More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1506 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  100 
 
 		 260 aa  528  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  96.92 
 
 		 260 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  77.04 
 
 		 263 aa  410  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  77.04 
 
 		 263 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  75.49 
 
 		 263 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  75.1 
 
 		 262 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  73.64 
 
 		 261 aa  391  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  74.9 
 
 		 264 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  68.73 
 
 		 261 aa  353  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  68.34 
 
 		 261 aa  352  4e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  61.13 
 
 		 261 aa  317  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  41.05 
 
 		 296 aa  191  8e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  39.42 
 
 		 269 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  38.65 
 
 		 269 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  37.16 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  49.33 
 
 		 331 aa  151  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  39.38 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  35.97 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  35.57 
 
 		 271 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  34.26 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  34.26 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  35.88 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  35.08 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  33.86 
 
 		 270 aa  135  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  37.07 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  34.27 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1973  OmpA/MotB domain-containing protein  32.35 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  52.38 
 
 		 344 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  49.12 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  51.43 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  51.43 
 
 		 344 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  50.5 
 
 		 407 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.78 
 
 		 248 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  49.52 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  53.33 
 
 		 327 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  49.52 
 
 		 344 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  49.52 
 
 		 344 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  49.52 
 
 		 344 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  49.52 
 
 		 345 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  51.43 
 
 		 351 aa  106  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  43.28 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  42.54 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  49.52 
 
 		 350 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  49.52 
 
 		 350 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  47.62 
 
 		 223 aa  102  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 205 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  46.61 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  44.04 
 
 		 236 aa  99.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  49.51 
 
 		 219 aa  99.4  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  36.36 
 
 		 224 aa  98.6  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  42.11 
 
 		 209 aa  97.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  40.58 
 
 		 229 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  44.17 
 
 		 218 aa  95.9  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 175 aa  96.3  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  42.65 
 
 		 498 aa  95.9  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  41.04 
 
 		 208 aa  95.9  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  44.36 
 
 		 225 aa  95.9  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  44.66 
 
 		 222 aa  95.9  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  44.2 
 
 		 229 aa  95.5  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  43.81 
 
 		 337 aa  95.1  9e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  46.43 
 
 		 189 aa  95.1  9e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  37.82 
 
 		 398 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  40.52 
 
 		 669 aa  95.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  44.95 
 
 		 219 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  45.63 
 
 		 231 aa  95.1  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  40.17 
 
 		 890 aa  94  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  40.71 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  42.25 
 
 		 228 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1039  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  43.14 
 
 		 183 aa  93.2  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.872127  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  47 
 
 		 335 aa  93.2  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  47.27 
 
 		 264 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  46.15 
 
 		 447 aa  92.8  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  53.01 
 
 		 219 aa  92.8  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  43.81 
 
 		 221 aa  92.8  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  42.98 
 
 		 429 aa  92.4  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  48.04 
 
 		 294 aa  92.4  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  46.67 
 
 		 239 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  42.75 
 
 		 228 aa  92  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  42.75 
 
 		 228 aa  92  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  47.12 
 
 		 226 aa  92  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  42.59 
 
 		 333 aa  91.3  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  41.79 
 
 		 228 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  43.27 
 
 		 187 aa  91.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1386  OmpA/MotB domain protein  42.73 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.848199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  41.44 
 
 		 242 aa  91.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  44.95 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  43.93 
 
 		 320 aa  90.5  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  38.89 
 
 		 360 aa  91.3  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  44.34 
 
 		 330 aa  90.9  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  44.76 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  41.9 
 
 		 337 aa  90.5  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  42.34 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  41.44 
 
 		 214 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  37.6 
 
 		 166 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 		 454 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  44.76 
 
 		 220 aa  90.1  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  41.28 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2160  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.05 
 
 		 157 aa  90.1  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000805861  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  42.2 
 
 		 218 aa  90.1  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  42.75 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>