More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1144 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1144  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 
321 aa  641  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000342468  normal  0.524577 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0621  RND family efflux transporter MFP subunit  59.49 
 
 
311 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  3.87759e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1945  efflux transporter, RND family, MFP subunit  61.34 
 
 
322 aa  375  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0769  efflux transporter, RND family, MFP subunit  57.81 
 
 
322 aa  377  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.100875  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0336  secretion protein HlyD  60 
 
 
324 aa  371  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0816826  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0495  secretion protein HlyD  59.02 
 
 
323 aa  340  3e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1628  RND family efflux transporter MFP subunit  48.77 
 
 
326 aa  279  5e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.94 
 
 
416 aa  102  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0198  RND family efflux transporter MFP subunit  28.2 
 
 
521 aa  95.9  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.8 
 
 
428 aa  90.5  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.88 
 
 
419 aa  90.5  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  26.5 
 
 
357 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.49 
 
 
409 aa  89.7  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  25.77 
 
 
388 aa  87  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1340  secretion protein HlyD  32.83 
 
 
424 aa  85.5  1e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.2 
 
 
504 aa  85.1  1e-15  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  25.95 
 
 
357 aa  85.5  1e-15  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.34 
 
 
430 aa  84.3  3e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  33.16 
 
 
421 aa  83.2  5e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13031  membrane fusion protein  24.15 
 
 
353 aa  82.4  8e-15  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2956  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.01 
 
 
430 aa  82  1e-14  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232515 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13281  membrane fusion protein  23.56 
 
 
353 aa  82.4  1e-14  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.403546  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.26 
 
 
404 aa  82.4  1e-14  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  30.36 
 
 
390 aa  82  1e-14  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  27.15 
 
 
381 aa  81.3  2e-14  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  23.38 
 
 
432 aa  80.9  3e-14  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2611  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.47 
 
 
549 aa  80.5  3e-14  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.33 
 
 
430 aa  80.5  3e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1440  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.69 
 
 
374 aa  80.1  4e-14  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13141  membrane fusion protein  23.08 
 
 
353 aa  80.1  4e-14  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1719  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.77 
 
 
517 aa  80.1  5e-14  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0477  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  31.96 
 
 
621 aa  80.1  5e-14  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  27.39 
 
 
517 aa  79.7  6e-14  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1576  hypothetical protein  24.92 
 
 
538 aa  79.7  6e-14  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  4.69738e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3643  RND family efflux transporter MFP subunit  23.76 
 
 
455 aa  79.3  7e-14  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384349  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  30 
 
 
607 aa  79.3  8e-14  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1235  secretion protein HlyD  23.05 
 
 
353 aa  79  1e-13  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.681968  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  25.07 
 
 
367 aa  79  1e-13  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4149  RND family efflux transporter MFP subunit  25.71 
 
 
372 aa  77.8  2e-13  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  34.75 
 
 
489 aa  77.4  3e-13  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  9.75793e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  26.14 
 
 
394 aa  77  4e-13  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.39 
 
 
608 aa  77  4e-13  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  24.74 
 
 
402 aa  76.3  6e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  32.39 
 
 
424 aa  76.6  6e-13  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  23.62 
 
 
368 aa  76.6  6e-13  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3749  RND family efflux transporter MFP subunit  28.03 
 
 
340 aa  75.9  8e-13  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  35.04 
 
 
489 aa  75.9  1e-12  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3274  putative multidrug efflux system transmembrane protein  32.79 
 
 
225 aa  75.1  1e-12  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.668414  normal  0.104011 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  32.39 
 
 
421 aa  74.3  2e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  31.54 
 
 
500 aa  75.1  2e-12  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3605  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.58 
 
 
429 aa  74.3  2e-12  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  26.44 
 
 
372 aa  74.3  2e-12  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3828  secretion protein HlyD  27.01 
 
 
430 aa  74.7  2e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.05 
 
 
432 aa  74.3  2e-12  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4067  RND family efflux transporter MFP subunit  31.25 
 
 
621 aa  75.1  2e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.23 
 
 
448 aa  73.9  3e-12  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  23.38 
 
 
368 aa  73.9  3e-12  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.55433e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  32.81 
 
 
417 aa  73.6  4e-12  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  31.09 
 
 
404 aa  73.2  6e-12  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0694  secretion protein HlyD  26.52 
 
 
417 aa  72.8  7e-12  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.459164  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  28.14 
 
 
366 aa  72.8  8e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12131  membrane fusion protein  23.12 
 
 
356 aa  72.8  8e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.502636 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.68 
 
 
420 aa  71.6  1e-11  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.72 
 
 
414 aa  72.4  1e-11  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  24.71 
 
 
368 aa  72.4  1e-11  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.58 
 
 
500 aa  71.2  2e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.88 
 
 
505 aa  71.2  2e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  25.86 
 
 
372 aa  71.2  2e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  29.15 
 
 
393 aa  71.2  2e-11  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  32.59 
 
 
430 aa  70.9  2e-11  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01077  HlyD family secretion protein  22.9 
 
 
376 aa  71.2  2e-11  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5358  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.67 
 
 
396 aa  70.9  3e-11  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0906  secretion protein HlyD  34.07 
 
 
449 aa  70.9  3e-11  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101628  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  32.12 
 
 
416 aa  70.5  3e-11  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  28.89 
 
 
405 aa  70.5  4e-11  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  4.67489e-05 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.27 
 
 
432 aa  70.5  4e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.95 
 
 
494 aa  70.5  4e-11  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  32.12 
 
 
416 aa  70.1  5e-11  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  4.90268e-06 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  32.12 
 
 
416 aa  70.1  5e-11  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.97 
 
 
390 aa  70.1  5e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  32.12 
 
 
416 aa  70.1  5e-11  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  34.56 
 
 
429 aa  69.7  6e-11  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.28 
 
 
487 aa  69.7  6e-11  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.702751  normal  0.0246521 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  31.62 
 
 
442 aa  69.7  6e-11  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3918  secretion protein HlyD  31.11 
 
 
433 aa  69.7  6e-11  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1966  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.28 
 
 
487 aa  69.7  7e-11  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  25.59 
 
 
373 aa  69.7  7e-11  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0913  hypothetical protein  28.28 
 
 
338 aa  69.7  7e-11  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.09 
 
 
663 aa  69.7  7e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0322  RND family efflux transporter MFP subunit  26.44 
 
 
353 aa  69.7  7e-11  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0619651 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0268  RND family efflux transporter MFP subunit  34.07 
 
 
587 aa  69.3  8e-11  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0795166 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  24.62 
 
 
429 aa  68.9  9e-11  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3185  secretion protein HlyD  29.17 
 
 
446 aa  68.9  1e-10  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08701  membrane fusion protein  23.99 
 
 
392 aa  67.8  2e-10  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3412  secretion protein HlyD  30.68 
 
 
443 aa  68.2  2e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0866166  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  30.72 
 
 
407 aa  68.2  2e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.76 
 
 
419 aa  68.6  2e-10  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.1 
 
 
448 aa  67.8  2e-10  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1726  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.84 
 
 
395 aa  67.8  2e-10  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  3.59698e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0882  hypothetical protein  27.95 
 
 
338 aa  68.2  2e-10  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>