  89  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  23.92 
 
 		 769 aa  88.2  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  41.04 
 
 		 697 aa  87.8  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  25.11 
 
 		 628 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  24.56 
 
 		 696 aa  88.2  5e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4648  TonB-dependent receptor  35.95 
 
 		 653 aa  87.8  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1064  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 661 aa  87.8  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00188221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>